Protein–RNA interactions for Protein: Q03330

GCN5, Histone acetyltransferase GCN5, yeastyeast

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN5Q03330 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.36■■□□□ 1.01
GCN5Q03330 NSR1YGR159C 1245 nt21.08■□□□□ 0.97
GCN5Q03330 NOP1YDL014W 984 nt20.88■□□□□ 0.93
GCN5Q03330 YKL036CYKL036C 393 nt19.5■□□□□ 0.71
GCN5Q03330 MDJ1YFL016C 1536 nt18.46■□□□□ 0.55
GCN5Q03330 Q0297Q0297 156 nt18.39■□□□□ 0.53
GCN5Q03330 SRX1YKL086W 384 nt18.27■□□□□ 0.52
GCN5Q03330 YJL027CYJL027C 417 nt18.22■□□□□ 0.51
GCN5Q03330 SCS3YGL126W 1143 nt17.86■□□□□ 0.45
GCN5Q03330 YCR051WYCR051W 669 nt17.31■□□□□ 0.36
GCN5Q03330 YOL085CYOL085C 342 nt16.89■□□□□ 0.29
GCN5Q03330 PKP1YIL042C 1185 nt16.58■□□□□ 0.24
GCN5Q03330 RPP1BYDL130W 321 nt16.49■□□□□ 0.23
GCN5Q03330 DBP2YNL112W 1641 nt16.48■□□□□ 0.23
GCN5Q03330 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.38■□□□□ 0.21
GCN5Q03330 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.38■□□□□ 0.21
GCN5Q03330 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.38■□□□□ 0.21
GCN5Q03330 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.38■□□□□ 0.21
GCN5Q03330 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.38■□□□□ 0.21
GCN5Q03330 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.38■□□□□ 0.21
GCN5Q03330 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.38■□□□□ 0.21
GCN5Q03330 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.38■□□□□ 0.21
GCN5Q03330 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.38■□□□□ 0.21
GCN5Q03330 CCC1YLR220W 969 nt16.18■□□□□ 0.18
GCN5Q03330 SCJ1YMR214W 1134 nt16.14■□□□□ 0.17
GCN5Q03330 ATS1YAL020C 1002 nt16.05■□□□□ 0.16
GCN5Q03330 PET122YER153C 765 nt15.72■□□□□ 0.11
GCN5Q03330 YBR190WYBR190W 312 nt15.71■□□□□ 0.11
GCN5Q03330 SCR1SCR1 522 nt15.59■□□□□ 0.09
GCN5Q03330 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.57■□□□□ 0.08
GCN5Q03330 RVS167YDR388W 1449 nt15.49■□□□□ 0.07
GCN5Q03330 RTC3YHR087W 336 nt15.32■□□□□ 0.04
GCN5Q03330 RRN5YLR141W 1092 nt15.3■□□□□ 0.04
GCN5Q03330 YDJ1YNL064C 1230 nt15.08■□□□□ 0
GCN5Q03330 SHR5YOL110W 714 nt15.03■□□□□ -0
GCN5Q03330 RSB1YOR049C 1065 nt15.02■□□□□ -0
GCN5Q03330 YER088W-BYER088W-B 147 nt15□□□□□ -0.01
GCN5Q03330 PST2YDR032C 597 nt14.85□□□□□ -0.03
GCN5Q03330 GAR1YHR089C 618 nt14.67□□□□□ -0.06
GCN5Q03330 DEP1YAL013W 1218 nt14.5□□□□□ -0.09
GCN5Q03330 URN1YPR152C 1398 nt14.46□□□□□ -0.1
GCN5Q03330 SSA3YBL075C 1950 nt14.44□□□□□ -0.1
GCN5Q03330 YKL097CYKL097C 411 nt14.34□□□□□ -0.11
GCN5Q03330 YNL208WYNL208W 600 nt14.32□□□□□ -0.12
GCN5Q03330 RPN10YHR200W 807 nt14.28□□□□□ -0.12
GCN5Q03330 OPI9YLR338W 858 nt14.22□□□□□ -0.13
GCN5Q03330 TIR1YER011W 765 nt14.18□□□□□ -0.14
GCN5Q03330 SHU1YHL006C 453 nt14.17□□□□□ -0.14
GCN5Q03330 PUT4YOR348C 1884 nt14.09□□□□□ -0.15
