Protein–RNA interactions for Protein: P52918

MSN5, Protein MSN5, yeastyeast

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Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSN5P52918 YML009W-BYML009W-B 477 nt25.36■■□□□ 1.65
MSN5P52918 NOP1YDL014W 984 nt24.97■■□□□ 1.59
MSN5P52918 NSR1YGR159C 1245 nt24.56■■□□□ 1.52
MSN5P52918 YKL036CYKL036C 393 nt23.74■■□□□ 1.39
MSN5P52918 YJL027CYJL027C 417 nt22.29■■□□□ 1.16
MSN5P52918 Q0297Q0297 156 nt22.11■■□□□ 1.13
MSN5P52918 SCS3YGL126W 1143 nt21.98■■□□□ 1.11
MSN5P52918 SRX1YKL086W 384 nt21.82■■□□□ 1.08
MSN5P52918 MDJ1YFL016C 1536 nt21.09■□□□□ 0.97
MSN5P52918 YCR051WYCR051W 669 nt20.75■□□□□ 0.91
MSN5P52918 YOL085CYOL085C 342 nt20.54■□□□□ 0.88
MSN5P52918 SCJ1YMR214W 1134 nt20.44■□□□□ 0.86
MSN5P52918 PKP1YIL042C 1185 nt20.13■□□□□ 0.81
MSN5P52918 ATS1YAL020C 1002 nt19.88■□□□□ 0.77
MSN5P52918 RPP1BYDL130W 321 nt19.84■□□□□ 0.77
MSN5P52918 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.29■□□□□ 0.68
MSN5P52918 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.29■□□□□ 0.68
MSN5P52918 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.29■□□□□ 0.68
MSN5P52918 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.29■□□□□ 0.68
MSN5P52918 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.29■□□□□ 0.68
MSN5P52918 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.29■□□□□ 0.68
MSN5P52918 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.29■□□□□ 0.68
MSN5P52918 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.29■□□□□ 0.68
MSN5P52918 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.29■□□□□ 0.68
MSN5P52918 CCC1YLR220W 969 nt19.09■□□□□ 0.65
MSN5P52918 DBP2YNL112W 1641 nt18.97■□□□□ 0.63
MSN5P52918 PET122YER153C 765 nt18.86■□□□□ 0.61
MSN5P52918 SCR1SCR1 522 nt18.86■□□□□ 0.61
MSN5P52918 RTC3YHR087W 336 nt18.54■□□□□ 0.56
MSN5P52918 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.5■□□□□ 0.55
MSN5P52918 RRN5YLR141W 1092 nt18.4■□□□□ 0.54
MSN5P52918 PST2YDR032C 597 nt18.29■□□□□ 0.52
MSN5P52918 RSB1YOR049C 1065 nt18.24■□□□□ 0.51
MSN5P52918 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.04■□□□□ 0.48
MSN5P52918 RVS167YDR388W 1449 nt18■□□□□ 0.47
MSN5P52918 YKL097CYKL097C 411 nt17.95■□□□□ 0.46
MSN5P52918 YDJ1YNL064C 1230 nt17.9■□□□□ 0.46
MSN5P52918 YBR190WYBR190W 312 nt17.8■□□□□ 0.44
MSN5P52918 SHR5YOL110W 714 nt17.57■□□□□ 0.4
MSN5P52918 SHU1YHL006C 453 nt17.36■□□□□ 0.37
MSN5P52918 GAR1YHR089C 618 nt17.36■□□□□ 0.37
MSN5P52918 YOR139CYOR139C 393 nt17.1■□□□□ 0.33
MSN5P52918 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.85■□□□□ 0.29
MSN5P52918 DEP1YAL013W 1218 nt16.8■□□□□ 0.28
MSN5P52918 NPL3YDR432W 1245 nt16.78■□□□□ 0.28
MSN5P52918 TIR1YER011W 765 nt16.75■□□□□ 0.27
