Protein–RNA interactions for Protein: P53187

HOP2, Homologous-pairing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HOP2P53187 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.63■■□□□ 1.05
HOP2P53187 NSR1YGR159C 1245 nt21.51■■□□□ 1.03
HOP2P53187 NOP1YDL014W 984 nt21.05■□□□□ 0.96
HOP2P53187 YKL036CYKL036C 393 nt19.36■□□□□ 0.69
HOP2P53187 MDJ1YFL016C 1536 nt19.1■□□□□ 0.65
HOP2P53187 Q0297Q0297 156 nt18.36■□□□□ 0.53
HOP2P53187 SRX1YKL086W 384 nt18.34■□□□□ 0.53
HOP2P53187 YJL027CYJL027C 417 nt18.08■□□□□ 0.48
HOP2P53187 SCS3YGL126W 1143 nt17.57■□□□□ 0.4
HOP2P53187 YCR051WYCR051W 669 nt17.43■□□□□ 0.38
HOP2P53187 DBP2YNL112W 1641 nt16.85■□□□□ 0.29
HOP2P53187 YOL085CYOL085C 342 nt16.74■□□□□ 0.27
HOP2P53187 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.58■□□□□ 0.24
HOP2P53187 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.58■□□□□ 0.24
HOP2P53187 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.58■□□□□ 0.24
HOP2P53187 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.58■□□□□ 0.24
HOP2P53187 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.58■□□□□ 0.24
HOP2P53187 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.58■□□□□ 0.24
HOP2P53187 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.58■□□□□ 0.24
HOP2P53187 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.58■□□□□ 0.24
HOP2P53187 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.58■□□□□ 0.24
HOP2P53187 PKP1YIL042C 1185 nt16.49■□□□□ 0.23
HOP2P53187 RPP1BYDL130W 321 nt16.48■□□□□ 0.23
HOP2P53187 CCC1YLR220W 969 nt16.46■□□□□ 0.23
HOP2P53187 YBR190WYBR190W 312 nt16.32■□□□□ 0.2
HOP2P53187 RTC3YHR087W 336 nt16■□□□□ 0.15
HOP2P53187 RVS167YDR388W 1449 nt15.95■□□□□ 0.14
HOP2P53187 SCJ1YMR214W 1134 nt15.75■□□□□ 0.11
HOP2P53187 PET122YER153C 765 nt15.72■□□□□ 0.11
HOP2P53187 ATS1YAL020C 1002 nt15.72■□□□□ 0.11
HOP2P53187 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.69■□□□□ 0.1
HOP2P53187 SCR1SCR1 522 nt15.63■□□□□ 0.09
HOP2P53187 SHR5YOL110W 714 nt15.34■□□□□ 0.05
HOP2P53187 RRN5YLR141W 1092 nt15.29■□□□□ 0.04
HOP2P53187 SSA3YBL075C 1950 nt15.2■□□□□ 0.02
HOP2P53187 YDJ1YNL064C 1230 nt15.18■□□□□ 0.02
HOP2P53187 RSB1YOR049C 1065 nt14.99□□□□□ -0.01
HOP2P53187 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.98□□□□□ -0.01
HOP2P53187 URN1YPR152C 1398 nt14.92□□□□□ -0.02
HOP2P53187 DEP1YAL013W 1218 nt14.9□□□□□ -0.02
HOP2P53187 GAR1YHR089C 618 nt14.87□□□□□ -0.03
HOP2P53187 PUT4YOR348C 1884 nt14.8□□□□□ -0.04
HOP2P53187 RPN10YHR200W 807 nt14.76□□□□□ -0.05
HOP2P53187 OPI9YLR338W 858 nt14.71□□□□□ -0.05
HOP2P53187 YNL208WYNL208W 600 nt14.69□□□□□ -0.06
HOP2P53187 SAH1YER043C 1350 nt14.61□□□□□ -0.07
HOP2P53187 PST2YDR032C 597 nt14.54□□□□□ -0.08
