Protein–RNA interactions for Protein: P15179

MSD1, Aspartate--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSD1P15179 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.05■■□□□ 1.12
MSD1P15179 NOP1YDL014W 984 nt21.64■■□□□ 1.05
MSD1P15179 NSR1YGR159C 1245 nt21.48■■□□□ 1.03
MSD1P15179 YKL036CYKL036C 393 nt20.39■□□□□ 0.85
MSD1P15179 YJL027CYJL027C 417 nt19.13■□□□□ 0.65
MSD1P15179 Q0297Q0297 156 nt19.06■□□□□ 0.64
MSD1P15179 SRX1YKL086W 384 nt18.88■□□□□ 0.61
MSD1P15179 SCS3YGL126W 1143 nt18.76■□□□□ 0.59
MSD1P15179 MDJ1YFL016C 1536 nt18.61■□□□□ 0.57
MSD1P15179 YCR051WYCR051W 669 nt17.97■□□□□ 0.47
MSD1P15179 YOL085CYOL085C 342 nt17.61■□□□□ 0.41
MSD1P15179 PKP1YIL042C 1185 nt17.3■□□□□ 0.36
MSD1P15179 SCJ1YMR214W 1134 nt17.24■□□□□ 0.35
MSD1P15179 RPP1BYDL130W 321 nt17.11■□□□□ 0.33
MSD1P15179 ATS1YAL020C 1002 nt16.92■□□□□ 0.3
MSD1P15179 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.78■□□□□ 0.28
MSD1P15179 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.78■□□□□ 0.28
MSD1P15179 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.78■□□□□ 0.28
MSD1P15179 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.78■□□□□ 0.28
MSD1P15179 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.78■□□□□ 0.28
MSD1P15179 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.78■□□□□ 0.28
MSD1P15179 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.78■□□□□ 0.28
MSD1P15179 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.78■□□□□ 0.28
MSD1P15179 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.78■□□□□ 0.28
MSD1P15179 CCC1YLR220W 969 nt16.63■□□□□ 0.25
MSD1P15179 DBP2YNL112W 1641 nt16.62■□□□□ 0.25
MSD1P15179 SCR1SCR1 522 nt16.3■□□□□ 0.2
MSD1P15179 PET122YER153C 765 nt16.27■□□□□ 0.2
MSD1P15179 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.04■□□□□ 0.16
MSD1P15179 RRN5YLR141W 1092 nt15.86■□□□□ 0.13
MSD1P15179 RVS167YDR388W 1449 nt15.85■□□□□ 0.13
MSD1P15179 YBR190WYBR190W 312 nt15.77■□□□□ 0.12
MSD1P15179 RSB1YOR049C 1065 nt15.71■□□□□ 0.11
MSD1P15179 RTC3YHR087W 336 nt15.68■□□□□ 0.1
MSD1P15179 PST2YDR032C 597 nt15.57■□□□□ 0.08
MSD1P15179 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.55■□□□□ 0.08
MSD1P15179 YDJ1YNL064C 1230 nt15.52■□□□□ 0.08
MSD1P15179 SHR5YOL110W 714 nt15.36■□□□□ 0.05
MSD1P15179 YKL097CYKL097C 411 nt15.25■□□□□ 0.03
MSD1P15179 GAR1YHR089C 618 nt15.1■□□□□ 0.01
MSD1P15179 SHU1YHL006C 453 nt14.83□□□□□ -0.04
MSD1P15179 DEP1YAL013W 1218 nt14.75□□□□□ -0.05
MSD1P15179 URN1YPR152C 1398 nt14.63□□□□□ -0.07
MSD1P15179 SSA3YBL075C 1950 nt14.61□□□□□ -0.07
MSD1P15179 YNL208WYNL208W 600 nt14.6□□□□□ -0.07
MSD1P15179 RPN10YHR200W 807 nt14.59□□□□□ -0.07
MSD1P15179 TIR1YER011W 765 nt14.57□□□□□ -0.08
MSD1P15179 YOR139CYOR139C 393 nt14.5□□□□□ -0.09
