Protein–RNA interactions for Protein: Q12211

PUS1, tRNA pseudouridine synthase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS1Q12211 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.06■■□□□ 1.12
PUS1Q12211 NSR1YGR159C 1245 nt21.71■■□□□ 1.07
PUS1Q12211 NOP1YDL014W 984 nt21.53■■□□□ 1.04
PUS1Q12211 YKL036CYKL036C 393 nt20.07■□□□□ 0.8
PUS1Q12211 MDJ1YFL016C 1536 nt19.09■□□□□ 0.65
PUS1Q12211 Q0297Q0297 156 nt18.91■□□□□ 0.62
PUS1Q12211 SRX1YKL086W 384 nt18.8■□□□□ 0.6
PUS1Q12211 YJL027CYJL027C 417 nt18.78■□□□□ 0.6
PUS1Q12211 SCS3YGL126W 1143 nt18.37■□□□□ 0.53
PUS1Q12211 YCR051WYCR051W 669 nt17.86■□□□□ 0.45
PUS1Q12211 YOL085CYOL085C 342 nt17.36■□□□□ 0.37
PUS1Q12211 PKP1YIL042C 1185 nt17.07■□□□□ 0.32
PUS1Q12211 RPP1BYDL130W 321 nt16.97■□□□□ 0.31
PUS1Q12211 DBP2YNL112W 1641 nt16.94■□□□□ 0.3
PUS1Q12211 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.89■□□□□ 0.29
PUS1Q12211 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.89■□□□□ 0.29
PUS1Q12211 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.89■□□□□ 0.29
PUS1Q12211 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.89■□□□□ 0.29
PUS1Q12211 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.89■□□□□ 0.29
PUS1Q12211 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.89■□□□□ 0.29
PUS1Q12211 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.89■□□□□ 0.29
PUS1Q12211 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.89■□□□□ 0.29
PUS1Q12211 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.89■□□□□ 0.29
PUS1Q12211 CCC1YLR220W 969 nt16.7■□□□□ 0.26
PUS1Q12211 SCJ1YMR214W 1134 nt16.54■□□□□ 0.24
PUS1Q12211 ATS1YAL020C 1002 nt16.48■□□□□ 0.23
PUS1Q12211 SSA3YBL075C 1950 nt16.44■□□□□ 0.22
PUS1Q12211 YBR190WYBR190W 312 nt16.21■□□□□ 0.19
PUS1Q12211 PET122YER153C 765 nt16.19■□□□□ 0.18
PUS1Q12211 SCR1SCR1 522 nt16.09■□□□□ 0.17
PUS1Q12211 RVS167YDR388W 1449 nt16.03■□□□□ 0.16
PUS1Q12211 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.03■□□□□ 0.16
PUS1Q12211 RTC3YHR087W 336 nt15.87■□□□□ 0.13
PUS1Q12211 RRN5YLR141W 1092 nt15.73■□□□□ 0.11
PUS1Q12211 SHR5YOL110W 714 nt15.52■□□□□ 0.08
PUS1Q12211 YDJ1YNL064C 1230 nt15.51■□□□□ 0.07
PUS1Q12211 RSB1YOR049C 1065 nt15.5■□□□□ 0.07
PUS1Q12211 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.42■□□□□ 0.06
PUS1Q12211 PST2YDR032C 597 nt15.21■□□□□ 0.03
PUS1Q12211 GAR1YHR089C 618 nt15.13■□□□□ 0.01
PUS1Q12211 DEP1YAL013W 1218 nt14.99□□□□□ -0.01
PUS1Q12211 URN1YPR152C 1398 nt14.94□□□□□ -0.02
PUS1Q12211 RPN10YHR200W 807 nt14.8□□□□□ -0.04
PUS1Q12211 YNL208WYNL208W 600 nt14.79□□□□□ -0.04
PUS1Q12211 YKL097CYKL097C 411 nt14.76□□□□□ -0.05
PUS1Q12211 PUT4YOR348C 1884 nt14.73□□□□□ -0.05
PUS1Q12211 OPI9YLR338W 858 nt14.67□□□□□ -0.06
PUS1Q12211 TIR1YER011W 765 nt14.61□□□□□ -0.07
