Protein–RNA interactions for Protein: Q12418

GIS3, Protein GIS3, yeastyeast

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIS3Q12418 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.05■■□□□ 1.12
GIS3Q12418 NSR1YGR159C 1245 nt21.78■■□□□ 1.08
GIS3Q12418 NOP1YDL014W 984 nt21.4■■□□□ 1.02
GIS3Q12418 YKL036CYKL036C 393 nt19.78■□□□□ 0.76
GIS3Q12418 MDJ1YFL016C 1536 nt19.38■□□□□ 0.69
GIS3Q12418 Q0297Q0297 156 nt18.7■□□□□ 0.58
GIS3Q12418 SRX1YKL086W 384 nt18.67■□□□□ 0.58
GIS3Q12418 YJL027CYJL027C 417 nt18.51■□□□□ 0.55
GIS3Q12418 SCS3YGL126W 1143 nt18.02■□□□□ 0.48
GIS3Q12418 YCR051WYCR051W 669 nt17.8■□□□□ 0.44
GIS3Q12418 YOL085CYOL085C 342 nt17.13■□□□□ 0.33
GIS3Q12418 DBP2YNL112W 1641 nt17.1■□□□□ 0.33
GIS3Q12418 PKP1YIL042C 1185 nt16.94■□□□□ 0.3
GIS3Q12418 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.85■□□□□ 0.29
GIS3Q12418 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.85■□□□□ 0.29
GIS3Q12418 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.85■□□□□ 0.29
GIS3Q12418 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.85■□□□□ 0.29
GIS3Q12418 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.85■□□□□ 0.29
GIS3Q12418 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.85■□□□□ 0.29
GIS3Q12418 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.85■□□□□ 0.29
GIS3Q12418 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.85■□□□□ 0.29
GIS3Q12418 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.85■□□□□ 0.29
GIS3Q12418 RPP1BYDL130W 321 nt16.81■□□□□ 0.28
GIS3Q12418 CCC1YLR220W 969 nt16.79■□□□□ 0.28
GIS3Q12418 YBR190WYBR190W 312 nt16.45■□□□□ 0.22
GIS3Q12418 RTC3YHR087W 336 nt16.19■□□□□ 0.18
GIS3Q12418 RVS167YDR388W 1449 nt16.14■□□□□ 0.17
GIS3Q12418 ATS1YAL020C 1002 nt16.12■□□□□ 0.17
GIS3Q12418 PET122YER153C 765 nt16.08■□□□□ 0.16
GIS3Q12418 SCJ1YMR214W 1134 nt16.04■□□□□ 0.16
GIS3Q12418 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.99■□□□□ 0.15
GIS3Q12418 SCR1SCR1 522 nt15.93■□□□□ 0.14
GIS3Q12418 RRN5YLR141W 1092 nt15.63■□□□□ 0.09
GIS3Q12418 SHR5YOL110W 714 nt15.56■□□□□ 0.08
GIS3Q12418 YDJ1YNL064C 1230 nt15.42■□□□□ 0.06
GIS3Q12418 RSB1YOR049C 1065 nt15.35■□□□□ 0.05
GIS3Q12418 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.31■□□□□ 0.04
GIS3Q12418 DEP1YAL013W 1218 nt15.18■□□□□ 0.02
GIS3Q12418 GAR1YHR089C 618 nt15.16■□□□□ 0.02
GIS3Q12418 URN1YPR152C 1398 nt15.12■□□□□ 0.01
GIS3Q12418 PUT4YOR348C 1884 nt14.91□□□□□ -0.02
GIS3Q12418 PST2YDR032C 597 nt14.9□□□□□ -0.02
GIS3Q12418 RPN10YHR200W 807 nt14.9□□□□□ -0.02
GIS3Q12418 YNL208WYNL208W 600 nt14.89□□□□□ -0.03
GIS3Q12418 OPI9YLR338W 858 nt14.85□□□□□ -0.03
GIS3Q12418 SAH1YER043C 1350 nt14.8□□□□□ -0.04
GIS3Q12418 ARE1YCR048W 1833 nt14.66□□□□□ -0.06
GIS3Q12418 TIR1YER011W 765 nt14.62□□□□□ -0.07
GIS3Q12418 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.51□□□□□ -0.09
