Protein–RNA interactions for Protein: P35197

GCS1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein GCS1, yeastyeast

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCS1P35197 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.75■■□□□ 1.07
GCS1P35197 NSR1YGR159C 1245 nt21.29■■□□□ 1
GCS1P35197 NOP1YDL014W 984 nt21.25■□□□□ 0.99
GCS1P35197 YKL036CYKL036C 393 nt20.02■□□□□ 0.8
GCS1P35197 Q0297Q0297 156 nt18.81■□□□□ 0.6
GCS1P35197 YJL027CYJL027C 417 nt18.75■□□□□ 0.59
GCS1P35197 SRX1YKL086W 384 nt18.64■□□□□ 0.57
GCS1P35197 MDJ1YFL016C 1536 nt18.58■□□□□ 0.56
GCS1P35197 SCS3YGL126W 1143 nt18.47■□□□□ 0.55
GCS1P35197 YCR051WYCR051W 669 nt17.68■□□□□ 0.42
GCS1P35197 YOL085CYOL085C 342 nt17.37■□□□□ 0.37
GCS1P35197 PKP1YIL042C 1185 nt17.07■□□□□ 0.32
GCS1P35197 RPP1BYDL130W 321 nt16.86■□□□□ 0.29
GCS1P35197 SCJ1YMR214W 1134 nt16.8■□□□□ 0.28
GCS1P35197 DBP2YNL112W 1641 nt16.65■□□□□ 0.26
GCS1P35197 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.64■□□□□ 0.25
GCS1P35197 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.64■□□□□ 0.25
GCS1P35197 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.64■□□□□ 0.25
GCS1P35197 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.64■□□□□ 0.25
GCS1P35197 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.64■□□□□ 0.25
GCS1P35197 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.64■□□□□ 0.25
GCS1P35197 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.64■□□□□ 0.25
GCS1P35197 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.64■□□□□ 0.25
GCS1P35197 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.64■□□□□ 0.25
GCS1P35197 ATS1YAL020C 1002 nt16.61■□□□□ 0.25
GCS1P35197 CCC1YLR220W 969 nt16.45■□□□□ 0.22
GCS1P35197 PET122YER153C 765 nt16.09■□□□□ 0.17
GCS1P35197 SCR1SCR1 522 nt15.94■□□□□ 0.14
GCS1P35197 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.86■□□□□ 0.13
GCS1P35197 YBR190WYBR190W 312 nt15.7■□□□□ 0.1
GCS1P35197 RRN5YLR141W 1092 nt15.67■□□□□ 0.1
GCS1P35197 RVS167YDR388W 1449 nt15.59■□□□□ 0.09
GCS1P35197 RSB1YOR049C 1065 nt15.41■□□□□ 0.06
GCS1P35197 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.37■□□□□ 0.05
GCS1P35197 PST2YDR032C 597 nt15.35■□□□□ 0.05
GCS1P35197 RTC3YHR087W 336 nt15.34■□□□□ 0.05
GCS1P35197 YDJ1YNL064C 1230 nt15.33■□□□□ 0.04
GCS1P35197 SHR5YOL110W 714 nt15.19■□□□□ 0.02
GCS1P35197 GAR1YHR089C 618 nt14.92□□□□□ -0.02
GCS1P35197 YKL097CYKL097C 411 nt14.89□□□□□ -0.03
GCS1P35197 DEP1YAL013W 1218 nt14.66□□□□□ -0.06
GCS1P35197 SHU1YHL006C 453 nt14.64□□□□□ -0.07
GCS1P35197 URN1YPR152C 1398 nt14.54□□□□□ -0.08
GCS1P35197 YNL208WYNL208W 600 nt14.43□□□□□ -0.1
GCS1P35197 TIR1YER011W 765 nt14.42□□□□□ -0.1
GCS1P35197 RPN10YHR200W 807 nt14.33□□□□□ -0.12
GCS1P35197 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.31□□□□□ -0.12