GCN5Q03330 SAH1YER043C 1350 nt14.06□□□□□ -0.16
GCN5Q03330 SSA1YAL005C 1929 nt13.98□□□□□ -0.17
GCN5Q03330 ARE1YCR048W 1833 nt13.9□□□□□ -0.18
GCN5Q03330 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.86□□□□□ -0.19
GCN5Q03330 YJR018WYJR018W 363 nt13.81□□□□□ -0.2
GCN5Q03330 SRB2YHR041C 633 nt13.8□□□□□ -0.2
GCN5Q03330 PUN1YLR414C 792 nt13.79□□□□□ -0.2
GCN5Q03330 YOR139CYOR139C 393 nt13.76□□□□□ -0.21
GCN5Q03330 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.69□□□□□ -0.22
GCN5Q03330 YJR120WYJR120W 351 nt13.69□□□□□ -0.22
GCN5Q03330 POA1YBR022W 534 nt13.65□□□□□ -0.22
GCN5Q03330 WWM1YFL010C 636 nt13.6□□□□□ -0.23
GCN5Q03330 PTC2YER089C 1395 nt13.58□□□□□ -0.23
GCN5Q03330 YGR021WYGR021W 873 nt13.58□□□□□ -0.24
GCN5Q03330 RPP2BYDR382W 333 nt13.57□□□□□ -0.24
GCN5Q03330 HOM6YJR139C 1080 nt13.57□□□□□ -0.24
GCN5Q03330 NPL3YDR432W 1245 nt13.54□□□□□ -0.24
GCN5Q03330 MNP1YGL068W 585 nt13.5□□□□□ -0.25
GCN5Q03330 NAB2YGL122C 1578 nt13.38□□□□□ -0.27
GCN5Q03330 BUD23YCR047C 828 nt13.38□□□□□ -0.27
GCN5Q03330 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.38□□□□□ -0.27
GCN5Q03330 BDH2YAL061W 1254 nt13.38□□□□□ -0.27
GCN5Q03330 YOL037CYOL037C 354 nt13.38□□□□□ -0.27
GCN5Q03330 RKM5YLR137W 1104 nt13.35□□□□□ -0.27
GCN5Q03330 BSC6YOL137W 1494 nt13.3□□□□□ -0.28
GCN5Q03330 INM2YDR287W 879 nt13.3□□□□□ -0.28
GCN5Q03330 LSM3YLR438C-A 270 nt13.26□□□□□ -0.29
GCN5Q03330 DAL1YIR027C 1383 nt13.24□□□□□ -0.29
GCN5Q03330 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.22□□□□□ -0.29
GCN5Q03330 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.22□□□□□ -0.29
GCN5Q03330 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.22□□□□□ -0.29
GCN5Q03330 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.22□□□□□ -0.29
GCN5Q03330 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.22□□□□□ -0.29
GCN5Q03330 FIS1YIL065C 468 nt13.21□□□□□ -0.29
GCN5Q03330 YBL100CYBL100C 315 nt13.19□□□□□ -0.3
GCN5Q03330 FPR4YLR449W 1179 nt13.18□□□□□ -0.3
GCN5Q03330 PHO4YFR034C 939 nt13.11□□□□□ -0.31
GCN5Q03330 YLR281CYLR281C 468 nt13.08□□□□□ -0.32
GCN5Q03330 TRM9YML014W 840 nt13.08□□□□□ -0.32
GCN5Q03330 FUN26YAL022C 1554 nt13.06□□□□□ -0.32
GCN5Q03330 PUS2YGL063W 1113 nt13.01□□□□□ -0.33
GCN5Q03330 WHI5YOR083W 888 nt13□□□□□ -0.33
GCN5Q03330 CCT6YDR188W 1641 nt12.94□□□□□ -0.34
GCN5Q03330 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.8□□□□□ -0.36
GCN5Q03330 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.79□□□□□ -0.36
GCN5Q03330 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.79□□□□□ -0.36
GCN5Q03330 ALF1YNL148C 765 nt12.79□□□□□ -0.36
GCN5Q03330 YPS1YLR120C 1710 nt12.79□□□□□ -0.36
GCN5Q03330 YDR095CYDR095C 411 nt12.76□□□□□ -0.37
GCN5Q03330 YPR011CYPR011C 981 nt12.76□□□□□ -0.37
GCN5Q03330 MOT3YMR070W 1473 nt12.76□□□□□ -0.37
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