Protein–RNA interactions for Protein: Q12161

PSH1, RING finger protein PSH1, yeastyeast

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PSH1Q12161 YML009W-BYML009W-B 477 nt25.12■■□□□ 1.61
PSH1Q12161 NSR1YGR159C 1245 nt24.75■■□□□ 1.55
PSH1Q12161 NOP1YDL014W 984 nt24.48■■□□□ 1.51
PSH1Q12161 YKL036CYKL036C 393 nt22.84■■□□□ 1.25
PSH1Q12161 MDJ1YFL016C 1536 nt21.78■■□□□ 1.08
PSH1Q12161 Q0297Q0297 156 nt21.54■■□□□ 1.04
PSH1Q12161 SRX1YKL086W 384 nt21.42■■□□□ 1.02
PSH1Q12161 YJL027CYJL027C 417 nt21.36■■□□□ 1.01
PSH1Q12161 SCS3YGL126W 1143 nt20.91■□□□□ 0.94
PSH1Q12161 YCR051WYCR051W 669 nt20.35■□□□□ 0.85
PSH1Q12161 YOL085CYOL085C 342 nt19.79■□□□□ 0.76
PSH1Q12161 PKP1YIL042C 1185 nt19.48■□□□□ 0.71
PSH1Q12161 DBP2YNL112W 1641 nt19.38■□□□□ 0.69
PSH1Q12161 RPP1BYDL130W 321 nt19.32■□□□□ 0.68
PSH1Q12161 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.24■□□□□ 0.67
PSH1Q12161 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.24■□□□□ 0.67
PSH1Q12161 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.24■□□□□ 0.67
PSH1Q12161 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.24■□□□□ 0.67
PSH1Q12161 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.24■□□□□ 0.67
PSH1Q12161 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.24■□□□□ 0.67
PSH1Q12161 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.24■□□□□ 0.67
PSH1Q12161 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.24■□□□□ 0.67
PSH1Q12161 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.24■□□□□ 0.67
PSH1Q12161 CCC1YLR220W 969 nt19.05■□□□□ 0.64
PSH1Q12161 SCJ1YMR214W 1134 nt18.79■□□□□ 0.6
PSH1Q12161 ATS1YAL020C 1002 nt18.77■□□□□ 0.6
PSH1Q12161 YBR190WYBR190W 312 nt18.48■□□□□ 0.55
PSH1Q12161 PET122YER153C 765 nt18.46■□□□□ 0.55
PSH1Q12161 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.28■□□□□ 0.52
PSH1Q12161 SCR1SCR1 522 nt18.28■□□□□ 0.52
PSH1Q12161 RVS167YDR388W 1449 nt18.22■□□□□ 0.51
PSH1Q12161 RTC3YHR087W 336 nt18.09■□□□□ 0.49
PSH1Q12161 RRN5YLR141W 1092 nt17.95■□□□□ 0.46
PSH1Q12161 YDJ1YNL064C 1230 nt17.68■□□□□ 0.42
PSH1Q12161 SHR5YOL110W 714 nt17.66■□□□□ 0.42
PSH1Q12161 RSB1YOR049C 1065 nt17.63■□□□□ 0.41
PSH1Q12161 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.6■□□□□ 0.41
PSH1Q12161 PST2YDR032C 597 nt17.36■□□□□ 0.37
PSH1Q12161 GAR1YHR089C 618 nt17.25■□□□□ 0.35
PSH1Q12161 DEP1YAL013W 1218 nt17.11■□□□□ 0.33
PSH1Q12161 URN1YPR152C 1398 nt17.03■□□□□ 0.32
PSH1Q12161 YNL208WYNL208W 600 nt16.84■□□□□ 0.29
PSH1Q12161 RPN10YHR200W 807 nt16.8■□□□□ 0.28
PSH1Q12161 YKL097CYKL097C 411 nt16.78■□□□□ 0.28
PSH1Q12161 SSA3YBL075C 1950 nt16.75■□□□□ 0.27
PSH1Q12161 OPI9YLR338W 858 nt16.73■□□□□ 0.27
PSH1Q12161 TIR1YER011W 765 nt16.66■□□□□ 0.26
PSH1Q12161 PUT4YOR348C 1884 nt16.61■□□□□ 0.25
PSH1Q12161 SHU1YHL006C 453 nt16.6■□□□□ 0.25
