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Protein–RNA interactions for Protein: P46988
PFD1, Prefoldin subunit 1, yeast
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109 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
PFD1
P46988
YML009W-B
YML009W-B
477 nt
21.51
■■□□□ 1.03
PFD1
P46988
NSR1
YGR159C
1245 nt
21.36
■■□□□ 1.01
PFD1
P46988
NOP1
YDL014W
984 nt
20.98
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PFD1
P46988
YKL036C
YKL036C
393 nt
19.44
■□□□□ 0.7
PFD1
P46988
MDJ1
YFL016C
1536 nt
18.84
■□□□□ 0.61
PFD1
P46988
Q0297
Q0297
156 nt
18.41
■□□□□ 0.54
PFD1
P46988
SRX1
YKL086W
384 nt
18.34
■□□□□ 0.53
PFD1
P46988
YJL027C
YJL027C
417 nt
18.14
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PFD1
P46988
SCS3
YGL126W
1143 nt
17.71
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PFD1
P46988
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YCR051W
669 nt
17.38
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PFD1
P46988
YOL085C
YOL085C
342 nt
16.85
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PFD1
P46988
DBP2
YNL112W
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PFD1
P46988
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YIL042C
1185 nt
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PFD1
P46988
TRN1
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■□□□□ 0.24
PFD1
P46988
SUF9
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72 nt
16.52
■□□□□ 0.24
PFD1
P46988
SUF8
tP(UGG)H
72 nt
16.52
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PFD1
P46988
tP(UGG)L
tP(UGG)L
72 nt
16.52
■□□□□ 0.24
PFD1
P46988
SUF7
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16.52
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PFD1
P46988
tP(UGG)N1
tP(UGG)N1
72 nt
16.52
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PFD1
P46988
tP(UGG)N2
tP(UGG)N2
72 nt
16.52
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PFD1
P46988
tP(UGG)O1
tP(UGG)O1
72 nt
16.52
■□□□□ 0.24
PFD1
P46988
SUF11
tP(UGG)O2
72 nt
16.52
■□□□□ 0.24
PFD1
P46988
RPP1B
YDL130W
321 nt
16.51
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PFD1
P46988
CCC1
YLR220W
969 nt
16.34
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PFD1
P46988
YBR190W
YBR190W
312 nt
16.08
■□□□□ 0.16
PFD1
P46988
ATS1
YAL020C
1002 nt
15.89
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PFD1
P46988
SCJ1
YMR214W
1134 nt
15.83
■□□□□ 0.12
PFD1
P46988
PET122
YER153C
765 nt
15.75
■□□□□ 0.11
PFD1
P46988
RVS167
YDR388W
1449 nt
15.73
■□□□□ 0.11
PFD1
P46988
RTC3
YHR087W
336 nt
15.69
■□□□□ 0.1
PFD1
P46988
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tP(UGG)O3
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15.67
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PFD1
P46988
SCR1
SCR1
522 nt
15.6
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PFD1
P46988
RRN5
YLR141W
1092 nt
15.33
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PFD1
P46988
SHR5
YOL110W
714 nt
15.22
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PFD1
P46988
YDJ1
YNL064C
1230 nt
15.17
■□□□□ 0.02
PFD1
P46988
YER088W-B
YER088W-B
147 nt
15.02
■□□□□ -0
PFD1
P46988
RSB1
YOR049C
1065 nt
15
□□□□□ -0.01
PFD1
P46988
GAR1
YHR089C
618 nt
14.79
□□□□□ -0.04
PFD1
P46988
DEP1
YAL013W
1218 nt
14.74
□□□□□ -0.05
PFD1
P46988
URN1
YPR152C
1398 nt
14.73
□□□□□ -0.05
PFD1
P46988
PST2
YDR032C
597 nt
14.72
□□□□□ -0.05
PFD1
P46988
YNL208W
YNL208W
600 nt
14.54
□□□□□ -0.08
PFD1
P46988
PUT4
YOR348C
1884 nt
14.53
□□□□□ -0.08
PFD1
P46988
RPN10
YHR200W
807 nt
14.53
□□□□□ -0.08
PFD1
P46988
OPI9
YLR338W
858 nt
14.52
□□□□□ -0.09
PFD1
P46988
SAH1
YER043C
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14.39
□□□□□ -0.11
PFD1
P46988
TIR1
YER011W
765 nt
14.3
□□□□□ -0.12
PFD1
P46988
ARE1
YCR048W
1833 nt
14.29
□□□□□ -0.12
PFD1
P46988
Q0182
Q0182
405 nt
14.27
□□□□□ -0.13
PFD1
P46988
YKL097C
YKL097C
411 nt
14.14
□□□□□ -0.15
PFD1
P46988
SSA1
YAL005C
1929 nt
14.11
□□□□□ -0.15
PFD1
P46988
PUN1
YLR414C
792 nt
14.09
□□□□□ -0.15
PFD1
P46988
POA1
YBR022W
534 nt
14.09
□□□□□ -0.15
PFD1
P46988
SHU1
YHL006C
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14.08
□□□□□ -0.16
PFD1
P46988
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YHR049C-A
297 nt
14.08
□□□□□ -0.16
PFD1
P46988
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YJR018W
