Protein–RNA interactions for Protein: P35736

YKL050C, Uncharacterized protein YKL050C, yeast

Predictions only

Length 922 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	P35736	NSR1	YGR159C	1245 nt		21.66	■■□□□ 1.06
YKL050C	P35736	YML009W-B	YML009W-B	477 nt		21.63	■■□□□ 1.05
YKL050C	P35736	NOP1	YDL014W	984 nt		20.93	■□□□□ 0.94
YKL050C	P35736	MDJ1	YFL016C	1536 nt		19.43	■□□□□ 0.7
YKL050C	P35736	YKL036C	YKL036C	393 nt		19.17	■□□□□ 0.66
YKL050C	P35736	SRX1	YKL086W	384 nt		18.32	■□□□□ 0.52
YKL050C	P35736	Q0297	Q0297	156 nt		18.3	■□□□□ 0.52
YKL050C	P35736	YJL027C	YJL027C	417 nt		17.89	■□□□□ 0.45
YKL050C	P35736	SCS3	YGL126W	1143 nt		17.37	■□□□□ 0.37
YKL050C	P35736	YCR051W	YCR051W	669 nt		17.34	■□□□□ 0.37
YKL050C	P35736	DBP2	YNL112W	1641 nt		17.14	■□□□□ 0.33
YKL050C	P35736	TRN1	tP(UGG)A	72 nt		16.69	■□□□□ 0.26
YKL050C	P35736	SUF9	tP(UGG)F	72 nt		16.69	■□□□□ 0.26
YKL050C	P35736	SUF8	tP(UGG)H	72 nt		16.69	■□□□□ 0.26
YKL050C	P35736	tP(UGG)L	tP(UGG)L	72 nt		16.69	■□□□□ 0.26
YKL050C	P35736	SUF7	tP(UGG)M	72 nt		16.69	■□□□□ 0.26
YKL050C	P35736	tP(UGG)N1	tP(UGG)N1	72 nt		16.69	■□□□□ 0.26
YKL050C	P35736	tP(UGG)N2	tP(UGG)N2	72 nt		16.69	■□□□□ 0.26
YKL050C	P35736	tP(UGG)O1	tP(UGG)O1	72 nt		16.69	■□□□□ 0.26
YKL050C	P35736	SUF11	tP(UGG)O2	72 nt		16.69	■□□□□ 0.26
YKL050C	P35736	YOL085C	YOL085C	342 nt		16.63	■□□□□ 0.25
YKL050C	P35736	YBR190W	YBR190W	312 nt		16.6	■□□□□ 0.25
YKL050C	P35736	CCC1	YLR220W	969 nt		16.49	■□□□□ 0.23
YKL050C	P35736	RPP1B	YDL130W	321 nt		16.42	■□□□□ 0.22
YKL050C	P35736	PKP1	YIL042C	1185 nt		16.39	■□□□□ 0.21
YKL050C	P35736	RTC3	YHR087W	336 nt		16.2	■□□□□ 0.18
YKL050C	P35736	RVS167	YDR388W	1449 nt		16.01	■□□□□ 0.15
YKL050C	P35736	SCJ1	YMR214W	1134 nt		15.96	■□□□□ 0.15
YKL050C	P35736	PET122	YER153C	765 nt		15.72	■□□□□ 0.11
YKL050C	P35736	tP(UGG)O3	tP(UGG)O3	72 nt		15.72	■□□□□ 0.11
YKL050C	P35736	ATS1	YAL020C	1002 nt		15.47	■□□□□ 0.07
YKL050C	P35736	SCR1	SCR1	522 nt		15.45	■□□□□ 0.06
YKL050C	P35736	SHR5	YOL110W	714 nt		15.43	■□□□□ 0.06
YKL050C	P35736	PUT4	YOR348C	1884 nt		15.25	■□□□□ 0.03
YKL050C	P35736	RRN5	YLR141W	1092 nt		15.24	■□□□□ 0.03
YKL050C	P35736	YDJ1	YNL064C	1230 nt		15.21	■□□□□ 0.03
YKL050C	P35736	URN1	YPR152C	1398 nt		15.12	■□□□□ 0.01
YKL050C	P35736	DEP1	YAL013W	1218 nt		15.06	■□□□□ 0
YKL050C	P35736	YER088W-B	YER088W-B	147 nt		14.95	□□□□□ -0.02
YKL050C	P35736	OPI9	YLR338W	858 nt		14.94	□□□□□ -0.02
YKL050C	P35736	ARE1	YCR048W	1833 nt		14.91	□□□□□ -0.02
YKL050C	P35736	SAH1	YER043C	1350 nt		14.9	□□□□□ -0.02
YKL050C	P35736	GAR1	YHR089C	618 nt		14.89	□□□□□ -0.03
YKL050C	P35736	RSB1	YOR049C	1065 nt		14.85	□□□□□ -0.03
YKL050C	P35736	RPN10	YHR200W	807 nt		14.81	□□□□□ -0.04
YKL050C	P35736	SSA3	YBL075C	1950 nt		14.79	□□□□□ -0.04
YKL050C	P35736	YNL208W	YNL208W	600 nt		14.79	□□□□□ -0.04
YKL050C	P35736	POA1	YBR022W	534 nt		14.73	□□□□□ -0.05
YKL050C	P35736	YHR049C-A	YHR049C-A	297 nt		14.71	□□□□□ -0.05
