Protein–RNA interactions for Protein: Q12149

RRP6, Exosome complex exonuclease RRP6, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP6Q12149 NSR1YGR159C 1245 nt22.05■■□□□ 1.12
RRP6Q12149 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.9■■□□□ 1.1
RRP6Q12149 NOP1YDL014W 984 nt21.15■□□□□ 0.98
RRP6Q12149 MDJ1YFL016C 1536 nt19.87■□□□□ 0.77
RRP6Q12149 YKL036CYKL036C 393 nt19.25■□□□□ 0.67
RRP6Q12149 SRX1YKL086W 384 nt18.51■□□□□ 0.55
RRP6Q12149 Q0297Q0297 156 nt18.46■□□□□ 0.55
RRP6Q12149 YJL027CYJL027C 417 nt18.29■□□□□ 0.52
RRP6Q12149 YCR051WYCR051W 669 nt17.5■□□□□ 0.39
RRP6Q12149 DBP2YNL112W 1641 nt17.5■□□□□ 0.39
RRP6Q12149 SCS3YGL126W 1143 nt17.38■□□□□ 0.37
RRP6Q12149 YBR190WYBR190W 312 nt17.02■□□□□ 0.32
RRP6Q12149 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.94■□□□□ 0.3
RRP6Q12149 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.94■□□□□ 0.3
RRP6Q12149 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.94■□□□□ 0.3
RRP6Q12149 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.94■□□□□ 0.3
RRP6Q12149 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.94■□□□□ 0.3
RRP6Q12149 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.94■□□□□ 0.3
RRP6Q12149 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.94■□□□□ 0.3
RRP6Q12149 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.94■□□□□ 0.3
RRP6Q12149 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.94■□□□□ 0.3
RRP6Q12149 CCC1YLR220W 969 nt16.71■□□□□ 0.27
RRP6Q12149 YOL085CYOL085C 342 nt16.71■□□□□ 0.27
RRP6Q12149 RTC3YHR087W 336 nt16.58■□□□□ 0.24
RRP6Q12149 RPP1BYDL130W 321 nt16.54■□□□□ 0.24
RRP6Q12149 PKP1YIL042C 1185 nt16.47■□□□□ 0.23
RRP6Q12149 RVS167YDR388W 1449 nt16.3■□□□□ 0.2
RRP6Q12149 SCJ1YMR214W 1134 nt16.23■□□□□ 0.19
RRP6Q12149 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.91■□□□□ 0.14
RRP6Q12149 PET122YER153C 765 nt15.86■□□□□ 0.13
RRP6Q12149 PUT4YOR348C 1884 nt15.72■□□□□ 0.11
RRP6Q12149 SHR5YOL110W 714 nt15.7■□□□□ 0.1
RRP6Q12149 SCR1SCR1 522 nt15.56■□□□□ 0.08
RRP6Q12149 ATS1YAL020C 1002 nt15.45■□□□□ 0.06
RRP6Q12149 URN1YPR152C 1398 nt15.44■□□□□ 0.06
RRP6Q12149 SSA3YBL075C 1950 nt15.39■□□□□ 0.05
RRP6Q12149 YDJ1YNL064C 1230 nt15.39■□□□□ 0.05
RRP6Q12149 RRN5YLR141W 1092 nt15.37■□□□□ 0.05
RRP6Q12149 ARE1YCR048W 1833 nt15.35■□□□□ 0.05
RRP6Q12149 DEP1YAL013W 1218 nt15.34■□□□□ 0.05
RRP6Q12149 OPI9YLR338W 858 nt15.3■□□□□ 0.04
RRP6Q12149 SAH1YER043C 1350 nt15.27■□□□□ 0.04
RRP6Q12149 POA1YBR022W 534 nt15.18■□□□□ 0.02
RRP6Q12149 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.11■□□□□ 0.01
RRP6Q12149 RPN10YHR200W 807 nt15.11■□□□□ 0.01
RRP6Q12149 GAR1YHR089C 618 nt15.08■□□□□ 0
RRP6Q12149 YNL208WYNL208W 600 nt15.07■□□□□ 0