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14.07
□□□□□ -0.16
PFD1
P46988
MOT3
YMR070W
1473 nt
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PFD1
P46988
SRB2
YHR041C
633 nt
13.9
□□□□□ -0.18
PFD1
P46988
PTC2
YER089C
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PFD1
P46988
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YJR120W
351 nt
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□□□□□ -0.19
PFD1
P46988
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YAL037C-B
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PFD1
P46988
RPP2B
YDR382W
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PFD1
P46988
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YCR047C
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PFD1
P46988
BSC6
YOL137W
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□□□□□ -0.21
PFD1
P46988
NAB2
YGL122C
1578 nt
13.71
□□□□□ -0.21
PFD1
P46988
WWM1
YFL010C
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PFD1
P46988
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YGR021W
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PFD1
P46988
HOM6
YJR139C
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13.59
□□□□□ -0.23
PFD1
P46988
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YDR287W
879 nt
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PFD1
P46988
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YOR139C
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13.58
□□□□□ -0.24
PFD1
P46988
BDH2
YAL061W
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□□□□□ -0.24
PFD1
P46988
DAL1
YIR027C
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PFD1
P46988
SSA3
YBL075C
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PFD1
P46988
MNP1
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PFD1
P46988
FIS1
YIL065C
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PFD1
P46988
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PFD1
P46988
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YFL021C-A
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PFD1
P46988
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YBL100C
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PFD1
P46988
NPL3
YDR432W
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PFD1
P46988
PHO4
YFR034C
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13.41
□□□□□ -0.26
PFD1
P46988
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□□□□□ -0.26
PFD1
P46988
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P46988
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YOL037C
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PFD1
P46988
TRM9
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PFD1
P46988
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YAL022C
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P46988
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YDR188W
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P46988
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YLR120C
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PFD1
P46988
YDR095C
YDR095C
411 nt
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PFD1
P46988
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tM(CAU)C
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PFD1
P46988
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tM(CAU)E
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□□□□□ -0.32
PFD1
P46988
IMT3
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PFD1
P46988
IMT1
tM(CAU)O1
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□□□□□ -0.32
PFD1
P46988
IMT2
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□□□□□ -0.32
PFD1
P46988
ALF1
YNL148C
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PFD1
P46988
SPT5
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PFD1
P46988
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YLR281C
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PFD1
P46988
SUF2
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□□□□□ -0.33
PFD1
P46988
SUF10
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13.01
□□□□□ -0.33
PFD1
P46988
WHI5
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888 nt
12.99
□□□□□ -0.33
PFD1
P46988
YHR165W-A
YHR165W-A
312 nt
12.96
□□□□□ -0.33
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