Protein–RNA interactions for Protein: Q12017

PLP2, Phosducin-like protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PLP2Q12017 NSR1YGR159C 1245 nt22.07■■□□□ 1.12
PLP2Q12017 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.99■■□□□ 1.11
PLP2Q12017 NOP1YDL014W 984 nt21.33■■□□□ 1.01
PLP2Q12017 YKL036CYKL036C 393 nt19.95■□□□□ 0.78
PLP2Q12017 MDJ1YFL016C 1536 nt19.78■□□□□ 0.76
PLP2Q12017 Q0297Q0297 156 nt18.74■□□□□ 0.59
PLP2Q12017 YJL027CYJL027C 417 nt18.68■□□□□ 0.58
PLP2Q12017 SRX1YKL086W 384 nt18.6■□□□□ 0.57
PLP2Q12017 SCS3YGL126W 1143 nt18.32■□□□□ 0.52
PLP2Q12017 YCR051WYCR051W 669 nt17.67■□□□□ 0.42
PLP2Q12017 DBP2YNL112W 1641 nt17.36■□□□□ 0.37
PLP2Q12017 YOL085CYOL085C 342 nt17.27■□□□□ 0.36
PLP2Q12017 PKP1YIL042C 1185 nt16.98■□□□□ 0.31
PLP2Q12017 YBR190WYBR190W 312 nt16.96■□□□□ 0.31
PLP2Q12017 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.91■□□□□ 0.3
PLP2Q12017 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.91■□□□□ 0.3
PLP2Q12017 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.91■□□□□ 0.3
PLP2Q12017 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.91■□□□□ 0.3
PLP2Q12017 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.91■□□□□ 0.3
PLP2Q12017 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.91■□□□□ 0.3
PLP2Q12017 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.91■□□□□ 0.3
PLP2Q12017 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.91■□□□□ 0.3
PLP2Q12017 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.91■□□□□ 0.3
PLP2Q12017 CCC1YLR220W 969 nt16.82■□□□□ 0.28
PLP2Q12017 RPP1BYDL130W 321 nt16.81■□□□□ 0.28
PLP2Q12017 SSA3YBL075C 1950 nt16.73■□□□□ 0.27
PLP2Q12017 SCJ1YMR214W 1134 nt16.65■□□□□ 0.26
PLP2Q12017 RTC3YHR087W 336 nt16.63■□□□□ 0.25
PLP2Q12017 ATS1YAL020C 1002 nt16.48■□□□□ 0.23
PLP2Q12017 RVS167YDR388W 1449 nt16.38■□□□□ 0.21
PLP2Q12017 PET122YER153C 765 nt16.03■□□□□ 0.16
PLP2Q12017 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.96■□□□□ 0.15
PLP2Q12017 SCR1SCR1 522 nt15.95■□□□□ 0.14
PLP2Q12017 SHR5YOL110W 714 nt15.71■□□□□ 0.11
PLP2Q12017 RRN5YLR141W 1092 nt15.61■□□□□ 0.09
PLP2Q12017 PUT4YOR348C 1884 nt15.52■□□□□ 0.08
PLP2Q12017 YDJ1YNL064C 1230 nt15.43■□□□□ 0.06
PLP2Q12017 URN1YPR152C 1398 nt15.43■□□□□ 0.06
PLP2Q12017 RSB1YOR049C 1065 nt15.38■□□□□ 0.05
PLP2Q12017 DEP1YAL013W 1218 nt15.36■□□□□ 0.05
PLP2Q12017 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.3■□□□□ 0.04
PLP2Q12017 OPI9YLR338W 858 nt15.23■□□□□ 0.03
PLP2Q12017 PST2YDR032C 597 nt15.21■□□□□ 0.03
PLP2Q12017 SAH1YER043C 1350 nt15.21■□□□□ 0.02
PLP2Q12017 RPN10YHR200W 807 nt15.19■□□□□ 0.02
PLP2Q12017 ARE1YCR048W 1833 nt15.17■□□□□ 0.02
PLP2Q12017 GAR1YHR089C 618 nt15.16■□□□□ 0.02
PLP2Q12017 YNL208WYNL208W 600 nt15.11■□□□□ 0.01
