Protein–RNA interactions for Protein: Q06156

YCS4, Condensin complex subunit 1, yeastyeast

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Length 1,176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YCS4Q06156 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.95■□□□□ 0.94
YCS4Q06156 NSR1YGR159C 1245 nt20.74■□□□□ 0.91
YCS4Q06156 NOP1YDL014W 984 nt20.45■□□□□ 0.86
YCS4Q06156 YKL036CYKL036C 393 nt19.02■□□□□ 0.64
YCS4Q06156 MDJ1YFL016C 1536 nt18.23■□□□□ 0.51
YCS4Q06156 Q0297Q0297 156 nt17.99■□□□□ 0.47
YCS4Q06156 SRX1YKL086W 384 nt17.89■□□□□ 0.45
YCS4Q06156 YJL027CYJL027C 417 nt17.77■□□□□ 0.44
YCS4Q06156 SCS3YGL126W 1143 nt17.39■□□□□ 0.37
YCS4Q06156 YCR051WYCR051W 669 nt16.95■□□□□ 0.3
YCS4Q06156 YOL085CYOL085C 342 nt16.5■□□□□ 0.23
YCS4Q06156 DBP2YNL112W 1641 nt16.26■□□□□ 0.19
YCS4Q06156 PKP1YIL042C 1185 nt16.2■□□□□ 0.18
YCS4Q06156 RPP1BYDL130W 321 nt16.13■□□□□ 0.17
YCS4Q06156 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.08■□□□□ 0.16
YCS4Q06156 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.08■□□□□ 0.16
YCS4Q06156 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.08■□□□□ 0.16
YCS4Q06156 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.08■□□□□ 0.16
YCS4Q06156 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.08■□□□□ 0.16
YCS4Q06156 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.08■□□□□ 0.16
YCS4Q06156 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.08■□□□□ 0.16
YCS4Q06156 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.08■□□□□ 0.16
YCS4Q06156 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.08■□□□□ 0.16
YCS4Q06156 CCC1YLR220W 969 nt15.9■□□□□ 0.14
YCS4Q06156 ATS1YAL020C 1002 nt15.62■□□□□ 0.09
YCS4Q06156 SCJ1YMR214W 1134 nt15.62■□□□□ 0.09
YCS4Q06156 YBR190WYBR190W 312 nt15.53■□□□□ 0.08
YCS4Q06156 PET122YER153C 765 nt15.38■□□□□ 0.05
YCS4Q06156 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.28■□□□□ 0.04
YCS4Q06156 RVS167YDR388W 1449 nt15.24■□□□□ 0.03
YCS4Q06156 SCR1SCR1 522 nt15.23■□□□□ 0.03
YCS4Q06156 RTC3YHR087W 336 nt15.15■□□□□ 0.02
YCS4Q06156 RRN5YLR141W 1092 nt14.98□□□□□ -0.01
YCS4Q06156 YDJ1YNL064C 1230 nt14.78□□□□□ -0.04
YCS4Q06156 SHR5YOL110W 714 nt14.78□□□□□ -0.04
YCS4Q06156 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.69□□□□□ -0.06
YCS4Q06156 RSB1YOR049C 1065 nt14.67□□□□□ -0.06
YCS4Q06156 SSA3YBL075C 1950 nt14.58□□□□□ -0.08
YCS4Q06156 Q0182Q0182 405 nt14.48□□□□□ -0.09
YCS4Q06156 PST2YDR032C 597 nt14.46□□□□□ -0.09
YCS4Q06156 GAR1YHR089C 618 nt14.4□□□□□ -0.1
YCS4Q06156 DEP1YAL013W 1218 nt14.3□□□□□ -0.12
YCS4Q06156 URN1YPR152C 1398 nt14.26□□□□□ -0.13
YCS4Q06156 MOT3YMR070W 1473 nt14.17□□□□□ -0.14
YCS4Q06156 YNL208WYNL208W 600 nt14.1□□□□□ -0.15
YCS4Q06156 RPN10YHR200W 807 nt14.06□□□□□ -0.16
YCS4Q06156 PUT4YOR348C 1884 nt14.06□□□□□ -0.16
