Protein–RNA interactions for Protein: P53939

NIS1, Protein NIS1, yeastyeast

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIS1P53939 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.52■□□□□ 0.88
NIS1P53939 NOP1YDL014W 984 nt20.22■□□□□ 0.83
NIS1P53939 NSR1YGR159C 1245 nt19.97■□□□□ 0.79
NIS1P53939 YKL036CYKL036C 393 nt19.13■□□□□ 0.65
NIS1P53939 YJL027CYJL027C 417 nt17.95■□□□□ 0.46
NIS1P53939 Q0297Q0297 156 nt17.86■□□□□ 0.45
NIS1P53939 SCS3YGL126W 1143 nt17.66■□□□□ 0.42
NIS1P53939 SRX1YKL086W 384 nt17.65■□□□□ 0.42
NIS1P53939 MDJ1YFL016C 1536 nt17.16■□□□□ 0.34
NIS1P53939 YCR051WYCR051W 669 nt16.76■□□□□ 0.27
NIS1P53939 YOL085CYOL085C 342 nt16.53■□□□□ 0.24
NIS1P53939 SCJ1YMR214W 1134 nt16.38■□□□□ 0.21
NIS1P53939 PKP1YIL042C 1185 nt16.18■□□□□ 0.18
NIS1P53939 RPP1BYDL130W 321 nt16.02■□□□□ 0.16
NIS1P53939 ATS1YAL020C 1002 nt15.95■□□□□ 0.14
NIS1P53939 Q0182Q0182 405 nt15.85■□□□□ 0.13
NIS1P53939 MOT3YMR070W 1473 nt15.78■□□□□ 0.12
NIS1P53939 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.63■□□□□ 0.09
NIS1P53939 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.63■□□□□ 0.09
NIS1P53939 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.63■□□□□ 0.09
NIS1P53939 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.63■□□□□ 0.09
NIS1P53939 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.63■□□□□ 0.09
NIS1P53939 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.63■□□□□ 0.09
NIS1P53939 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.63■□□□□ 0.09
NIS1P53939 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.63■□□□□ 0.09
NIS1P53939 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.63■□□□□ 0.09
NIS1P53939 CCC1YLR220W 969 nt15.44■□□□□ 0.06
NIS1P53939 DBP2YNL112W 1641 nt15.4■□□□□ 0.06
NIS1P53939 SCR1SCR1 522 nt15.24■□□□□ 0.03
NIS1P53939 PET122YER153C 765 nt15.21■□□□□ 0.03
NIS1P53939 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.96□□□□□ -0.01
NIS1P53939 RTC3YHR087W 336 nt14.83□□□□□ -0.04
NIS1P53939 RRN5YLR141W 1092 nt14.83□□□□□ -0.04
NIS1P53939 YGR139WYGR139W 339 nt14.78□□□□□ -0.04
NIS1P53939 RSB1YOR049C 1065 nt14.69□□□□□ -0.06
NIS1P53939 PST2YDR032C 597 nt14.68□□□□□ -0.06
NIS1P53939 RVS167YDR388W 1449 nt14.67□□□□□ -0.06
NIS1P53939 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.54□□□□□ -0.08
NIS1P53939 YBR190WYBR190W 312 nt14.54□□□□□ -0.08
NIS1P53939 YDJ1YNL064C 1230 nt14.49□□□□□ -0.09
NIS1P53939 YKL097CYKL097C 411 nt14.4□□□□□ -0.1
NIS1P53939 NME1NME1 340 nt14.39□□□□□ -0.11
NIS1P53939 SHR5YOL110W 714 nt14.28□□□□□ -0.12
NIS1P53939 GAR1YHR089C 618 nt14.04□□□□□ -0.16
NIS1P53939 SHU1YHL006C 453 nt13.94□□□□□ -0.18
NIS1P53939 YOR139CYOR139C 393 nt13.68□□□□□ -0.22
NIS1P53939 DEP1YAL013W 1218 nt13.63□□□□□ -0.23
NIS1P53939 TIR1YER011W 765 nt13.56□□□□□ -0.24
