Protein–RNA interactions for Protein: P40462

TMA108, Protein TMA108, yeastyeast

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA108P40462 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.35■■□□□ 1.01
TMA108P40462 NSR1YGR159C 1245 nt21.15■□□□□ 0.98
TMA108P40462 NOP1YDL014W 984 nt20.67■□□□□ 0.9
TMA108P40462 YKL036CYKL036C 393 nt19.09■□□□□ 0.65
TMA108P40462 MDJ1YFL016C 1536 nt18.96■□□□□ 0.63
TMA108P40462 Q0297Q0297 156 nt18.08■□□□□ 0.48
TMA108P40462 SRX1YKL086W 384 nt18.06■□□□□ 0.48
TMA108P40462 YJL027CYJL027C 417 nt17.84■□□□□ 0.45
TMA108P40462 SCS3YGL126W 1143 nt17.4■□□□□ 0.38
TMA108P40462 YCR051WYCR051W 669 nt17.19■□□□□ 0.34
TMA108P40462 DBP2YNL112W 1641 nt16.67■□□□□ 0.26
TMA108P40462 YOL085CYOL085C 342 nt16.53■□□□□ 0.24
TMA108P40462 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.37■□□□□ 0.21
TMA108P40462 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.37■□□□□ 0.21
TMA108P40462 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.37■□□□□ 0.21
TMA108P40462 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.37■□□□□ 0.21
TMA108P40462 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.37■□□□□ 0.21
TMA108P40462 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.37■□□□□ 0.21
TMA108P40462 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.37■□□□□ 0.21
TMA108P40462 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.37■□□□□ 0.21
TMA108P40462 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.37■□□□□ 0.21
TMA108P40462 PKP1YIL042C 1185 nt16.35■□□□□ 0.21
TMA108P40462 RPP1BYDL130W 321 nt16.24■□□□□ 0.19
TMA108P40462 CCC1YLR220W 969 nt16.24■□□□□ 0.19
TMA108P40462 YBR190WYBR190W 312 nt16.17■□□□□ 0.18
TMA108P40462 RTC3YHR087W 336 nt15.86■□□□□ 0.13
TMA108P40462 RVS167YDR388W 1449 nt15.68■□□□□ 0.1
TMA108P40462 SCJ1YMR214W 1134 nt15.63■□□□□ 0.09
TMA108P40462 PET122YER153C 765 nt15.57■□□□□ 0.08
TMA108P40462 ATS1YAL020C 1002 nt15.52■□□□□ 0.08
TMA108P40462 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TMA108P40462 SCR1SCR1 522 nt15.36■□□□□ 0.05
TMA108P40462 SHR5YOL110W 714 nt15.1■□□□□ 0.01
TMA108P40462 RRN5YLR141W 1092 nt15.09■□□□□ 0.01
TMA108P40462 YDJ1YNL064C 1230 nt14.93□□□□□ -0.02
TMA108P40462 RSB1YOR049C 1065 nt14.81□□□□□ -0.04
TMA108P40462 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.79□□□□□ -0.04
TMA108P40462 PUT4YOR348C 1884 nt14.78□□□□□ -0.04
TMA108P40462 URN1YPR152C 1398 nt14.77□□□□□ -0.04
TMA108P40462 DEP1YAL013W 1218 nt14.76□□□□□ -0.05
TMA108P40462 GAR1YHR089C 618 nt14.67□□□□□ -0.06
TMA108P40462 OPI9YLR338W 858 nt14.56□□□□□ -0.08
TMA108P40462 SAH1YER043C 1350 nt14.54□□□□□ -0.08
TMA108P40462 RPN10YHR200W 807 nt14.5□□□□□ -0.09
TMA108P40462 ARE1YCR048W 1833 nt14.48□□□□□ -0.09
TMA108P40462 YNL208WYNL208W 600 nt14.45□□□□□ -0.1
TMA108P40462 PST2YDR032C 597 nt14.35□□□□□ -0.11
