Protein–RNA interactions for Protein: Q12254

SVS1, Protein SVS1, yeastyeast

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SVS1Q12254 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.23■□□□□ 0.99
SVS1Q12254 NSR1YGR159C 1245 nt20.99■□□□□ 0.95
SVS1Q12254 NOP1YDL014W 984 nt20.73■□□□□ 0.91
SVS1Q12254 YKL036CYKL036C 393 nt19.24■□□□□ 0.67
SVS1Q12254 MDJ1YFL016C 1536 nt18.47■□□□□ 0.55
SVS1Q12254 Q0297Q0297 156 nt18.16■□□□□ 0.5
SVS1Q12254 SRX1YKL086W 384 nt18.09■□□□□ 0.49
SVS1Q12254 YJL027CYJL027C 417 nt17.98■□□□□ 0.47
SVS1Q12254 SCS3YGL126W 1143 nt17.54■□□□□ 0.4
SVS1Q12254 YCR051WYCR051W 669 nt17.18■□□□□ 0.34
SVS1Q12254 YOL085CYOL085C 342 nt16.63■□□□□ 0.25
SVS1Q12254 DBP2YNL112W 1641 nt16.37■□□□□ 0.21
SVS1Q12254 PKP1YIL042C 1185 nt16.34■□□□□ 0.21
SVS1Q12254 RPP1BYDL130W 321 nt16.3■□□□□ 0.2
SVS1Q12254 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.26■□□□□ 0.19
SVS1Q12254 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.26■□□□□ 0.19
SVS1Q12254 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.26■□□□□ 0.19
SVS1Q12254 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.26■□□□□ 0.19
SVS1Q12254 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.26■□□□□ 0.19
SVS1Q12254 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.26■□□□□ 0.19
SVS1Q12254 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.26■□□□□ 0.19
SVS1Q12254 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.26■□□□□ 0.19
SVS1Q12254 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.26■□□□□ 0.19
SVS1Q12254 CCC1YLR220W 969 nt16.1■□□□□ 0.17
SVS1Q12254 SCJ1YMR214W 1134 nt15.75■□□□□ 0.11
SVS1Q12254 YBR190WYBR190W 312 nt15.75■□□□□ 0.11
SVS1Q12254 ATS1YAL020C 1002 nt15.73■□□□□ 0.11
SVS1Q12254 PET122YER153C 765 nt15.53■□□□□ 0.08
SVS1Q12254 RVS167YDR388W 1449 nt15.52■□□□□ 0.08
SVS1Q12254 SCR1SCR1 522 nt15.46■□□□□ 0.07
SVS1Q12254 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.42■□□□□ 0.06
SVS1Q12254 RTC3YHR087W 336 nt15.41■□□□□ 0.06
SVS1Q12254 RRN5YLR141W 1092 nt15.1■□□□□ 0.01
SVS1Q12254 SHR5YOL110W 714 nt14.97□□□□□ -0.01
SVS1Q12254 YDJ1YNL064C 1230 nt14.94□□□□□ -0.02
SVS1Q12254 RSB1YOR049C 1065 nt14.85□□□□□ -0.03
SVS1Q12254 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.8□□□□□ -0.04
SVS1Q12254 GAR1YHR089C 618 nt14.57□□□□□ -0.08
SVS1Q12254 PST2YDR032C 597 nt14.54□□□□□ -0.08
SVS1Q12254 DEP1YAL013W 1218 nt14.48□□□□□ -0.09
SVS1Q12254 URN1YPR152C 1398 nt14.47□□□□□ -0.09
SVS1Q12254 RPN10YHR200W 807 nt14.34□□□□□ -0.11
SVS1Q12254 YNL208WYNL208W 600 nt14.3□□□□□ -0.12
SVS1Q12254 OPI9YLR338W 858 nt14.23□□□□□ -0.13
SVS1Q12254 PUT4YOR348C 1884 nt14.14□□□□□ -0.15
SVS1Q12254 SAH1YER043C 1350 nt14.09□□□□□ -0.15
SVS1Q12254 TIR1YER011W 765 nt14.08□□□□□ -0.16
SVS1Q12254 YKL097CYKL097C 411 nt14.06□□□□□ -0.16
SVS1Q12254 ARE1YCR048W 1833 nt13.94□□□□□ -0.18
SVS1Q12254 SHU1YHL006C 453 nt13.91□□□□□ -0.18