GCS1P35197 YOR139CYOR139C 393 nt14.31□□□□□ -0.12
GCS1P35197 OPI9YLR338W 858 nt14.26□□□□□ -0.13
GCS1P35197 SSA1YAL005C 1929 nt14.21□□□□□ -0.14
GCS1P35197 SRB2YHR041C 633 nt14.12□□□□□ -0.15
GCS1P35197 SAH1YER043C 1350 nt14.09□□□□□ -0.15
GCS1P35197 PUT4YOR348C 1884 nt14.01□□□□□ -0.17
GCS1P35197 NPL3YDR432W 1245 nt13.99□□□□□ -0.17
GCS1P35197 ARE1YCR048W 1833 nt13.9□□□□□ -0.18
GCS1P35197 YJR018WYJR018W 363 nt13.89□□□□□ -0.19
GCS1P35197 WWM1YFL010C 636 nt13.88□□□□□ -0.19
GCS1P35197 MNP1YGL068W 585 nt13.88□□□□□ -0.19
GCS1P35197 HOM6YJR139C 1080 nt13.88□□□□□ -0.19
GCS1P35197 YJR120WYJR120W 351 nt13.87□□□□□ -0.19
GCS1P35197 YGR021WYGR021W 873 nt13.84□□□□□ -0.19
GCS1P35197 PUN1YLR414C 792 nt13.81□□□□□ -0.2
GCS1P35197 YOL037CYOL037C 354 nt13.74□□□□□ -0.21
GCS1P35197 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.71□□□□□ -0.21
GCS1P35197 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.71□□□□□ -0.21
GCS1P35197 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.71□□□□□ -0.21
GCS1P35197 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.71□□□□□ -0.21
GCS1P35197 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.71□□□□□ -0.21
GCS1P35197 SSA3YBL075C 1950 nt13.69□□□□□ -0.22
GCS1P35197 RKM5YLR137W 1104 nt13.66□□□□□ -0.22
GCS1P35197 RPP2BYDR382W 333 nt13.65□□□□□ -0.22
GCS1P35197 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.65□□□□□ -0.22
GCS1P35197 PTC2YER089C 1395 nt13.6□□□□□ -0.23
GCS1P35197 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.6□□□□□ -0.23
GCS1P35197 POA1YBR022W 534 nt13.58□□□□□ -0.24
GCS1P35197 BDH2YAL061W 1254 nt13.51□□□□□ -0.25
GCS1P35197 YLR281CYLR281C 468 nt13.45□□□□□ -0.26
GCS1P35197 PUS2YGL063W 1113 nt13.42□□□□□ -0.26
GCS1P35197 LSM3YLR438C-A 270 nt13.39□□□□□ -0.27
GCS1P35197 NAB2YGL122C 1578 nt13.36□□□□□ -0.27
GCS1P35197 BUD23YCR047C 828 nt13.35□□□□□ -0.27
GCS1P35197 WHI5YOR083W 888 nt13.33□□□□□ -0.28
GCS1P35197 INM2YDR287W 879 nt13.32□□□□□ -0.28
GCS1P35197 MOT3YMR070W 1473 nt13.29□□□□□ -0.28
GCS1P35197 YBL100CYBL100C 315 nt13.27□□□□□ -0.29
GCS1P35197 FIS1YIL065C 468 nt13.26□□□□□ -0.29
GCS1P35197 DAL1YIR027C 1383 nt13.26□□□□□ -0.29
GCS1P35197 FPR4YLR449W 1179 nt13.21□□□□□ -0.29
GCS1P35197 BSC6YOL137W 1494 nt13.21□□□□□ -0.3
GCS1P35197 YPR011CYPR011C 981 nt13.19□□□□□ -0.3
GCS1P35197 TRM9YML014W 840 nt13.16□□□□□ -0.3
GCS1P35197 PHO4YFR034C 939 nt13.15□□□□□ -0.3
GCS1P35197 FUN26YAL022C 1554 nt13.15□□□□□ -0.3
GCS1P35197 YLR236CYLR236C 324 nt13.09□□□□□ -0.31
GCS1P35197 FMP45YDL222C 930 nt13.08□□□□□ -0.32
GCS1P35197 DSK2YMR276W 1122 nt13.08□□□□□ -0.32
GCS1P35197 CCT6YDR188W 1641 nt13.05□□□□□ -0.32
GCS1P35197 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.04□□□□□ -0.32
GCS1P35197 IMP2'YIL154C 1041 nt12.97□□□□□ -0.33
GCS1P35197 YCH1YGR203W 447 nt12.96□□□□□ -0.33
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