MSN5P52918 YNL208WYNL208W 600 nt16.64■□□□□ 0.25
MSN5P52918 URN1YPR152C 1398 nt16.61■□□□□ 0.25
MSN5P52918 RPN10YHR200W 807 nt16.54■□□□□ 0.24
MSN5P52918 SSA1YAL005C 1929 nt16.39■□□□□ 0.21
MSN5P52918 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt16.38■□□□□ 0.21
MSN5P52918 IMT4tM(CAU)E 72 nt16.38■□□□□ 0.21
MSN5P52918 IMT3tM(CAU)J3 72 nt16.38■□□□□ 0.21
MSN5P52918 IMT1tM(CAU)O1 72 nt16.38■□□□□ 0.21
MSN5P52918 IMT2tM(CAU)P 72 nt16.38■□□□□ 0.21
MSN5P52918 YOL037CYOL037C 354 nt16.33■□□□□ 0.2
MSN5P52918 MNP1YGL068W 585 nt16.29■□□□□ 0.2
MSN5P52918 YGR021WYGR021W 873 nt16.28■□□□□ 0.2
MSN5P52918 HOM6YJR139C 1080 nt16.27■□□□□ 0.2
MSN5P52918 SRB2YHR041C 633 nt16.26■□□□□ 0.19
MSN5P52918 OPI9YLR338W 858 nt16.22■□□□□ 0.19
MSN5P52918 WWM1YFL010C 636 nt16.14■□□□□ 0.17
MSN5P52918 MOT3YMR070W 1473 nt16.05■□□□□ 0.16
MSN5P52918 RKM5YLR137W 1104 nt16.03■□□□□ 0.16
MSN5P52918 BSC6YOL137W 1494 nt16.01■□□□□ 0.15
MSN5P52918 PUS2YGL063W 1113 nt15.97■□□□□ 0.15
MSN5P52918 SAH1YER043C 1350 nt15.91■□□□□ 0.14
MSN5P52918 YLR281CYLR281C 468 nt15.9■□□□□ 0.14
MSN5P52918 YJR018WYJR018W 363 nt15.89■□□□□ 0.13
MSN5P52918 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.88■□□□□ 0.13
MSN5P52918 YJR120WYJR120W 351 nt15.82■□□□□ 0.12
MSN5P52918 RPP2BYDR382W 333 nt15.77■□□□□ 0.12
MSN5P52918 PUN1YLR414C 792 nt15.76■□□□□ 0.11
MSN5P52918 WHI5YOR083W 888 nt15.73■□□□□ 0.11
MSN5P52918 MRPL8YJL063C 717 nt15.7■□□□□ 0.1
MSN5P52918 SSA3YBL075C 1950 nt15.69■□□□□ 0.1
MSN5P52918 BDH2YAL061W 1254 nt15.6■□□□□ 0.09
MSN5P52918 FMP45YDL222C 930 nt15.57■□□□□ 0.08
MSN5P52918 PUT4YOR348C 1884 nt15.57■□□□□ 0.08
MSN5P52918 LSM3YLR438C-A 270 nt15.54■□□□□ 0.08
MSN5P52918 ARE1YCR048W 1833 nt15.52■□□□□ 0.08
MSN5P52918 YPR011CYPR011C 981 nt15.5■□□□□ 0.07
MSN5P52918 YCH1YGR203W 447 nt15.48■□□□□ 0.07
MSN5P52918 DSK2YMR276W 1122 nt15.47■□□□□ 0.07
MSN5P52918 UBX6YJL048C 1191 nt15.43■□□□□ 0.06
MSN5P52918 PTC2YER089C 1395 nt15.41■□□□□ 0.06
MSN5P52918 ADO1YJR105W 1023 nt15.41■□□□□ 0.06
MSN5P52918 YLR236CYLR236C 324 nt15.4■□□□□ 0.06
MSN5P52918 IMP2'YIL154C 1041 nt15.39■□□□□ 0.05
MSN5P52918 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.32■□□□□ 0.04
MSN5P52918 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt15.29■□□□□ 0.04
MSN5P52918 YEL076CYEL076C 651 nt15.29■□□□□ 0.04
MSN5P52918 YLR464WYLR464W 651 nt15.29■□□□□ 0.04
MSN5P52918 INM2YDR287W 879 nt15.24■□□□□ 0.03
MSN5P52918 YBL100CYBL100C 315 nt15.2■□□□□ 0.02
MSN5P52918 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.19■□□□□ 0.02
MSN5P52918 TRM9YML014W 840 nt15.16■□□□□ 0.02
MSN5P52918 POA1YBR022W 534 nt15.15■□□□□ 0.02
MSN5P52918 RTG1YOL067C 534 nt15.14■□□□□ 0.01
MSN5P52918 NAB2YGL122C 1578 nt15.11■□□□□ 0.01
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