YKL050C	P35736	PUN1	YLR414C	792 nt		14.49	□□□□□ -0.09
YKL050C	P35736	BSC6	YOL137W	1494 nt		14.46	□□□□□ -0.09
YKL050C	P35736	TIR1	YER011W	765 nt		14.4	□□□□□ -0.1
YKL050C	P35736	YJR018W	YJR018W	363 nt		14.4	□□□□□ -0.1
YKL050C	P35736	PST2	YDR032C	597 nt		14.37	□□□□□ -0.11
YKL050C	P35736	PTC2	YER089C	1395 nt		14.36	□□□□□ -0.11
YKL050C	P35736	BUD23	YCR047C	828 nt		14.33	□□□□□ -0.12
YKL050C	P35736	SSA1	YAL005C	1929 nt		14.29	□□□□□ -0.12
YKL050C	P35736	YJR120W	YJR120W	351 nt		14.21	□□□□□ -0.13
YKL050C	P35736	NAB2	YGL122C	1578 nt		14.18	□□□□□ -0.14
YKL050C	P35736	SRB2	YHR041C	633 nt		14.06	□□□□□ -0.16
YKL050C	P35736	RPP2B	YDR382W	333 nt		14.04	□□□□□ -0.16
YKL050C	P35736	FIS1	YIL065C	468 nt		14.01	□□□□□ -0.17
YKL050C	P35736	DAL1	YIR027C	1383 nt		13.96	□□□□□ -0.17
YKL050C	P35736	SPT5	YML010W	3192 nt		13.95	□□□□□ -0.18
YKL050C	P35736	FPR4	YLR449W	1179 nt		13.92	□□□□□ -0.18
YKL050C	P35736	INM2	YDR287W	879 nt		13.91	□□□□□ -0.18
YKL050C	P35736	PHO4	YFR034C	939 nt		13.85	□□□□□ -0.19
YKL050C	P35736	SHU1	YHL006C	453 nt		13.84	□□□□□ -0.19
YKL050C	P35736	BDH2	YAL061W	1254 nt		13.76	□□□□□ -0.21
YKL050C	P35736	YBL100C	YBL100C	315 nt		13.76	□□□□□ -0.21
YKL050C	P35736	WWM1	YFL010C	636 nt		13.75	□□□□□ -0.21
YKL050C	P35736	YKL097C	YKL097C	411 nt		13.68	□□□□□ -0.22
YKL050C	P35736	YAL037C-B	YAL037C-B	975 nt		13.67	□□□□□ -0.22
YKL050C	P35736	YPS1	YLR120C	1710 nt		13.64	□□□□□ -0.23
YKL050C	P35736	Q0182	Q0182	405 nt		13.61	□□□□□ -0.23
YKL050C	P35736	FUN26	YAL022C	1554 nt		13.6	□□□□□ -0.23
YKL050C	P35736	YGR021W	YGR021W	873 nt		13.59	□□□□□ -0.23
YKL050C	P35736	MEP2	YNL142W	1500 nt		13.59	□□□□□ -0.23
YKL050C	P35736	HOM6	YJR139C	1080 nt		13.56	□□□□□ -0.24
YKL050C	P35736	YDR095C	YDR095C	411 nt		13.54	□□□□□ -0.24
YKL050C	P35736	LSM3	YLR438C-A	270 nt		13.54	□□□□□ -0.24
YKL050C	P35736	YFL021C-A	YFL021C-A	855 nt		13.52	□□□□□ -0.25
YKL050C	P35736	TRM9	YML014W	840 nt		13.51	□□□□□ -0.25
YKL050C	P35736	SSA4	YER103W	1929 nt		13.49	□□□□□ -0.25
YKL050C	P35736	YHR165W-A	YHR165W-A	312 nt		13.49	□□□□□ -0.25
YKL050C	P35736	MNP1	YGL068W	585 nt		13.47	□□□□□ -0.25
YKL050C	P35736	CCT6	YDR188W	1641 nt		13.42	□□□□□ -0.26
YKL050C	P35736	ALF1	YNL148C	765 nt		13.41	□□□□□ -0.26
YKL050C	P35736	DCW1	YKL046C	1350 nt		13.39	□□□□□ -0.27
YKL050C	P35736	RKM5	YLR137W	1104 nt		13.36	□□□□□ -0.27
YKL050C	P35736	PTP1	YDL230W	1008 nt		13.28	□□□□□ -0.28
YKL050C	P35736	SUF2	tP(AGG)C	72 nt		13.27	□□□□□ -0.29
YKL050C	P35736	SUF10	tP(AGG)N	72 nt		13.27	□□□□□ -0.29
YKL050C	P35736	RPP2A	YOL039W	321 nt		13.27	□□□□□ -0.29
YKL050C	P35736	SIS1	YNL007C	1059 nt		13.25	□□□□□ -0.29
YKL050C	P35736	YOR139C	YOR139C	393 nt		13.22	□□□□□ -0.29
YKL050C	P35736	EMI2	YDR516C	1503 nt		13.2	□□□□□ -0.3
YKL050C	P35736	CAC2	YML102W	1407 nt		13.19	□□□□□ -0.3
YKL050C	P35736	YOL037C	YOL037C	354 nt		13.15	□□□□□ -0.3
YKL050C	P35736	YDL221W	YDL221W	552 nt		13.1	□□□□□ -0.31

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