Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

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Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.96■■□□□ 1.11
CTF3Q12748 NSR1YGR159C 1245 nt21.63■■□□□ 1.05
CTF3Q12748 NOP1YDL014W 984 nt21.4■■□□□ 1.02
CTF3Q12748 YKL036CYKL036C 393 nt19.93■□□□□ 0.78
CTF3Q12748 MDJ1YFL016C 1536 nt19.06■□□□□ 0.64
CTF3Q12748 Q0297Q0297 156 nt18.79■□□□□ 0.6
CTF3Q12748 SRX1YKL086W 384 nt18.71■□□□□ 0.59
CTF3Q12748 YJL027CYJL027C 417 nt18.66■□□□□ 0.58
CTF3Q12748 SCS3YGL126W 1143 nt18.25■□□□□ 0.51
CTF3Q12748 YCR051WYCR051W 669 nt17.79■□□□□ 0.44
CTF3Q12748 YOL085CYOL085C 342 nt17.27■□□□□ 0.36
CTF3Q12748 PKP1YIL042C 1185 nt17.02■□□□□ 0.32
CTF3Q12748 DBP2YNL112W 1641 nt16.94■□□□□ 0.3
CTF3Q12748 RPP1BYDL130W 321 nt16.88■□□□□ 0.29
CTF3Q12748 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.8■□□□□ 0.28
CTF3Q12748 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.8■□□□□ 0.28
CTF3Q12748 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.8■□□□□ 0.28
CTF3Q12748 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.8■□□□□ 0.28
CTF3Q12748 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.8■□□□□ 0.28
CTF3Q12748 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.8■□□□□ 0.28
CTF3Q12748 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.8■□□□□ 0.28
CTF3Q12748 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.8■□□□□ 0.28
CTF3Q12748 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.8■□□□□ 0.28
CTF3Q12748 CCC1YLR220W 969 nt16.68■□□□□ 0.26
CTF3Q12748 ATS1YAL020C 1002 nt16.38■□□□□ 0.21
CTF3Q12748 SCJ1YMR214W 1134 nt16.36■□□□□ 0.21
CTF3Q12748 YBR190WYBR190W 312 nt16.17■□□□□ 0.18
CTF3Q12748 PET122YER153C 765 nt16.11■□□□□ 0.17
CTF3Q12748 SCR1SCR1 522 nt15.98■□□□□ 0.15
CTF3Q12748 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.97■□□□□ 0.15
CTF3Q12748 RVS167YDR388W 1449 nt15.95■□□□□ 0.14
CTF3Q12748 RTC3YHR087W 336 nt15.86■□□□□ 0.13
CTF3Q12748 RRN5YLR141W 1092 nt15.68■□□□□ 0.1
CTF3Q12748 SHR5YOL110W 714 nt15.44■□□□□ 0.06
CTF3Q12748 YDJ1YNL064C 1230 nt15.42■□□□□ 0.06
CTF3Q12748 RSB1YOR049C 1065 nt15.41■□□□□ 0.06
CTF3Q12748 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.37■□□□□ 0.05
CTF3Q12748 PST2YDR032C 597 nt15.13■□□□□ 0.01
CTF3Q12748 GAR1YHR089C 618 nt15.09■□□□□ 0.01
CTF3Q12748 DEP1YAL013W 1218 nt14.99□□□□□ -0.01
CTF3Q12748 URN1YPR152C 1398 nt14.91□□□□□ -0.02
CTF3Q12748 YNL208WYNL208W 600 nt14.73□□□□□ -0.05
CTF3Q12748 RPN10YHR200W 807 nt14.7□□□□□ -0.06
CTF3Q12748 OPI9YLR338W 858 nt14.64□□□□□ -0.07
CTF3Q12748 YKL097CYKL097C 411 nt14.63□□□□□ -0.07
CTF3Q12748 TIR1YER011W 765 nt14.56□□□□□ -0.08
CTF3Q12748 PUT4YOR348C 1884 nt14.56□□□□□ -0.08
CTF3Q12748 SAH1YER043C 1350 nt14.52□□□□□ -0.08
CTF3Q12748 SHU1YHL006C 453 nt14.48□□□□□ -0.09
CTF3Q12748 ARE1YCR048W 1833 nt14.36□□□□□ -0.11
