Protein–RNA interactions for Protein: Q12008

GPM2, Phosphoglycerate mutase 2, yeastyeast

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GPM2Q12008 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.64■■□□□ 1.05
GPM2Q12008 NSR1YGR159C 1245 nt21.34■■□□□ 1.01
GPM2Q12008 NOP1YDL014W 984 nt21.13■□□□□ 0.97
GPM2Q12008 YKL036CYKL036C 393 nt19.66■□□□□ 0.74
GPM2Q12008 MDJ1YFL016C 1536 nt18.76■□□□□ 0.59
GPM2Q12008 Q0297Q0297 156 nt18.54■□□□□ 0.56
GPM2Q12008 SRX1YKL086W 384 nt18.45■□□□□ 0.54
GPM2Q12008 YJL027CYJL027C 417 nt18.4■□□□□ 0.54
GPM2Q12008 SCS3YGL126W 1143 nt17.98■□□□□ 0.47
GPM2Q12008 YCR051WYCR051W 669 nt17.53■□□□□ 0.4
GPM2Q12008 YOL085CYOL085C 342 nt17.02■□□□□ 0.32
GPM2Q12008 PKP1YIL042C 1185 nt16.75■□□□□ 0.27
GPM2Q12008 DBP2YNL112W 1641 nt16.67■□□□□ 0.26
GPM2Q12008 RPP1BYDL130W 321 nt16.64■□□□□ 0.25
GPM2Q12008 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.56■□□□□ 0.24
GPM2Q12008 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.56■□□□□ 0.24
GPM2Q12008 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.56■□□□□ 0.24
GPM2Q12008 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.56■□□□□ 0.24
GPM2Q12008 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.56■□□□□ 0.24
GPM2Q12008 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.56■□□□□ 0.24
GPM2Q12008 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.56■□□□□ 0.24
GPM2Q12008 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.56■□□□□ 0.24
GPM2Q12008 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.56■□□□□ 0.24
GPM2Q12008 CCC1YLR220W 969 nt16.42■□□□□ 0.22
GPM2Q12008 SCJ1YMR214W 1134 nt16.17■□□□□ 0.18
GPM2Q12008 ATS1YAL020C 1002 nt16.15■□□□□ 0.18
GPM2Q12008 YBR190WYBR190W 312 nt15.95■□□□□ 0.14
GPM2Q12008 PET122YER153C 765 nt15.87■□□□□ 0.13
GPM2Q12008 SCR1SCR1 522 nt15.78■□□□□ 0.12
GPM2Q12008 RVS167YDR388W 1449 nt15.75■□□□□ 0.11
GPM2Q12008 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.74■□□□□ 0.11
GPM2Q12008 RTC3YHR087W 336 nt15.63■□□□□ 0.09
GPM2Q12008 RRN5YLR141W 1092 nt15.44■□□□□ 0.06
GPM2Q12008 SHR5YOL110W 714 nt15.23■□□□□ 0.03
GPM2Q12008 YDJ1YNL064C 1230 nt15.22■□□□□ 0.03
GPM2Q12008 RSB1YOR049C 1065 nt15.19■□□□□ 0.02
GPM2Q12008 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.14■□□□□ 0.01
GPM2Q12008 PST2YDR032C 597 nt14.92□□□□□ -0.02
GPM2Q12008 GAR1YHR089C 618 nt14.86□□□□□ -0.03
GPM2Q12008 DEP1YAL013W 1218 nt14.74□□□□□ -0.05
GPM2Q12008 URN1YPR152C 1398 nt14.69□□□□□ -0.06
GPM2Q12008 YNL208WYNL208W 600 nt14.54□□□□□ -0.08
GPM2Q12008 RPN10YHR200W 807 nt14.52□□□□□ -0.09
GPM2Q12008 YKL097CYKL097C 411 nt14.44□□□□□ -0.1
GPM2Q12008 OPI9YLR338W 858 nt14.43□□□□□ -0.1
GPM2Q12008 TIR1YER011W 765 nt14.35□□□□□ -0.11
GPM2Q12008 PUT4YOR348C 1884 nt14.31□□□□□ -0.12
GPM2Q12008 SAH1YER043C 1350 nt14.29□□□□□ -0.12
GPM2Q12008 SHU1YHL006C 453 nt14.26□□□□□ -0.13
