Protein–RNA interactions for Protein: P53278

YGR130C, Uncharacterized protein YGR130C, yeastyeast

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YGR130CP53278 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.08■■□□□ 1.13
YGR130CP53278 NSR1YGR159C 1245 nt21.66■■□□□ 1.06
YGR130CP53278 NOP1YDL014W 984 nt21.58■■□□□ 1.05
YGR130CP53278 YKL036CYKL036C 393 nt20.1■□□□□ 0.81
YGR130CP53278 MDJ1YFL016C 1536 nt19■□□□□ 0.63
YGR130CP53278 YJL027CYJL027C 417 nt18.86■□□□□ 0.61
YGR130CP53278 Q0297Q0297 156 nt18.85■□□□□ 0.61
YGR130CP53278 SRX1YKL086W 384 nt18.78■□□□□ 0.6
YGR130CP53278 SCS3YGL126W 1143 nt18.37■□□□□ 0.53
YGR130CP53278 YCR051WYCR051W 669 nt17.95■□□□□ 0.46
YGR130CP53278 SSA3YBL075C 1950 nt17.81■□□□□ 0.44
YGR130CP53278 YOL085CYOL085C 342 nt17.35■□□□□ 0.37
YGR130CP53278 PKP1YIL042C 1185 nt17.12■□□□□ 0.33
YGR130CP53278 RPP1BYDL130W 321 nt16.96■□□□□ 0.31
YGR130CP53278 DBP2YNL112W 1641 nt16.81■□□□□ 0.28
YGR130CP53278 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.79■□□□□ 0.28
YGR130CP53278 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.79■□□□□ 0.28
YGR130CP53278 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.79■□□□□ 0.28
YGR130CP53278 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.79■□□□□ 0.28
YGR130CP53278 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.79■□□□□ 0.28
YGR130CP53278 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.79■□□□□ 0.28
YGR130CP53278 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.79■□□□□ 0.28
YGR130CP53278 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.79■□□□□ 0.28
YGR130CP53278 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.79■□□□□ 0.28
YGR130CP53278 CCC1YLR220W 969 nt16.78■□□□□ 0.28
YGR130CP53278 SCJ1YMR214W 1134 nt16.56■□□□□ 0.24
YGR130CP53278 ATS1YAL020C 1002 nt16.5■□□□□ 0.23
YGR130CP53278 SCR1SCR1 522 nt16.17■□□□□ 0.18
YGR130CP53278 PET122YER153C 765 nt16.16■□□□□ 0.18
YGR130CP53278 YBR190WYBR190W 312 nt16.13■□□□□ 0.17
YGR130CP53278 RVS167YDR388W 1449 nt16.07■□□□□ 0.16
YGR130CP53278 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.01■□□□□ 0.15
YGR130CP53278 RTC3YHR087W 336 nt15.93■□□□□ 0.14
YGR130CP53278 RRN5YLR141W 1092 nt15.74■□□□□ 0.11
YGR130CP53278 RSB1YOR049C 1065 nt15.56■□□□□ 0.08
YGR130CP53278 SHR5YOL110W 714 nt15.47■□□□□ 0.07
YGR130CP53278 PUT4YOR348C 1884 nt15.47■□□□□ 0.07
YGR130CP53278 YDJ1YNL064C 1230 nt15.46■□□□□ 0.07
YGR130CP53278 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.41■□□□□ 0.06
YGR130CP53278 SSA4YER103W 1929 nt15.3■□□□□ 0.04
YGR130CP53278 SPT5YML010W 3192 nt15.2■□□□□ 0.02
YGR130CP53278 PST2YDR032C 597 nt15.19■□□□□ 0.02
YGR130CP53278 GAR1YHR089C 618 nt15.16■□□□□ 0.02
YGR130CP53278 DEP1YAL013W 1218 nt15.01□□□□□ -0.01
YGR130CP53278 PAC11YDR488C 1602 nt14.99□□□□□ -0.01
YGR130CP53278 URN1YPR152C 1398 nt14.92□□□□□ -0.02
YGR130CP53278 BDF1YLR399C 2061 nt14.89□□□□□ -0.03
YGR130CP53278 POA1YBR022W 534 nt14.85□□□□□ -0.03
