Protein–RNA interactions for Protein: Q12000

TMA46, Translation machinery-associated protein 46, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA46Q12000 NSR1YGR159C 1245 nt20.16■□□□□ 0.82
TMA46Q12000 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.03■□□□□ 0.8
TMA46Q12000 NOP1YDL014W 984 nt19.29■□□□□ 0.68
TMA46Q12000 MDJ1YFL016C 1536 nt18.28■□□□□ 0.52
TMA46Q12000 YKL036CYKL036C 393 nt17.53■□□□□ 0.4
TMA46Q12000 SRX1YKL086W 384 nt16.88■□□□□ 0.29
TMA46Q12000 Q0297Q0297 156 nt16.81■□□□□ 0.28
TMA46Q12000 YJL027CYJL027C 417 nt16.78■□□□□ 0.28
TMA46Q12000 DBP2YNL112W 1641 nt16.05■□□□□ 0.16
TMA46Q12000 YCR051WYCR051W 669 nt16.01■□□□□ 0.15
TMA46Q12000 SCS3YGL126W 1143 nt15.82■□□□□ 0.12
TMA46Q12000 YBR190WYBR190W 312 nt15.61■□□□□ 0.09
TMA46Q12000 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TMA46Q12000 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TMA46Q12000 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TMA46Q12000 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TMA46Q12000 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TMA46Q12000 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TMA46Q12000 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TMA46Q12000 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TMA46Q12000 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TMA46Q12000 CCC1YLR220W 969 nt15.34■□□□□ 0.05
TMA46Q12000 RTC3YHR087W 336 nt15.25■□□□□ 0.03
TMA46Q12000 YOL085CYOL085C 342 nt15.23■□□□□ 0.03
TMA46Q12000 RPP1BYDL130W 321 nt15.09■□□□□ 0.01
TMA46Q12000 PKP1YIL042C 1185 nt15.07■□□□□ 0
TMA46Q12000 RVS167YDR388W 1449 nt14.91□□□□□ -0.02
TMA46Q12000 SCJ1YMR214W 1134 nt14.87□□□□□ -0.03
TMA46Q12000 SSA3YBL075C 1950 nt14.79□□□□□ -0.04
TMA46Q12000 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.54□□□□□ -0.08
TMA46Q12000 PET122YER153C 765 nt14.5□□□□□ -0.09
TMA46Q12000 PUT4YOR348C 1884 nt14.48□□□□□ -0.09
TMA46Q12000 Q0182Q0182 405 nt14.44□□□□□ -0.1
TMA46Q12000 SHR5YOL110W 714 nt14.35□□□□□ -0.11
TMA46Q12000 URN1YPR152C 1398 nt14.18□□□□□ -0.14
TMA46Q12000 SCR1SCR1 522 nt14.17□□□□□ -0.14
TMA46Q12000 ARE1YCR048W 1833 nt14.11□□□□□ -0.15
TMA46Q12000 DEP1YAL013W 1218 nt14.11□□□□□ -0.15
TMA46Q12000 SAH1YER043C 1350 nt14.06□□□□□ -0.16
TMA46Q12000 ATS1YAL020C 1002 nt14.05□□□□□ -0.16
TMA46Q12000 RRN5YLR141W 1092 nt14.04□□□□□ -0.16
TMA46Q12000 YDJ1YNL064C 1230 nt14.04□□□□□ -0.16
TMA46Q12000 OPI9YLR338W 858 nt14.03□□□□□ -0.16
TMA46Q12000 MOT3YMR070W 1473 nt13.99□□□□□ -0.17
TMA46Q12000 POA1YBR022W 534 nt13.99□□□□□ -0.17
TMA46Q12000 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.92□□□□□ -0.18
TMA46Q12000 RPN10YHR200W 807 nt13.82□□□□□ -0.2
TMA46Q12000 GAR1YHR089C 618 nt13.81□□□□□ -0.2