TMA108P40462 POA1YBR022W 534 nt14.35□□□□□ -0.11
TMA108P40462 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.33□□□□□ -0.12
TMA108P40462 TIR1YER011W 765 nt14.15□□□□□ -0.14
TMA108P40462 PUN1YLR414C 792 nt14.14□□□□□ -0.15
TMA108P40462 SSA3YBL075C 1950 nt14.09□□□□□ -0.15
TMA108P40462 YJR018WYJR018W 363 nt14.08□□□□□ -0.16
TMA108P40462 BSC6YOL137W 1494 nt14.06□□□□□ -0.16
TMA108P40462 PTC2YER089C 1395 nt14.01□□□□□ -0.17
TMA108P40462 BUD23YCR047C 828 nt14.01□□□□□ -0.17
TMA108P40462 SSA1YAL005C 1929 nt13.99□□□□□ -0.17
TMA108P40462 YKL097CYKL097C 411 nt13.83□□□□□ -0.2
TMA108P40462 NAB2YGL122C 1578 nt13.83□□□□□ -0.2
TMA108P40462 SHU1YHL006C 453 nt13.82□□□□□ -0.2
TMA108P40462 YJR120WYJR120W 351 nt13.81□□□□□ -0.2
TMA108P40462 Q0182Q0182 405 nt13.8□□□□□ -0.2
TMA108P40462 SRB2YHR041C 633 nt13.8□□□□□ -0.2
TMA108P40462 RPP2BYDR382W 333 nt13.76□□□□□ -0.21
TMA108P40462 FPR4YLR449W 1179 nt13.65□□□□□ -0.22
TMA108P40462 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.64□□□□□ -0.23
TMA108P40462 DAL1YIR027C 1383 nt13.62□□□□□ -0.23
TMA108P40462 FIS1YIL065C 468 nt13.62□□□□□ -0.23
TMA108P40462 INM2YDR287W 879 nt13.57□□□□□ -0.24
TMA108P40462 WWM1YFL010C 636 nt13.55□□□□□ -0.24
TMA108P40462 PHO4YFR034C 939 nt13.5□□□□□ -0.25
TMA108P40462 YBL100CYBL100C 315 nt13.45□□□□□ -0.26
TMA108P40462 YGR021WYGR021W 873 nt13.44□□□□□ -0.26
TMA108P40462 BDH2YAL061W 1254 nt13.44□□□□□ -0.26
TMA108P40462 SPT5YML010W 3192 nt13.41□□□□□ -0.26
TMA108P40462 MNP1YGL068W 585 nt13.41□□□□□ -0.26
TMA108P40462 HOM6YJR139C 1080 nt13.4□□□□□ -0.26
TMA108P40462 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.3□□□□□ -0.28
TMA108P40462 FUN26YAL022C 1554 nt13.28□□□□□ -0.28
TMA108P40462 YPS1YLR120C 1710 nt13.27□□□□□ -0.28
TMA108P40462 YOR139CYOR139C 393 nt13.27□□□□□ -0.29
TMA108P40462 TRM9YML014W 840 nt13.23□□□□□ -0.29
TMA108P40462 LSM3YLR438C-A 270 nt13.22□□□□□ -0.29
TMA108P40462 RKM5YLR137W 1104 nt13.21□□□□□ -0.29
TMA108P40462 MEP2YNL142W 1500 nt13.18□□□□□ -0.3
TMA108P40462 NPL3YDR432W 1245 nt13.18□□□□□ -0.3
TMA108P40462 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.17□□□□□ -0.3
TMA108P40462 YDR095CYDR095C 411 nt13.16□□□□□ -0.3
TMA108P40462 ALF1YNL148C 765 nt13.14□□□□□ -0.31
TMA108P40462 YOL037CYOL037C 354 nt13.11□□□□□ -0.31
TMA108P40462 CCT6YDR188W 1641 nt13.07□□□□□ -0.32
TMA108P40462 SSA4YER103W 1929 nt13.03□□□□□ -0.32
TMA108P40462 DCW1YKL046C 1350 nt13.01□□□□□ -0.33
TMA108P40462 MOT3YMR070W 1473 nt13□□□□□ -0.33
TMA108P40462 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.99□□□□□ -0.33
TMA108P40462 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.99□□□□□ -0.33
TMA108P40462 RPP2AYOL039W 321 nt12.94□□□□□ -0.34
TMA108P40462 SIS1YNL007C 1059 nt12.9□□□□□ -0.34
TMA108P40462 PTP1YDL230W 1008 nt12.88□□□□□ -0.35
TMA108P40462 EMI2YDR516C 1503 nt12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms