Protein–RNA interactions for Protein: Q12028

APL4, AP-1 complex subunit gamma-1, yeastyeast

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APL4Q12028 NSR1YGR159C 1245 nt21.99■■□□□ 1.11
APL4Q12028 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.8■■□□□ 1.08
APL4Q12028 NOP1YDL014W 984 nt20.91■□□□□ 0.94
APL4Q12028 MDJ1YFL016C 1536 nt20.05■□□□□ 0.8
APL4Q12028 YKL036CYKL036C 393 nt18.97■□□□□ 0.63
APL4Q12028 SRX1YKL086W 384 nt18.35■□□□□ 0.53
APL4Q12028 YJL027CYJL027C 417 nt18.34■□□□□ 0.53
APL4Q12028 Q0297Q0297 156 nt18.26■□□□□ 0.51
APL4Q12028 DBP2YNL112W 1641 nt17.61■□□□□ 0.41
APL4Q12028 YCR051WYCR051W 669 nt17.37■□□□□ 0.37
APL4Q12028 SCS3YGL126W 1143 nt17.12■□□□□ 0.33
APL4Q12028 YBR190WYBR190W 312 nt17.11■□□□□ 0.33
APL4Q12028 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.89■□□□□ 0.29
APL4Q12028 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.89■□□□□ 0.29
APL4Q12028 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.89■□□□□ 0.29
APL4Q12028 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.89■□□□□ 0.29
APL4Q12028 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.89■□□□□ 0.29
APL4Q12028 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.89■□□□□ 0.29
APL4Q12028 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.89■□□□□ 0.29
APL4Q12028 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.89■□□□□ 0.29
APL4Q12028 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.89■□□□□ 0.29
APL4Q12028 CCC1YLR220W 969 nt16.69■□□□□ 0.26
APL4Q12028 RTC3YHR087W 336 nt16.68■□□□□ 0.26
APL4Q12028 YOL085CYOL085C 342 nt16.51■□□□□ 0.23
APL4Q12028 RPP1BYDL130W 321 nt16.38■□□□□ 0.21
APL4Q12028 PKP1YIL042C 1185 nt16.34■□□□□ 0.21
APL4Q12028 SCJ1YMR214W 1134 nt16.3■□□□□ 0.2
APL4Q12028 RVS167YDR388W 1449 nt16.24■□□□□ 0.19
APL4Q12028 PUT4YOR348C 1884 nt15.95■□□□□ 0.14
APL4Q12028 SSA3YBL075C 1950 nt15.93■□□□□ 0.14
APL4Q12028 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.83■□□□□ 0.12
APL4Q12028 PET122YER153C 765 nt15.77■□□□□ 0.12
APL4Q12028 SHR5YOL110W 714 nt15.66■□□□□ 0.1
APL4Q12028 ARE1YCR048W 1833 nt15.54■□□□□ 0.08
APL4Q12028 URN1YPR152C 1398 nt15.51■□□□□ 0.07
APL4Q12028 SAH1YER043C 1350 nt15.43■□□□□ 0.06
APL4Q12028 DEP1YAL013W 1218 nt15.42■□□□□ 0.06
APL4Q12028 POA1YBR022W 534 nt15.4■□□□□ 0.06
APL4Q12028 OPI9YLR338W 858 nt15.37■□□□□ 0.05
APL4Q12028 SCR1SCR1 522 nt15.32■□□□□ 0.04
APL4Q12028 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.31■□□□□ 0.04
APL4Q12028 YDJ1YNL064C 1230 nt15.28■□□□□ 0.04
APL4Q12028 RRN5YLR141W 1092 nt15.24■□□□□ 0.03
APL4Q12028 ATS1YAL020C 1002 nt15.17■□□□□ 0.02
APL4Q12028 BSC6YOL137W 1494 nt15.15■□□□□ 0.02
APL4Q12028 RPN10YHR200W 807 nt15.06■□□□□ 0
APL4Q12028 YNL208WYNL208W 600 nt15.05■□□□□ -0