PUS1Q12211 SHU1YHL006C 453 nt14.55□□□□□ -0.08
PUS1Q12211 SAH1YER043C 1350 nt14.5□□□□□ -0.09
PUS1Q12211 SSA1YAL005C 1929 nt14.37□□□□□ -0.11
PUS1Q12211 ARE1YCR048W 1833 nt14.34□□□□□ -0.11
PUS1Q12211 SSA4YER103W 1929 nt14.29□□□□□ -0.12
PUS1Q12211 SPT5YML010W 3192 nt14.28□□□□□ -0.12
PUS1Q12211 YJR018WYJR018W 363 nt14.27□□□□□ -0.13
PUS1Q12211 PUN1YLR414C 792 nt14.27□□□□□ -0.13
PUS1Q12211 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.24□□□□□ -0.13
PUS1Q12211 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.19□□□□□ -0.14
PUS1Q12211 SRB2YHR041C 633 nt14.17□□□□□ -0.14
PUS1Q12211 POA1YBR022W 534 nt14.13□□□□□ -0.15
PUS1Q12211 YOR139CYOR139C 393 nt14.1□□□□□ -0.15
PUS1Q12211 YJR120WYJR120W 351 nt14.08□□□□□ -0.16
PUS1Q12211 BSC6YOL137W 1494 nt14.06□□□□□ -0.16
PUS1Q12211 RPP2BYDR382W 333 nt14.06□□□□□ -0.16
PUS1Q12211 PTC2YER089C 1395 nt14.03□□□□□ -0.16
PUS1Q12211 YGR021WYGR021W 873 nt14.02□□□□□ -0.17
PUS1Q12211 WWM1YFL010C 636 nt14□□□□□ -0.17
PUS1Q12211 NPL3YDR432W 1245 nt13.97□□□□□ -0.17
PUS1Q12211 HOM6YJR139C 1080 nt13.96□□□□□ -0.17
PUS1Q12211 MNP1YGL068W 585 nt13.94□□□□□ -0.18
PUS1Q12211 BUD23YCR047C 828 nt13.88□□□□□ -0.19
PUS1Q12211 BDF1YLR399C 2061 nt13.87□□□□□ -0.19
PUS1Q12211 NAB2YGL122C 1578 nt13.82□□□□□ -0.2
PUS1Q12211 YOL037CYOL037C 354 nt13.81□□□□□ -0.2
PUS1Q12211 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.8□□□□□ -0.2
PUS1Q12211 BDH2YAL061W 1254 nt13.8□□□□□ -0.2
PUS1Q12211 RKM5YLR137W 1104 nt13.76□□□□□ -0.21
PUS1Q12211 PAC11YDR488C 1602 nt13.75□□□□□ -0.21
PUS1Q12211 INM2YDR287W 879 nt13.73□□□□□ -0.21
PUS1Q12211 DAL1YIR027C 1383 nt13.69□□□□□ -0.22
PUS1Q12211 TAT1YBR069C 1860 nt13.67□□□□□ -0.22
PUS1Q12211 FIS1YIL065C 468 nt13.67□□□□□ -0.22
PUS1Q12211 FPR4YLR449W 1179 nt13.67□□□□□ -0.22
PUS1Q12211 LSM3YLR438C-A 270 nt13.65□□□□□ -0.22
PUS1Q12211 YBL100CYBL100C 315 nt13.65□□□□□ -0.22
PUS1Q12211 PHO4YFR034C 939 nt13.58□□□□□ -0.24
PUS1Q12211 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.52□□□□□ -0.25
PUS1Q12211 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.52□□□□□ -0.25
PUS1Q12211 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.52□□□□□ -0.25
PUS1Q12211 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.52□□□□□ -0.25
PUS1Q12211 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.52□□□□□ -0.25
PUS1Q12211 TRM9YML014W 840 nt13.49□□□□□ -0.25
PUS1Q12211 FUN26YAL022C 1554 nt13.48□□□□□ -0.25
PUS1Q12211 NVJ2YPR091C 2313 nt13.47□□□□□ -0.25
PUS1Q12211 Q0182Q0182 405 nt13.45□□□□□ -0.26
PUS1Q12211 YLR281CYLR281C 468 nt13.43□□□□□ -0.26
PUS1Q12211 PUS2YGL063W 1113 nt13.38□□□□□ -0.27
PUS1Q12211 WHI5YOR083W 888 nt13.37□□□□□ -0.27
PUS1Q12211 CCT6YDR188W 1641 nt13.35□□□□□ -0.27
PUS1Q12211 MEP2YNL142W 1500 nt13.33□□□□□ -0.28
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