GPM2Q12008 SSA1YAL005C 1929 nt14.13□□□□□ -0.15
GPM2Q12008 ARE1YCR048W 1833 nt14.13□□□□□ -0.15
GPM2Q12008 YJR018WYJR018W 363 nt14.02□□□□□ -0.17
GPM2Q12008 PUN1YLR414C 792 nt14.02□□□□□ -0.17
GPM2Q12008 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14□□□□□ -0.17
GPM2Q12008 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.95□□□□□ -0.18
GPM2Q12008 SRB2YHR041C 633 nt13.91□□□□□ -0.18
GPM2Q12008 POA1YBR022W 534 nt13.91□□□□□ -0.18
GPM2Q12008 YJR120WYJR120W 351 nt13.82□□□□□ -0.2
GPM2Q12008 PTC2YER089C 1395 nt13.82□□□□□ -0.2
GPM2Q12008 RPP2BYDR382W 333 nt13.81□□□□□ -0.2
GPM2Q12008 YOR139CYOR139C 393 nt13.81□□□□□ -0.2
GPM2Q12008 WWM1YFL010C 636 nt13.75□□□□□ -0.21
GPM2Q12008 YGR021WYGR021W 873 nt13.74□□□□□ -0.21
GPM2Q12008 HOM6YJR139C 1080 nt13.69□□□□□ -0.22
GPM2Q12008 NPL3YDR432W 1245 nt13.67□□□□□ -0.22
GPM2Q12008 BUD23YCR047C 828 nt13.66□□□□□ -0.22
GPM2Q12008 MNP1YGL068W 585 nt13.65□□□□□ -0.22
GPM2Q12008 NAB2YGL122C 1578 nt13.6□□□□□ -0.23
GPM2Q12008 BSC6YOL137W 1494 nt13.55□□□□□ -0.24
GPM2Q12008 BDH2YAL061W 1254 nt13.55□□□□□ -0.24
GPM2Q12008 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.53□□□□□ -0.24
GPM2Q12008 INM2YDR287W 879 nt13.51□□□□□ -0.25
GPM2Q12008 YOL037CYOL037C 354 nt13.5□□□□□ -0.25
GPM2Q12008 RKM5YLR137W 1104 nt13.49□□□□□ -0.25
GPM2Q12008 SSA3YBL075C 1950 nt13.48□□□□□ -0.25
GPM2Q12008 DAL1YIR027C 1383 nt13.46□□□□□ -0.25
GPM2Q12008 FPR4YLR449W 1179 nt13.46□□□□□ -0.25
GPM2Q12008 FIS1YIL065C 468 nt13.41□□□□□ -0.26
GPM2Q12008 LSM3YLR438C-A 270 nt13.41□□□□□ -0.26
GPM2Q12008 YBL100CYBL100C 315 nt13.41□□□□□ -0.26
GPM2Q12008 PHO4YFR034C 939 nt13.33□□□□□ -0.28
GPM2Q12008 TRM9YML014W 840 nt13.28□□□□□ -0.28
GPM2Q12008 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.27□□□□□ -0.29
GPM2Q12008 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.27□□□□□ -0.29
GPM2Q12008 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.27□□□□□ -0.29
GPM2Q12008 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.27□□□□□ -0.29
GPM2Q12008 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.27□□□□□ -0.29
GPM2Q12008 FUN26YAL022C 1554 nt13.25□□□□□ -0.29
GPM2Q12008 YLR281CYLR281C 468 nt13.17□□□□□ -0.3
GPM2Q12008 PUS2YGL063W 1113 nt13.13□□□□□ -0.31
GPM2Q12008 CCT6YDR188W 1641 nt13.11□□□□□ -0.31
GPM2Q12008 WHI5YOR083W 888 nt13.11□□□□□ -0.31
GPM2Q12008 ALF1YNL148C 765 nt13.03□□□□□ -0.32
GPM2Q12008 SUF2tP(AGG)C 72 nt13□□□□□ -0.33
GPM2Q12008 SUF10tP(AGG)N 72 nt13□□□□□ -0.33
GPM2Q12008 YPS1YLR120C 1710 nt12.99□□□□□ -0.33
GPM2Q12008 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.95□□□□□ -0.34
GPM2Q12008 YDR095CYDR095C 411 nt12.94□□□□□ -0.34
GPM2Q12008 SPT5YML010W 3192 nt12.87□□□□□ -0.35
GPM2Q12008 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.86□□□□□ -0.35
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