GIS3Q12418 POA1YBR022W 534 nt14.51□□□□□ -0.09
GIS3Q12418 PUN1YLR414C 792 nt14.43□□□□□ -0.1
GIS3Q12418 SSA1YAL005C 1929 nt14.43□□□□□ -0.1
GIS3Q12418 YJR018WYJR018W 363 nt14.42□□□□□ -0.1
GIS3Q12418 YKL097CYKL097C 411 nt14.38□□□□□ -0.11
GIS3Q12418 SHU1YHL006C 453 nt14.32□□□□□ -0.12
GIS3Q12418 PTC2YER089C 1395 nt14.29□□□□□ -0.12
GIS3Q12418 BUD23YCR047C 828 nt14.23□□□□□ -0.13
GIS3Q12418 SRB2YHR041C 633 nt14.19□□□□□ -0.14
GIS3Q12418 RPP2BYDR382W 333 nt14.16□□□□□ -0.14
GIS3Q12418 YJR120WYJR120W 351 nt14.16□□□□□ -0.14
GIS3Q12418 BSC6YOL137W 1494 nt14.16□□□□□ -0.14
GIS3Q12418 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.15□□□□□ -0.14
GIS3Q12418 NAB2YGL122C 1578 nt14.06□□□□□ -0.16
GIS3Q12418 WWM1YFL010C 636 nt14□□□□□ -0.17
GIS3Q12418 FPR4YLR449W 1179 nt13.96□□□□□ -0.17
GIS3Q12418 DAL1YIR027C 1383 nt13.9□□□□□ -0.18
GIS3Q12418 INM2YDR287W 879 nt13.88□□□□□ -0.19
GIS3Q12418 YGR021WYGR021W 873 nt13.88□□□□□ -0.19
GIS3Q12418 FIS1YIL065C 468 nt13.85□□□□□ -0.19
GIS3Q12418 BDH2YAL061W 1254 nt13.85□□□□□ -0.19
GIS3Q12418 MNP1YGL068W 585 nt13.83□□□□□ -0.2
GIS3Q12418 HOM6YJR139C 1080 nt13.83□□□□□ -0.2
GIS3Q12418 YBL100CYBL100C 315 nt13.79□□□□□ -0.2
GIS3Q12418 PHO4YFR034C 939 nt13.77□□□□□ -0.21
GIS3Q12418 YOR139CYOR139C 393 nt13.76□□□□□ -0.21
GIS3Q12418 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.73□□□□□ -0.21
GIS3Q12418 SSA3YBL075C 1950 nt13.71□□□□□ -0.21
GIS3Q12418 NPL3YDR432W 1245 nt13.69□□□□□ -0.22
GIS3Q12418 RKM5YLR137W 1104 nt13.65□□□□□ -0.22
GIS3Q12418 LSM3YLR438C-A 270 nt13.65□□□□□ -0.22
GIS3Q12418 TRM9YML014W 840 nt13.62□□□□□ -0.23
GIS3Q12418 FUN26YAL022C 1554 nt13.62□□□□□ -0.23
GIS3Q12418 YOL037CYOL037C 354 nt13.56□□□□□ -0.24
GIS3Q12418 YPS1YLR120C 1710 nt13.45□□□□□ -0.26
GIS3Q12418 ALF1YNL148C 765 nt13.45□□□□□ -0.26
GIS3Q12418 CCT6YDR188W 1641 nt13.42□□□□□ -0.26
GIS3Q12418 YDR095CYDR095C 411 nt13.37□□□□□ -0.27
GIS3Q12418 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.37□□□□□ -0.27
GIS3Q12418 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.34□□□□□ -0.27
GIS3Q12418 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.34□□□□□ -0.27
GIS3Q12418 SPT5YML010W 3192 nt13.31□□□□□ -0.28
GIS3Q12418 MEP2YNL142W 1500 nt13.26□□□□□ -0.29
GIS3Q12418 YLR281CYLR281C 468 nt13.24□□□□□ -0.29
GIS3Q12418 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.23□□□□□ -0.29
GIS3Q12418 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.23□□□□□ -0.29
GIS3Q12418 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.23□□□□□ -0.29
GIS3Q12418 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.23□□□□□ -0.29
GIS3Q12418 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.23□□□□□ -0.29
GIS3Q12418 WHI5YOR083W 888 nt13.23□□□□□ -0.29
GIS3Q12418 PUS2YGL063W 1113 nt13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.8 ms