YCS4Q06156 OPI9YLR338W 858 nt14.05□□□□□ -0.16
YCS4Q06156 TIR1YER011W 765 nt13.92□□□□□ -0.18
YCS4Q06156 YKL097CYKL097C 411 nt13.91□□□□□ -0.18
YCS4Q06156 SAH1YER043C 1350 nt13.91□□□□□ -0.18
YCS4Q06156 SHU1YHL006C 453 nt13.82□□□□□ -0.2
YCS4Q06156 ARE1YCR048W 1833 nt13.8□□□□□ -0.2
YCS4Q06156 SSA1YAL005C 1929 nt13.74□□□□□ -0.21
YCS4Q06156 YJR018WYJR018W 363 nt13.63□□□□□ -0.23
YCS4Q06156 PUN1YLR414C 792 nt13.62□□□□□ -0.23
YCS4Q06156 SRB2YHR041C 633 nt13.57□□□□□ -0.24
YCS4Q06156 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.57□□□□□ -0.24
YCS4Q06156 POA1YBR022W 534 nt13.57□□□□□ -0.24
YCS4Q06156 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.55□□□□□ -0.24
YCS4Q06156 YJR120WYJR120W 351 nt13.5□□□□□ -0.25
YCS4Q06156 PTC2YER089C 1395 nt13.44□□□□□ -0.26
YCS4Q06156 BSC6YOL137W 1494 nt13.38□□□□□ -0.27
YCS4Q06156 YOR139CYOR139C 393 nt13.37□□□□□ -0.27
YCS4Q06156 RPP2BYDR382W 333 nt13.36□□□□□ -0.27
YCS4Q06156 WWM1YFL010C 636 nt13.34□□□□□ -0.27
YCS4Q06156 YGR021WYGR021W 873 nt13.28□□□□□ -0.28
YCS4Q06156 HOM6YJR139C 1080 nt13.28□□□□□ -0.28
YCS4Q06156 BUD23YCR047C 828 nt13.26□□□□□ -0.29
YCS4Q06156 NAB2YGL122C 1578 nt13.24□□□□□ -0.29
YCS4Q06156 MNP1YGL068W 585 nt13.2□□□□□ -0.3
YCS4Q06156 NPL3YDR432W 1245 nt13.17□□□□□ -0.3
YCS4Q06156 SPT5YML010W 3192 nt13.16□□□□□ -0.3
YCS4Q06156 BDH2YAL061W 1254 nt13.15□□□□□ -0.3
YCS4Q06156 INM2YDR287W 879 nt13.13□□□□□ -0.31
YCS4Q06156 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.11□□□□□ -0.31
YCS4Q06156 DAL1YIR027C 1383 nt13.09□□□□□ -0.31
YCS4Q06156 RKM5YLR137W 1104 nt13.07□□□□□ -0.32
YCS4Q06156 FIS1YIL065C 468 nt13.06□□□□□ -0.32
YCS4Q06156 YOL037CYOL037C 354 nt13.04□□□□□ -0.32
YCS4Q06156 LSM3YLR438C-A 270 nt13.03□□□□□ -0.32
YCS4Q06156 FPR4YLR449W 1179 nt13.03□□□□□ -0.32
YCS4Q06156 YBL100CYBL100C 315 nt13□□□□□ -0.33
YCS4Q06156 PHO4YFR034C 939 nt12.96□□□□□ -0.33
YCS4Q06156 SSA4YER103W 1929 nt12.92□□□□□ -0.34
YCS4Q06156 TRM9YML014W 840 nt12.88□□□□□ -0.35
YCS4Q06156 FUN26YAL022C 1554 nt12.87□□□□□ -0.35
YCS4Q06156 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.86□□□□□ -0.35
YCS4Q06156 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.86□□□□□ -0.35
YCS4Q06156 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.86□□□□□ -0.35
YCS4Q06156 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.86□□□□□ -0.35
YCS4Q06156 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.86□□□□□ -0.35
YCS4Q06156 YLR281CYLR281C 468 nt12.78□□□□□ -0.36
YCS4Q06156 CCT6YDR188W 1641 nt12.74□□□□□ -0.37
YCS4Q06156 WHI5YOR083W 888 nt12.71□□□□□ -0.37
YCS4Q06156 PUS2YGL063W 1113 nt12.68□□□□□ -0.38
YCS4Q06156 YPS1YLR120C 1710 nt12.67□□□□□ -0.38
YCS4Q06156 YDR095CYDR095C 411 nt12.62□□□□□ -0.39
YCS4Q06156 ALF1YNL148C 765 nt12.62□□□□□ -0.39
YCS4Q06156 MEP2YNL142W 1500 nt12.61□□□□□ -0.39
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