RRP6Q12149 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.06■□□□□ 0
RRP6Q12149 RSB1YOR049C 1065 nt14.93□□□□□ -0.02
RRP6Q12149 BSC6YOL137W 1494 nt14.92□□□□□ -0.02
RRP6Q12149 PUN1YLR414C 792 nt14.83□□□□□ -0.04
RRP6Q12149 BUD23YCR047C 828 nt14.71□□□□□ -0.05
RRP6Q12149 YJR018WYJR018W 363 nt14.71□□□□□ -0.05
RRP6Q12149 PTC2YER089C 1395 nt14.71□□□□□ -0.06
RRP6Q12149 TIR1YER011W 765 nt14.6□□□□□ -0.07
RRP6Q12149 NAB2YGL122C 1578 nt14.56□□□□□ -0.08
RRP6Q12149 SPT5YML010W 3192 nt14.52□□□□□ -0.09
RRP6Q12149 SSA1YAL005C 1929 nt14.51□□□□□ -0.09
RRP6Q12149 YJR120WYJR120W 351 nt14.49□□□□□ -0.09
RRP6Q12149 PST2YDR032C 597 nt14.39□□□□□ -0.11
RRP6Q12149 FIS1YIL065C 468 nt14.36□□□□□ -0.11
RRP6Q12149 DAL1YIR027C 1383 nt14.31□□□□□ -0.12
RRP6Q12149 RPP2BYDR382W 333 nt14.3□□□□□ -0.12
RRP6Q12149 SRB2YHR041C 633 nt14.25□□□□□ -0.13
RRP6Q12149 FPR4YLR449W 1179 nt14.23□□□□□ -0.13
RRP6Q12149 INM2YDR287W 879 nt14.22□□□□□ -0.13
RRP6Q12149 PHO4YFR034C 939 nt14.19□□□□□ -0.14
RRP6Q12149 SSA4YER103W 1929 nt14.07□□□□□ -0.16
RRP6Q12149 Q0182Q0182 405 nt14.06□□□□□ -0.16
RRP6Q12149 YBL100CYBL100C 315 nt14.04□□□□□ -0.16
RRP6Q12149 MEP2YNL142W 1500 nt14.04□□□□□ -0.16
RRP6Q12149 YPS1YLR120C 1710 nt14.03□□□□□ -0.16
RRP6Q12149 BDH2YAL061W 1254 nt14□□□□□ -0.17
RRP6Q12149 WWM1YFL010C 636 nt13.91□□□□□ -0.18
RRP6Q12149 YDR095CYDR095C 411 nt13.9□□□□□ -0.18
RRP6Q12149 FUN26YAL022C 1554 nt13.88□□□□□ -0.19
RRP6Q12149 SHU1YHL006C 453 nt13.86□□□□□ -0.19
RRP6Q12149 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.86□□□□□ -0.19
RRP6Q12149 DCW1YKL046C 1350 nt13.82□□□□□ -0.2
RRP6Q12149 TRM9YML014W 840 nt13.77□□□□□ -0.21
RRP6Q12149 LSM3YLR438C-A 270 nt13.76□□□□□ -0.21
RRP6Q12149 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.73□□□□□ -0.21
RRP6Q12149 YGR021WYGR021W 873 nt13.72□□□□□ -0.21
RRP6Q12149 ALF1YNL148C 765 nt13.7□□□□□ -0.22
RRP6Q12149 HOM6YJR139C 1080 nt13.69□□□□□ -0.22
RRP6Q12149 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.68□□□□□ -0.22
RRP6Q12149 CCT6YDR188W 1641 nt13.68□□□□□ -0.22
RRP6Q12149 PTP1YDL230W 1008 nt13.64□□□□□ -0.23
RRP6Q12149 RPP2AYOL039W 321 nt13.62□□□□□ -0.23
RRP6Q12149 EMI2YDR516C 1503 nt13.62□□□□□ -0.23
RRP6Q12149 YKL097CYKL097C 411 nt13.61□□□□□ -0.23
RRP6Q12149 BDF1YLR399C 2061 nt13.59□□□□□ -0.23
RRP6Q12149 MNP1YGL068W 585 nt13.57□□□□□ -0.24
RRP6Q12149 CAC2YML102W 1407 nt13.56□□□□□ -0.24
RRP6Q12149 SIS1YNL007C 1059 nt13.56□□□□□ -0.24
RRP6Q12149 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.55□□□□□ -0.24
RRP6Q12149 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.55□□□□□ -0.24
RRP6Q12149 YDL221WYDL221W 552 nt13.5□□□□□ -0.25
RRP6Q12149 YMR090WYMR090W 684 nt13.5□□□□□ -0.25
RRP6Q12149 YBR220CYBR220C 1683 nt13.48□□□□□ -0.25
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