NIS1P53939 CSM2YIL132C 642 nt13.54□□□□□ -0.24
NIS1P53939 YNL208WYNL208W 600 nt13.54□□□□□ -0.24
NIS1P53939 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.53□□□□□ -0.24
NIS1P53939 URN1YPR152C 1398 nt13.52□□□□□ -0.25
NIS1P53939 NPL3YDR432W 1245 nt13.49□□□□□ -0.25
NIS1P53939 RPN10YHR200W 807 nt13.49□□□□□ -0.25
NIS1P53939 SSA1YAL005C 1929 nt13.27□□□□□ -0.29
NIS1P53939 PAU21YOR394W 495 nt13.25□□□□□ -0.29
NIS1P53939 PAU22YPL282C 495 nt13.25□□□□□ -0.29
NIS1P53939 OPI9YLR338W 858 nt13.23□□□□□ -0.29
NIS1P53939 YGR021WYGR021W 873 nt13.19□□□□□ -0.3
NIS1P53939 YOL037CYOL037C 354 nt13.18□□□□□ -0.3
NIS1P53939 SSA3YBL075C 1950 nt13.15□□□□□ -0.3
NIS1P53939 HOM6YJR139C 1080 nt13.14□□□□□ -0.31
NIS1P53939 MNP1YGL068W 585 nt13.12□□□□□ -0.31
NIS1P53939 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.12□□□□□ -0.31
NIS1P53939 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.12□□□□□ -0.31
NIS1P53939 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.12□□□□□ -0.31
NIS1P53939 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.12□□□□□ -0.31
NIS1P53939 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.12□□□□□ -0.31
NIS1P53939 SRB2YHR041C 633 nt13.11□□□□□ -0.31
NIS1P53939 ARO7YPR060C 771 nt13.08□□□□□ -0.32
NIS1P53939 WWM1YFL010C 636 nt13.03□□□□□ -0.32
NIS1P53939 SAH1YER043C 1350 nt12.97□□□□□ -0.33
NIS1P53939 YJR018WYJR018W 363 nt12.94□□□□□ -0.34
NIS1P53939 RKM5YLR137W 1104 nt12.94□□□□□ -0.34
NIS1P53939 PUN1YLR414C 792 nt12.87□□□□□ -0.35
NIS1P53939 RPP2BYDR382W 333 nt12.86□□□□□ -0.35
NIS1P53939 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.86□□□□□ -0.35
NIS1P53939 PUS2YGL063W 1113 nt12.83□□□□□ -0.36
NIS1P53939 YJR120WYJR120W 351 nt12.83□□□□□ -0.36
NIS1P53939 YLR281CYLR281C 468 nt12.8□□□□□ -0.36
NIS1P53939 BSC6YOL137W 1494 nt12.78□□□□□ -0.36
NIS1P53939 PUT4YOR348C 1884 nt12.75□□□□□ -0.37
NIS1P53939 ARE1YCR048W 1833 nt12.69□□□□□ -0.38
NIS1P53939 REG2YBR050C 1017 nt12.68□□□□□ -0.38
NIS1P53939 BDH2YAL061W 1254 nt12.67□□□□□ -0.38
NIS1P53939 WHI5YOR083W 888 nt12.67□□□□□ -0.38
NIS1P53939 LSM3YLR438C-A 270 nt12.63□□□□□ -0.39
NIS1P53939 PAM17YKR065C 594 nt12.61□□□□□ -0.39
NIS1P53939 MRPL8YJL063C 717 nt12.58□□□□□ -0.4
NIS1P53939 PTC2YER089C 1395 nt12.57□□□□□ -0.4
NIS1P53939 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.53□□□□□ -0.4
NIS1P53939 FMP45YDL222C 930 nt12.51□□□□□ -0.41
NIS1P53939 DSK2YMR276W 1122 nt12.48□□□□□ -0.41
NIS1P53939 MET8YBR213W 825 nt12.47□□□□□ -0.41
NIS1P53939 IMP2'YIL154C 1041 nt12.46□□□□□ -0.41
NIS1P53939 INM2YDR287W 879 nt12.44□□□□□ -0.42
NIS1P53939 YCH1YGR203W 447 nt12.44□□□□□ -0.42
NIS1P53939 YPR011CYPR011C 981 nt12.41□□□□□ -0.42
NIS1P53939 CLB6YGR109C 1143 nt12.4□□□□□ -0.42
NIS1P53939 POA1YBR022W 534 nt12.4□□□□□ -0.42
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