HOP2P53187 ARE1YCR048W 1833 nt14.52□□□□□ -0.08
HOP2P53187 TIR1YER011W 765 nt14.36□□□□□ -0.11
HOP2P53187 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.36□□□□□ -0.11
HOP2P53187 POA1YBR022W 534 nt14.35□□□□□ -0.11
HOP2P53187 PUN1YLR414C 792 nt14.31□□□□□ -0.12
HOP2P53187 YJR018WYJR018W 363 nt14.25□□□□□ -0.13
HOP2P53187 SSA1YAL005C 1929 nt14.17□□□□□ -0.14
HOP2P53187 PTC2YER089C 1395 nt14.12□□□□□ -0.15
HOP2P53187 BUD23YCR047C 828 nt14.06□□□□□ -0.16
HOP2P53187 BSC6YOL137W 1494 nt14.03□□□□□ -0.16
HOP2P53187 RPP2BYDR382W 333 nt14□□□□□ -0.17
HOP2P53187 YKL097CYKL097C 411 nt13.99□□□□□ -0.17
HOP2P53187 NAB2YGL122C 1578 nt13.96□□□□□ -0.18
HOP2P53187 SHU1YHL006C 453 nt13.95□□□□□ -0.18
HOP2P53187 YJR120WYJR120W 351 nt13.92□□□□□ -0.18
HOP2P53187 SRB2YHR041C 633 nt13.86□□□□□ -0.19
HOP2P53187 DAL1YIR027C 1383 nt13.77□□□□□ -0.21
HOP2P53187 INM2YDR287W 879 nt13.76□□□□□ -0.21
HOP2P53187 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.76□□□□□ -0.21
HOP2P53187 FPR4YLR449W 1179 nt13.75□□□□□ -0.21
HOP2P53187 SPT5YML010W 3192 nt13.71□□□□□ -0.21
HOP2P53187 WWM1YFL010C 636 nt13.7□□□□□ -0.22
HOP2P53187 FIS1YIL065C 468 nt13.69□□□□□ -0.22
HOP2P53187 BDH2YAL061W 1254 nt13.67□□□□□ -0.22
HOP2P53187 YGR021WYGR021W 873 nt13.66□□□□□ -0.22
HOP2P53187 YBL100CYBL100C 315 nt13.61□□□□□ -0.23
HOP2P53187 PHO4YFR034C 939 nt13.6□□□□□ -0.23
HOP2P53187 HOM6YJR139C 1080 nt13.56□□□□□ -0.24
HOP2P53187 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.51□□□□□ -0.25
HOP2P53187 LSM3YLR438C-A 270 nt13.51□□□□□ -0.25
HOP2P53187 SSA4YER103W 1929 nt13.49□□□□□ -0.25
HOP2P53187 MNP1YGL068W 585 nt13.48□□□□□ -0.25
HOP2P53187 TRM9YML014W 840 nt13.45□□□□□ -0.26
HOP2P53187 FUN26YAL022C 1554 nt13.44□□□□□ -0.26
HOP2P53187 RKM5YLR137W 1104 nt13.38□□□□□ -0.27
HOP2P53187 YOR139CYOR139C 393 nt13.37□□□□□ -0.27
HOP2P53187 NPL3YDR432W 1245 nt13.35□□□□□ -0.27
HOP2P53187 YPS1YLR120C 1710 nt13.35□□□□□ -0.27
HOP2P53187 ALF1YNL148C 765 nt13.29□□□□□ -0.28
HOP2P53187 YOL037CYOL037C 354 nt13.29□□□□□ -0.28
HOP2P53187 CCT6YDR188W 1641 nt13.27□□□□□ -0.29
HOP2P53187 YDR095CYDR095C 411 nt13.25□□□□□ -0.29
HOP2P53187 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.24□□□□□ -0.29
HOP2P53187 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.21□□□□□ -0.29
HOP2P53187 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.21□□□□□ -0.29
HOP2P53187 MEP2YNL142W 1500 nt13.18□□□□□ -0.3
HOP2P53187 BDF1YLR399C 2061 nt13.06□□□□□ -0.32
HOP2P53187 SIS1YNL007C 1059 nt13.03□□□□□ -0.32
HOP2P53187 RPP2AYOL039W 321 nt13.03□□□□□ -0.32
HOP2P53187 YLR281CYLR281C 468 nt12.96□□□□□ -0.33
HOP2P53187 DCW1YKL046C 1350 nt12.95□□□□□ -0.34
HOP2P53187 WHI5YOR083W 888 nt12.93□□□□□ -0.34
HOP2P53187 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.5 ms