MSD1P15179 PUT4YOR348C 1884 nt14.47□□□□□ -0.09
MSD1P15179 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.45□□□□□ -0.1
MSD1P15179 NPL3YDR432W 1245 nt14.35□□□□□ -0.11
MSD1P15179 OPI9YLR338W 858 nt14.32□□□□□ -0.12
MSD1P15179 SSA1YAL005C 1929 nt14.26□□□□□ -0.13
MSD1P15179 YGR021WYGR021W 873 nt14.11□□□□□ -0.15
MSD1P15179 SAH1YER043C 1350 nt14.09□□□□□ -0.15
MSD1P15179 ARE1YCR048W 1833 nt14.07□□□□□ -0.16
MSD1P15179 SRB2YHR041C 633 nt14.06□□□□□ -0.16
MSD1P15179 YOL037CYOL037C 354 nt14.04□□□□□ -0.16
MSD1P15179 MNP1YGL068W 585 nt14.03□□□□□ -0.16
MSD1P15179 HOM6YJR139C 1080 nt14.03□□□□□ -0.16
MSD1P15179 YJR018WYJR018W 363 nt14□□□□□ -0.17
MSD1P15179 WWM1YFL010C 636 nt13.99□□□□□ -0.17
MSD1P15179 POA1YBR022W 534 nt13.98□□□□□ -0.17
MSD1P15179 PUN1YLR414C 792 nt13.94□□□□□ -0.18
MSD1P15179 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.91□□□□□ -0.18
MSD1P15179 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.91□□□□□ -0.18
MSD1P15179 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.91□□□□□ -0.18
MSD1P15179 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.91□□□□□ -0.18
MSD1P15179 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.91□□□□□ -0.18
MSD1P15179 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.91□□□□□ -0.18
MSD1P15179 RPP2BYDR382W 333 nt13.89□□□□□ -0.19
MSD1P15179 RKM5YLR137W 1104 nt13.84□□□□□ -0.19
MSD1P15179 YJR120WYJR120W 351 nt13.81□□□□□ -0.2
MSD1P15179 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.8□□□□□ -0.2
MSD1P15179 Q0182Q0182 405 nt13.79□□□□□ -0.2
MSD1P15179 BSC6YOL137W 1494 nt13.78□□□□□ -0.2
MSD1P15179 PUS2YGL063W 1113 nt13.66□□□□□ -0.22
MSD1P15179 PTC2YER089C 1395 nt13.66□□□□□ -0.22
MSD1P15179 BDH2YAL061W 1254 nt13.65□□□□□ -0.22
MSD1P15179 YLR281CYLR281C 468 nt13.62□□□□□ -0.23
MSD1P15179 MOT3YMR070W 1473 nt13.57□□□□□ -0.24
MSD1P15179 LSM3YLR438C-A 270 nt13.57□□□□□ -0.24
MSD1P15179 BUD23YCR047C 828 nt13.54□□□□□ -0.24
MSD1P15179 WHI5YOR083W 888 nt13.52□□□□□ -0.25
MSD1P15179 INM2YDR287W 879 nt13.46□□□□□ -0.25
MSD1P15179 SPT5YML010W 3192 nt13.46□□□□□ -0.26
MSD1P15179 NAB2YGL122C 1578 nt13.42□□□□□ -0.26
MSD1P15179 YBL100CYBL100C 315 nt13.39□□□□□ -0.27
MSD1P15179 FPR4YLR449W 1179 nt13.35□□□□□ -0.27
MSD1P15179 DAL1YIR027C 1383 nt13.34□□□□□ -0.27
MSD1P15179 FMP45YDL222C 930 nt13.33□□□□□ -0.28
MSD1P15179 TRM9YML014W 840 nt13.33□□□□□ -0.28
MSD1P15179 DSK2YMR276W 1122 nt13.3□□□□□ -0.28
MSD1P15179 IMP2'YIL154C 1041 nt13.28□□□□□ -0.28
MSD1P15179 FIS1YIL065C 468 nt13.25□□□□□ -0.29
MSD1P15179 FUN26YAL022C 1554 nt13.24□□□□□ -0.29
MSD1P15179 MRPL8YJL063C 717 nt13.23□□□□□ -0.29
MSD1P15179 YCH1YGR203W 447 nt13.22□□□□□ -0.29
MSD1P15179 YPR011CYPR011C 981 nt13.22□□□□□ -0.29
MSD1P15179 SSA4YER103W 1929 nt13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.3 ms