SVS1Q12254 SSA3YBL075C 1950 nt13.91□□□□□ -0.18
SVS1Q12254 SSA1YAL005C 1929 nt13.86□□□□□ -0.19
SVS1Q12254 PUN1YLR414C 792 nt13.84□□□□□ -0.19
SVS1Q12254 YJR018WYJR018W 363 nt13.82□□□□□ -0.2
SVS1Q12254 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.78□□□□□ -0.2
SVS1Q12254 POA1YBR022W 534 nt13.73□□□□□ -0.21
SVS1Q12254 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.64□□□□□ -0.23
SVS1Q12254 PTC2YER089C 1395 nt13.61□□□□□ -0.23
SVS1Q12254 RPP2BYDR382W 333 nt13.61□□□□□ -0.23
SVS1Q12254 SRB2YHR041C 633 nt13.6□□□□□ -0.23
SVS1Q12254 YJR120WYJR120W 351 nt13.57□□□□□ -0.24
SVS1Q12254 BUD23YCR047C 828 nt13.49□□□□□ -0.25
SVS1Q12254 YGR021WYGR021W 873 nt13.48□□□□□ -0.25
SVS1Q12254 WWM1YFL010C 636 nt13.47□□□□□ -0.25
SVS1Q12254 NAB2YGL122C 1578 nt13.44□□□□□ -0.26
SVS1Q12254 YOR139CYOR139C 393 nt13.43□□□□□ -0.26
SVS1Q12254 BSC6YOL137W 1494 nt13.4□□□□□ -0.26
SVS1Q12254 HOM6YJR139C 1080 nt13.39□□□□□ -0.27
SVS1Q12254 NPL3YDR432W 1245 nt13.34□□□□□ -0.27
SVS1Q12254 MNP1YGL068W 585 nt13.34□□□□□ -0.27
SVS1Q12254 BDH2YAL061W 1254 nt13.34□□□□□ -0.27
SVS1Q12254 INM2YDR287W 879 nt13.33□□□□□ -0.28
SVS1Q12254 DAL1YIR027C 1383 nt13.29□□□□□ -0.28
SVS1Q12254 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.28□□□□□ -0.28
SVS1Q12254 FPR4YLR449W 1179 nt13.26□□□□□ -0.29
SVS1Q12254 FIS1YIL065C 468 nt13.23□□□□□ -0.29
SVS1Q12254 YOL037CYOL037C 354 nt13.23□□□□□ -0.29
SVS1Q12254 RKM5YLR137W 1104 nt13.21□□□□□ -0.29
SVS1Q12254 YBL100CYBL100C 315 nt13.21□□□□□ -0.29
SVS1Q12254 LSM3YLR438C-A 270 nt13.2□□□□□ -0.3
SVS1Q12254 PHO4YFR034C 939 nt13.15□□□□□ -0.3
SVS1Q12254 TRM9YML014W 840 nt13.08□□□□□ -0.32
SVS1Q12254 FUN26YAL022C 1554 nt13.04□□□□□ -0.32
SVS1Q12254 CCT6YDR188W 1641 nt12.91□□□□□ -0.34
SVS1Q12254 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.91□□□□□ -0.34
SVS1Q12254 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.91□□□□□ -0.34
SVS1Q12254 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.91□□□□□ -0.34
SVS1Q12254 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.91□□□□□ -0.34
SVS1Q12254 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.91□□□□□ -0.34
SVS1Q12254 YLR281CYLR281C 468 nt12.87□□□□□ -0.35
SVS1Q12254 ALF1YNL148C 765 nt12.87□□□□□ -0.35
SVS1Q12254 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.84□□□□□ -0.35
SVS1Q12254 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.84□□□□□ -0.35
SVS1Q12254 YPS1YLR120C 1710 nt12.83□□□□□ -0.36
SVS1Q12254 WHI5YOR083W 888 nt12.82□□□□□ -0.36
SVS1Q12254 PUS2YGL063W 1113 nt12.8□□□□□ -0.36
SVS1Q12254 YDR095CYDR095C 411 nt12.79□□□□□ -0.36
SVS1Q12254 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.71□□□□□ -0.37
SVS1Q12254 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.7□□□□□ -0.38
SVS1Q12254 Q0182Q0182 405 nt12.66□□□□□ -0.38
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