PLP2Q12017 POA1YBR022W 534 nt15.09■□□□□ 0.01
PLP2Q12017 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.01□□□□□ -0.01
PLP2Q12017 PUN1YLR414C 792 nt14.82□□□□□ -0.04
PLP2Q12017 YKL097CYKL097C 411 nt14.79□□□□□ -0.04
PLP2Q12017 BSC6YOL137W 1494 nt14.76□□□□□ -0.05
PLP2Q12017 YJR018WYJR018W 363 nt14.71□□□□□ -0.05
PLP2Q12017 BUD23YCR047C 828 nt14.7□□□□□ -0.06
PLP2Q12017 PTC2YER089C 1395 nt14.68□□□□□ -0.06
PLP2Q12017 TIR1YER011W 765 nt14.64□□□□□ -0.07
PLP2Q12017 NAB2YGL122C 1578 nt14.52□□□□□ -0.08
PLP2Q12017 SHU1YHL006C 453 nt14.52□□□□□ -0.09
PLP2Q12017 SSA1YAL005C 1929 nt14.48□□□□□ -0.09
PLP2Q12017 PAC11YDR488C 1602 nt14.46□□□□□ -0.09
PLP2Q12017 RPP2BYDR382W 333 nt14.4□□□□□ -0.1
PLP2Q12017 NVJ2YPR091C 2313 nt14.34□□□□□ -0.11
PLP2Q12017 YJR120WYJR120W 351 nt14.33□□□□□ -0.12
PLP2Q12017 FPR4YLR449W 1179 nt14.3□□□□□ -0.12
PLP2Q12017 FPS1YLL043W 2010 nt14.3□□□□□ -0.12
PLP2Q12017 DAL1YIR027C 1383 nt14.27□□□□□ -0.12
PLP2Q12017 INM2YDR287W 879 nt14.25□□□□□ -0.13
PLP2Q12017 FIS1YIL065C 468 nt14.2□□□□□ -0.14
PLP2Q12017 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.19□□□□□ -0.14
PLP2Q12017 SRB2YHR041C 633 nt14.13□□□□□ -0.15
PLP2Q12017 YOR139CYOR139C 393 nt14.13□□□□□ -0.15
PLP2Q12017 SPT5YML010W 3192 nt14.12□□□□□ -0.15
PLP2Q12017 PHO4YFR034C 939 nt14.12□□□□□ -0.15
PLP2Q12017 YBL100CYBL100C 315 nt14.04□□□□□ -0.16
PLP2Q12017 BDH2YAL061W 1254 nt14.01□□□□□ -0.17
PLP2Q12017 NPL3YDR432W 1245 nt13.94□□□□□ -0.18
PLP2Q12017 WWM1YFL010C 636 nt13.94□□□□□ -0.18
PLP2Q12017 YPS1YLR120C 1710 nt13.91□□□□□ -0.18
PLP2Q12017 MEP2YNL142W 1500 nt13.88□□□□□ -0.19
PLP2Q12017 SSA4YER103W 1929 nt13.88□□□□□ -0.19
PLP2Q12017 FUN26YAL022C 1554 nt13.86□□□□□ -0.19
PLP2Q12017 YGR021WYGR021W 873 nt13.85□□□□□ -0.19
PLP2Q12017 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.84□□□□□ -0.19
PLP2Q12017 TRM9YML014W 840 nt13.84□□□□□ -0.19
PLP2Q12017 HOM6YJR139C 1080 nt13.82□□□□□ -0.2
PLP2Q12017 MNP1YGL068W 585 nt13.81□□□□□ -0.2
PLP2Q12017 LSM3YLR438C-A 270 nt13.8□□□□□ -0.2
PLP2Q12017 YDR095CYDR095C 411 nt13.78□□□□□ -0.2
PLP2Q12017 ALF1YNL148C 765 nt13.77□□□□□ -0.21
PLP2Q12017 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.73□□□□□ -0.21
PLP2Q12017 YOL037CYOL037C 354 nt13.71□□□□□ -0.21
PLP2Q12017 DCW1YKL046C 1350 nt13.65□□□□□ -0.22
PLP2Q12017 CCT6YDR188W 1641 nt13.64□□□□□ -0.23
PLP2Q12017 RKM5YLR137W 1104 nt13.62□□□□□ -0.23
PLP2Q12017 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.61□□□□□ -0.23
PLP2Q12017 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.61□□□□□ -0.23
PLP2Q12017 RPP2AYOL039W 321 nt13.57□□□□□ -0.24
PLP2Q12017 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.56□□□□□ -0.24
PLP2Q12017 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.6 ms