CTF3Q12748 SSA1YAL005C 1929 nt14.36□□□□□ -0.11
CTF3Q12748 YJR018WYJR018W 363 nt14.23□□□□□ -0.13
CTF3Q12748 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.23□□□□□ -0.13
CTF3Q12748 PUN1YLR414C 792 nt14.21□□□□□ -0.13
CTF3Q12748 SRB2YHR041C 633 nt14.17□□□□□ -0.14
CTF3Q12748 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.17□□□□□ -0.14
CTF3Q12748 POA1YBR022W 534 nt14.14□□□□□ -0.15
CTF3Q12748 YJR120WYJR120W 351 nt14.05□□□□□ -0.16
CTF3Q12748 PTC2YER089C 1395 nt14.03□□□□□ -0.16
CTF3Q12748 YOR139CYOR139C 393 nt14.02□□□□□ -0.17
CTF3Q12748 RPP2BYDR382W 333 nt13.98□□□□□ -0.17
CTF3Q12748 WWM1YFL010C 636 nt13.97□□□□□ -0.17
CTF3Q12748 YGR021WYGR021W 873 nt13.9□□□□□ -0.18
CTF3Q12748 BUD23YCR047C 828 nt13.88□□□□□ -0.19
CTF3Q12748 HOM6YJR139C 1080 nt13.88□□□□□ -0.19
CTF3Q12748 MNP1YGL068W 585 nt13.87□□□□□ -0.19
CTF3Q12748 NPL3YDR432W 1245 nt13.86□□□□□ -0.19
CTF3Q12748 NAB2YGL122C 1578 nt13.81□□□□□ -0.2
CTF3Q12748 BSC6YOL137W 1494 nt13.77□□□□□ -0.21
CTF3Q12748 BDH2YAL061W 1254 nt13.74□□□□□ -0.21
CTF3Q12748 SSA3YBL075C 1950 nt13.71□□□□□ -0.21
CTF3Q12748 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.71□□□□□ -0.21
CTF3Q12748 INM2YDR287W 879 nt13.69□□□□□ -0.22
CTF3Q12748 RKM5YLR137W 1104 nt13.68□□□□□ -0.22
CTF3Q12748 FPR4YLR449W 1179 nt13.67□□□□□ -0.22
CTF3Q12748 YOL037CYOL037C 354 nt13.67□□□□□ -0.22
CTF3Q12748 DAL1YIR027C 1383 nt13.66□□□□□ -0.22
CTF3Q12748 FIS1YIL065C 468 nt13.62□□□□□ -0.23
CTF3Q12748 YBL100CYBL100C 315 nt13.6□□□□□ -0.23
CTF3Q12748 LSM3YLR438C-A 270 nt13.59□□□□□ -0.23
CTF3Q12748 PHO4YFR034C 939 nt13.53□□□□□ -0.24
CTF3Q12748 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.46□□□□□ -0.25
CTF3Q12748 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.46□□□□□ -0.25
CTF3Q12748 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.46□□□□□ -0.25
CTF3Q12748 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.46□□□□□ -0.25
CTF3Q12748 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.46□□□□□ -0.25
CTF3Q12748 TRM9YML014W 840 nt13.46□□□□□ -0.25
CTF3Q12748 FUN26YAL022C 1554 nt13.45□□□□□ -0.26
CTF3Q12748 YLR281CYLR281C 468 nt13.37□□□□□ -0.27
CTF3Q12748 PUS2YGL063W 1113 nt13.32□□□□□ -0.28
CTF3Q12748 CCT6YDR188W 1641 nt13.31□□□□□ -0.28
CTF3Q12748 WHI5YOR083W 888 nt13.3□□□□□ -0.28
CTF3Q12748 ALF1YNL148C 765 nt13.21□□□□□ -0.29
CTF3Q12748 YPS1YLR120C 1710 nt13.2□□□□□ -0.3
CTF3Q12748 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.16□□□□□ -0.3
CTF3Q12748 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.16□□□□□ -0.3
CTF3Q12748 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.14□□□□□ -0.31
CTF3Q12748 YDR095CYDR095C 411 nt13.13□□□□□ -0.31
CTF3Q12748 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.05□□□□□ -0.32
CTF3Q12748 YPR011CYPR011C 981 nt13.04□□□□□ -0.32
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