APL4Q12028 GAR1YHR089C 618 nt15.03■□□□□ -0
APL4Q12028 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.95□□□□□ -0.02
APL4Q12028 BUD23YCR047C 828 nt14.88□□□□□ -0.03
APL4Q12028 SPT5YML010W 3192 nt14.87□□□□□ -0.03
APL4Q12028 PUN1YLR414C 792 nt14.85□□□□□ -0.03
APL4Q12028 PTC2YER089C 1395 nt14.81□□□□□ -0.04
APL4Q12028 RSB1YOR049C 1065 nt14.75□□□□□ -0.05
APL4Q12028 YJR018WYJR018W 363 nt14.74□□□□□ -0.05
APL4Q12028 NAB2YGL122C 1578 nt14.64□□□□□ -0.07
APL4Q12028 YJR120WYJR120W 351 nt14.61□□□□□ -0.07
APL4Q12028 TIR1YER011W 765 nt14.55□□□□□ -0.08
APL4Q12028 SSA1YAL005C 1929 nt14.53□□□□□ -0.08
APL4Q12028 FIS1YIL065C 468 nt14.5□□□□□ -0.09
APL4Q12028 SSA4YER103W 1929 nt14.46□□□□□ -0.09
APL4Q12028 DAL1YIR027C 1383 nt14.38□□□□□ -0.11
APL4Q12028 SRB2YHR041C 633 nt14.34□□□□□ -0.11
APL4Q12028 FPR4YLR449W 1179 nt14.32□□□□□ -0.12
APL4Q12028 PHO4YFR034C 939 nt14.28□□□□□ -0.12
APL4Q12028 MEP2YNL142W 1500 nt14.25□□□□□ -0.13
APL4Q12028 RPP2BYDR382W 333 nt14.24□□□□□ -0.13
APL4Q12028 INM2YDR287W 879 nt14.22□□□□□ -0.13
APL4Q12028 YPS1YLR120C 1710 nt14.16□□□□□ -0.14
APL4Q12028 PST2YDR032C 597 nt14.15□□□□□ -0.14
APL4Q12028 DCW1YKL046C 1350 nt14.09□□□□□ -0.15
APL4Q12028 YBL100CYBL100C 315 nt14.07□□□□□ -0.16
APL4Q12028 YDR095CYDR095C 411 nt14.01□□□□□ -0.17
APL4Q12028 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.98□□□□□ -0.17
APL4Q12028 BDF1YLR399C 2061 nt13.97□□□□□ -0.17
APL4Q12028 BDH2YAL061W 1254 nt13.97□□□□□ -0.17
APL4Q12028 FUN26YAL022C 1554 nt13.91□□□□□ -0.18
APL4Q12028 WWM1YFL010C 636 nt13.88□□□□□ -0.19
APL4Q12028 EMI2YDR516C 1503 nt13.83□□□□□ -0.2
APL4Q12028 PTP1YDL230W 1008 nt13.82□□□□□ -0.2
APL4Q12028 CAC2YML102W 1407 nt13.79□□□□□ -0.2
APL4Q12028 TAT1YBR069C 1860 nt13.76□□□□□ -0.21
APL4Q12028 YBR220CYBR220C 1683 nt13.75□□□□□ -0.21
APL4Q12028 TRM9YML014W 840 nt13.73□□□□□ -0.21
APL4Q12028 RPP2AYOL039W 321 nt13.72□□□□□ -0.21
APL4Q12028 ALF1YNL148C 765 nt13.71□□□□□ -0.21
APL4Q12028 SHU1YHL006C 453 nt13.7□□□□□ -0.22
APL4Q12028 YDL221WYDL221W 552 nt13.69□□□□□ -0.22
APL4Q12028 LSM3YLR438C-A 270 nt13.68□□□□□ -0.22
APL4Q12028 CCT6YDR188W 1641 nt13.68□□□□□ -0.22
APL4Q12028 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.65□□□□□ -0.22
APL4Q12028 YMR090WYMR090W 684 nt13.62□□□□□ -0.23
APL4Q12028 SIS1YNL007C 1059 nt13.61□□□□□ -0.23
APL4Q12028 SDH1YKL148C 1923 nt13.6□□□□□ -0.23
APL4Q12028 HOM6YJR139C 1080 nt13.59□□□□□ -0.23
APL4Q12028 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.58□□□□□ -0.24
APL4Q12028 IRC15YPL017C 1500 nt13.58□□□□□ -0.24
APL4Q12028 YGR021WYGR021W 873 nt13.55□□□□□ -0.24
APL4Q12028 MNP1YGL068W 585 nt13.51□□□□□ -0.25
APL4Q12028 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.49□□□□□ -0.25
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