RNA–Protein interactions for RNA: YHR093W

AHT1, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene AHT1, Length 549 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AHT1	YHR093W	SKY1	Q03656	742 aa		11.8	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	YLR297W	Q05899	129 aa		11.8	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	SWI3	P32591	825 aa		11.79	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	SLX1	P38324	304 aa		11.79	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	FTR1	P40088	404 aa		11.79	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	ISM1	P48526	1002 aa		11.79	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	STB4	P50104	949 aa		11.79	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.79	□□□□□ -0.52	not detected
AHT1	YHR093W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	NIP100	P33420	868 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	HEL1	P36113	551 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	EFM2	P38347	419 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	RTT107	P38850	1070 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	OPT1	P40897	799 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	FIG4	P42837	879 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	YLR455W	Q06188	304 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	TAO3	P40468	2376 aa		11.77	□□□□□ -0.52
AHT1	YHR093W	SPO11	P23179	398 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	MNR2	P35724	969 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	PTC4	P38089	393 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	DAS1	P47005	663 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	HFM1	P51979	1187 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	VPS75	P53853	264 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	EAR1	Q03212	550 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	YDL206W	Q12424	762 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	CIT2	P08679	460 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	ADK2	P26364	225 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	SMC1	P32908	1225 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	XDJ1	P39102	459 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	EEB1	Q02891	456 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	YLR287C	Q05881	355 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	CDD1	Q06549	142 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	ESC8	Q08119	714 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	PHO13	P19881	312 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	RRT12	P25381	491 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	MCM2	P29469	868 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	CDC11	P32458	415 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	CPR7	P47103	393 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	UME1	Q03010	460 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	PRC1	P00729	532 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	APN2	P38207	520 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	YHR054C	P38780	354 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	BUD16	P39988	312 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	PNG1	Q02890	363 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	REC8	Q12188	680 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	CTF3	Q12748	733 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	MRPL7	P36519	292 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	VFA1	P40080	203 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	SMC3	P47037	1230 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	YPR078C	Q06813	372 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	PLP2	Q12017	286 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	ATG9	Q12142	997 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	GIS3	Q12418	502 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	UBR2	Q07963	1872 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	CDC42	P19073	191 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	KIP1	P28742	1111 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	CCL1	P37366	393 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	TBS1	P38114	1094 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	YHR202W	P38887	602 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	FMP10	P40098	244 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	STR2	P47164	639 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	ALT1	P52893	592 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	TUP1	P16649	713 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	DAL2	P25335	343 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	RAD54	P32863	898 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	TAD1	P53065	400 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	YGR130C	P53278	816 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
AHT1	YHR093W	GAL10	P04397	699 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AHT1	YHR093W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AHT1	YHR093W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AHT1	YHR093W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AHT1	YHR093W	PXL1	P36166	706 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AHT1	YHR093W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AHT1	YHR093W	IES1	P43579	692 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AHT1	YHR093W	SPP1	Q03012	353 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AHT1	YHR093W	PPM1	Q04081	328 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AHT1	YHR093W	APL4	Q12028	832 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AHT1	YHR093W	SPO12	P17123	173 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AHT1	YHR093W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
AHT1	YHR093W	VPS3	P23643	1011 aa		11.69	□□□□□ -0.54

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 69.9 ms