PSH1Q12161 SAH1YER043C 1350 nt16.58■□□□□ 0.24
PSH1Q12161 SSA1YAL005C 1929 nt16.42■□□□□ 0.22
PSH1Q12161 ARE1YCR048W 1833 nt16.39■□□□□ 0.21
PSH1Q12161 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.29■□□□□ 0.2
PSH1Q12161 YJR018WYJR018W 363 nt16.26■□□□□ 0.19
PSH1Q12161 SRB2YHR041C 633 nt16.24■□□□□ 0.19
PSH1Q12161 PUN1YLR414C 792 nt16.24■□□□□ 0.19
PSH1Q12161 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.18■□□□□ 0.18
PSH1Q12161 POA1YBR022W 534 nt16.13■□□□□ 0.17
PSH1Q12161 YJR120WYJR120W 351 nt16.1■□□□□ 0.17
PSH1Q12161 YOR139CYOR139C 393 nt16.09■□□□□ 0.17
PSH1Q12161 PTC2YER089C 1395 nt16.01■□□□□ 0.15
PSH1Q12161 WWM1YFL010C 636 nt15.98■□□□□ 0.15
PSH1Q12161 RPP2BYDR382W 333 nt15.97■□□□□ 0.15
PSH1Q12161 YGR021WYGR021W 873 nt15.92■□□□□ 0.14
PSH1Q12161 HOM6YJR139C 1080 nt15.91■□□□□ 0.14
PSH1Q12161 MNP1YGL068W 585 nt15.88■□□□□ 0.13
PSH1Q12161 NPL3YDR432W 1245 nt15.86■□□□□ 0.13
PSH1Q12161 BUD23YCR047C 828 nt15.82■□□□□ 0.12
PSH1Q12161 NAB2YGL122C 1578 nt15.75■□□□□ 0.11
PSH1Q12161 BSC6YOL137W 1494 nt15.72■□□□□ 0.11
PSH1Q12161 BDH2YAL061W 1254 nt15.72■□□□□ 0.11
PSH1Q12161 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.69■□□□□ 0.1
PSH1Q12161 RKM5YLR137W 1104 nt15.68■□□□□ 0.1
PSH1Q12161 YOL037CYOL037C 354 nt15.67■□□□□ 0.1
PSH1Q12161 INM2YDR287W 879 nt15.64■□□□□ 0.09
PSH1Q12161 DAL1YIR027C 1383 nt15.6■□□□□ 0.09
PSH1Q12161 FIS1YIL065C 468 nt15.58■□□□□ 0.08
PSH1Q12161 FPR4YLR449W 1179 nt15.57■□□□□ 0.08
PSH1Q12161 LSM3YLR438C-A 270 nt15.54■□□□□ 0.08
PSH1Q12161 YBL100CYBL100C 315 nt15.53■□□□□ 0.08
PSH1Q12161 PHO4YFR034C 939 nt15.46■□□□□ 0.07
PSH1Q12161 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.45■□□□□ 0.06
PSH1Q12161 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.45■□□□□ 0.06
PSH1Q12161 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.45■□□□□ 0.06
PSH1Q12161 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.45■□□□□ 0.06
PSH1Q12161 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.45■□□□□ 0.06
PSH1Q12161 FUN26YAL022C 1554 nt15.37■□□□□ 0.05
PSH1Q12161 TRM9YML014W 840 nt15.37■□□□□ 0.05
PSH1Q12161 YLR281CYLR281C 468 nt15.31■□□□□ 0.04
PSH1Q12161 PUS2YGL063W 1113 nt15.25■□□□□ 0.03
PSH1Q12161 WHI5YOR083W 888 nt15.24■□□□□ 0.03
PSH1Q12161 CCT6YDR188W 1641 nt15.21■□□□□ 0.02
PSH1Q12161 ALF1YNL148C 765 nt15.08■□□□□ 0
PSH1Q12161 YPS1YLR120C 1710 nt15.07■□□□□ 0
PSH1Q12161 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.04■□□□□ -0
PSH1Q12161 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.04■□□□□ -0
PSH1Q12161 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.04■□□□□ -0
PSH1Q12161 YDR095CYDR095C 411 nt15.03■□□□□ -0
PSH1Q12161 YPR011CYPR011C 981 nt14.96□□□□□ -0.01
PSH1Q12161 DSK2YMR276W 1122 nt14.93□□□□□ -0.02
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