TMA46Q12000 YNL208WYNL208W 600 nt13.8□□□□□ -0.2
TMA46Q12000 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.76□□□□□ -0.21
TMA46Q12000 BSC6YOL137W 1494 nt13.74□□□□□ -0.21
TMA46Q12000 RSB1YOR049C 1065 nt13.63□□□□□ -0.23
TMA46Q12000 PUN1YLR414C 792 nt13.58□□□□□ -0.24
TMA46Q12000 BUD23YCR047C 828 nt13.57□□□□□ -0.24
TMA46Q12000 PTC2YER089C 1395 nt13.51□□□□□ -0.25
TMA46Q12000 YJR018WYJR018W 363 nt13.49□□□□□ -0.25
TMA46Q12000 SPT5YML010W 3192 nt13.38□□□□□ -0.27
TMA46Q12000 NAB2YGL122C 1578 nt13.36□□□□□ -0.27
TMA46Q12000 TIR1YER011W 765 nt13.35□□□□□ -0.27
TMA46Q12000 YJR120WYJR120W 351 nt13.3□□□□□ -0.28
TMA46Q12000 SSA1YAL005C 1929 nt13.3□□□□□ -0.28
TMA46Q12000 FIS1YIL065C 468 nt13.18□□□□□ -0.3
TMA46Q12000 DAL1YIR027C 1383 nt13.13□□□□□ -0.31
TMA46Q12000 FPR4YLR449W 1179 nt13.1□□□□□ -0.31
TMA46Q12000 SRB2YHR041C 633 nt13.09□□□□□ -0.31
TMA46Q12000 PST2YDR032C 597 nt13.08□□□□□ -0.32
TMA46Q12000 RPP2BYDR382W 333 nt13.08□□□□□ -0.32
TMA46Q12000 INM2YDR287W 879 nt13.02□□□□□ -0.33
TMA46Q12000 PHO4YFR034C 939 nt13.02□□□□□ -0.33
TMA46Q12000 SSA4YER103W 1929 nt13.01□□□□□ -0.33
TMA46Q12000 MEP2YNL142W 1500 nt12.93□□□□□ -0.34
TMA46Q12000 YPS1YLR120C 1710 nt12.88□□□□□ -0.35
TMA46Q12000 YBL100CYBL100C 315 nt12.87□□□□□ -0.35
TMA46Q12000 BDH2YAL061W 1254 nt12.81□□□□□ -0.36
TMA46Q12000 DCW1YKL046C 1350 nt12.77□□□□□ -0.37
TMA46Q12000 YDR095CYDR095C 411 nt12.75□□□□□ -0.37
TMA46Q12000 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.75□□□□□ -0.37
TMA46Q12000 WWM1YFL010C 636 nt12.74□□□□□ -0.37
TMA46Q12000 FUN26YAL022C 1554 nt12.73□□□□□ -0.37
TMA46Q12000 BDF1YLR399C 2061 nt12.66□□□□□ -0.38
TMA46Q12000 SHU1YHL006C 453 nt12.64□□□□□ -0.39
TMA46Q12000 TRM9YML014W 840 nt12.6□□□□□ -0.39
TMA46Q12000 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.59□□□□□ -0.39
TMA46Q12000 LSM3YLR438C-A 270 nt12.56□□□□□ -0.4
TMA46Q12000 ALF1YNL148C 765 nt12.56□□□□□ -0.4
TMA46Q12000 PTP1YDL230W 1008 nt12.55□□□□□ -0.4
TMA46Q12000 EMI2YDR516C 1503 nt12.55□□□□□ -0.4
TMA46Q12000 CAC2YML102W 1407 nt12.52□□□□□ -0.41
TMA46Q12000 CCT6YDR188W 1641 nt12.51□□□□□ -0.41
TMA46Q12000 RPP2AYOL039W 321 nt12.5□□□□□ -0.41
TMA46Q12000 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.49□□□□□ -0.41
TMA46Q12000 YGR021WYGR021W 873 nt12.49□□□□□ -0.41
TMA46Q12000 HOM6YJR139C 1080 nt12.49□□□□□ -0.41
TMA46Q12000 TAT1YBR069C 1860 nt12.46□□□□□ -0.42
TMA46Q12000 YBR220CYBR220C 1683 nt12.44□□□□□ -0.42
TMA46Q12000 YDL221WYDL221W 552 nt12.43□□□□□ -0.42
TMA46Q12000 MNP1YGL068W 585 nt12.42□□□□□ -0.42
TMA46Q12000 SIS1YNL007C 1059 nt12.42□□□□□ -0.42
TMA46Q12000 YMR090WYMR090W 684 nt12.41□□□□□ -0.42
TMA46Q12000 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.38□□□□□ -0.43
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