RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	UGA4	P32837	571 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	HSP78	P33416	811 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	NIC96	P34077	839 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	MRP8	P35719	219 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	BAP2	P38084	609 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	DSS1	P39112	969 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	SAP185	P40856	1058 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	PFD1	P46988	109 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	ISU1	Q03020	165 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	ATG20	Q07528	640 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	MEF1	P25039	761 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	DBF20	P32328	564 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	SMC1	P32908	1225 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	RRN3	P36070	627 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	VBA5	P36172	582 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	GDH3	P39708	457 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	IRR1	P40541	1150 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	SUM1	P46676	1062 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	JJJ3	P47138	172 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	MAL11	P53048	616 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	YPL109C	Q02981	657 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	PKH1	Q03407	766 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	HFD1	Q04458	532 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	GIC2	Q06648	383 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	MRL1	Q06815	381 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	SSP2	Q08646	371 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	MED1	Q12321	566 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	AGP1	P25376	633 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	DAL1	P32375	460 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	SAS3	P34218	831 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	KTR4	P38131	464 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	PIC2	P40035	300 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	TMA108	P40462	946 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	HXT8	P40886	569 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	ALR2	P43553	858 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	HOL1	P53389	586 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	HEH2	Q03281	663 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	PSH1	Q12161	406 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	SPT7	P35177	1332 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	SWI5	P08153	709 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	PEX5	P35056	612 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	YHL041W	P38730	149 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	ICP55	P40051	511 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	YGR016W	P53209	190 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	RCF1	Q03713	159 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	SHE9	Q04172	456 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	MLC2	Q06580	163 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	PHM7	Q12252	991 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	MRPL33	P20084	86 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
SLX8	YER116C	KCC4	P25389	1037 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	MKK2	P32491	506 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	NUP120	P35729	1037 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	YKL133C	P36066	463 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	SEA4	P38164	1038 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	PBY1	P38254	753 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	RXT2	P38255	430 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	CAJ1	P39101	391 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	IML2	P47031	731 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	ULP1	Q02724	621 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	VPS30	Q02948	557 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	ADI1	Q03677	179 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	HSP42	Q12329	375 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	PXA2	P34230	853 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	YKL050C	P35736	922 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	RKM3	P38222	552 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	RAD55	P38953	406 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	HIS6	P40545	261 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	XKS1	P42826	600 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	MSN5	P52918	1224 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	MON1	P53129	644 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	BTN2	P53286	410 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67

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