YGR130CP53278 YKL097CYKL097C 411 nt14.83□□□□□ -0.04
YGR130CP53278 RPN10YHR200W 807 nt14.82□□□□□ -0.04
YGR130CP53278 BSC6YOL137W 1494 nt14.8□□□□□ -0.04
YGR130CP53278 ARE1YCR048W 1833 nt14.79□□□□□ -0.04
YGR130CP53278 YNL208WYNL208W 600 nt14.77□□□□□ -0.05
YGR130CP53278 NVJ2YPR091C 2313 nt14.77□□□□□ -0.05
YGR130CP53278 TAT1YBR069C 1860 nt14.65□□□□□ -0.06
YGR130CP53278 TIR1YER011W 765 nt14.61□□□□□ -0.07
YGR130CP53278 OPI9YLR338W 858 nt14.6□□□□□ -0.07
YGR130CP53278 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.59□□□□□ -0.07
YGR130CP53278 SHU1YHL006C 453 nt14.54□□□□□ -0.08
YGR130CP53278 SAH1YER043C 1350 nt14.5□□□□□ -0.09
YGR130CP53278 SSA1YAL005C 1929 nt14.33□□□□□ -0.12
YGR130CP53278 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.31□□□□□ -0.12
YGR130CP53278 FPS1YLL043W 2010 nt14.29□□□□□ -0.12
YGR130CP53278 YJR018WYJR018W 363 nt14.25□□□□□ -0.13
YGR130CP53278 PUN1YLR414C 792 nt14.22□□□□□ -0.13
YGR130CP53278 BUD23YCR047C 828 nt14.11□□□□□ -0.15
YGR130CP53278 RPP2BYDR382W 333 nt14.11□□□□□ -0.15
YGR130CP53278 YOR139CYOR139C 393 nt14.07□□□□□ -0.16
YGR130CP53278 NPL3YDR432W 1245 nt14.06□□□□□ -0.16
YGR130CP53278 SRB2YHR041C 633 nt14.04□□□□□ -0.16
YGR130CP53278 MEP2YNL142W 1500 nt14.02□□□□□ -0.16
YGR130CP53278 YGR021WYGR021W 873 nt14.02□□□□□ -0.17
YGR130CP53278 PTC2YER089C 1395 nt14.01□□□□□ -0.17
YGR130CP53278 WWM1YFL010C 636 nt14□□□□□ -0.17
YGR130CP53278 MNP1YGL068W 585 nt13.91□□□□□ -0.18
YGR130CP53278 YJR120WYJR120W 351 nt13.9□□□□□ -0.18
YGR130CP53278 HOM6YJR139C 1080 nt13.9□□□□□ -0.18
YGR130CP53278 DCW1YKL046C 1350 nt13.82□□□□□ -0.2
YGR130CP53278 YOL037CYOL037C 354 nt13.79□□□□□ -0.2
YGR130CP53278 NAB2YGL122C 1578 nt13.79□□□□□ -0.2
YGR130CP53278 YBR220CYBR220C 1683 nt13.79□□□□□ -0.2
YGR130CP53278 BDH2YAL061W 1254 nt13.77□□□□□ -0.21
YGR130CP53278 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.76□□□□□ -0.21
YGR130CP53278 FPR4YLR449W 1179 nt13.74□□□□□ -0.21
YGR130CP53278 RKM5YLR137W 1104 nt13.73□□□□□ -0.21
YGR130CP53278 INM2YDR287W 879 nt13.71□□□□□ -0.21
YGR130CP53278 UME6YDR207C 2511 nt13.69□□□□□ -0.22
YGR130CP53278 DAL1YIR027C 1383 nt13.65□□□□□ -0.22
YGR130CP53278 PCH2YBR186W 1695 nt13.63□□□□□ -0.23
YGR130CP53278 LSM3YLR438C-A 270 nt13.63□□□□□ -0.23
YGR130CP53278 YBL100CYBL100C 315 nt13.63□□□□□ -0.23
YGR130CP53278 GUT2YIL155C 1950 nt13.63□□□□□ -0.23
YGR130CP53278 FIS1YIL065C 468 nt13.55□□□□□ -0.24
YGR130CP53278 TRM9YML014W 840 nt13.54□□□□□ -0.24
YGR130CP53278 EMI2YDR516C 1503 nt13.54□□□□□ -0.24
YGR130CP53278 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.53□□□□□ -0.24
YGR130CP53278 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.53□□□□□ -0.24
YGR130CP53278 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.53□□□□□ -0.24
YGR130CP53278 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.53□□□□□ -0.24
YGR130CP53278 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms