Protein–RNA interactions for Protein: Q12025

YDR056C, Uncharacterized protein YDR056C, yeastyeast

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDR056CQ12025 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.92■□□□□ 0.78
YDR056CQ12025 NSR1YGR159C 1245 nt19.87■□□□□ 0.77
YDR056CQ12025 NOP1YDL014W 984 nt19.43■□□□□ 0.7
YDR056CQ12025 YKL036CYKL036C 393 nt17.92■□□□□ 0.46
YDR056CQ12025 MDJ1YFL016C 1536 nt17.59■□□□□ 0.41
YDR056CQ12025 Q0297Q0297 156 nt17.04■□□□□ 0.32
YDR056CQ12025 SRX1YKL086W 384 nt16.98■□□□□ 0.31
YDR056CQ12025 YJL027CYJL027C 417 nt16.69■□□□□ 0.26
YDR056CQ12025 SCS3YGL126W 1143 nt16.31■□□□□ 0.2
YDR056CQ12025 YCR051WYCR051W 669 nt16.03■□□□□ 0.16
YDR056CQ12025 DBP2YNL112W 1641 nt15.58■□□□□ 0.09
YDR056CQ12025 YOL085CYOL085C 342 nt15.51■□□□□ 0.07
YDR056CQ12025 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YDR056CQ12025 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YDR056CQ12025 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YDR056CQ12025 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YDR056CQ12025 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YDR056CQ12025 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YDR056CQ12025 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YDR056CQ12025 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YDR056CQ12025 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.37■□□□□ 0.05
YDR056CQ12025 RPP1BYDL130W 321 nt15.26■□□□□ 0.03
YDR056CQ12025 PKP1YIL042C 1185 nt15.18■□□□□ 0.02
YDR056CQ12025 CCC1YLR220W 969 nt15.07■□□□□ 0
YDR056CQ12025 YBR190WYBR190W 312 nt15.04■□□□□ -0
YDR056CQ12025 RTC3YHR087W 336 nt14.76□□□□□ -0.05
YDR056CQ12025 RVS167YDR388W 1449 nt14.66□□□□□ -0.06
YDR056CQ12025 ATS1YAL020C 1002 nt14.58□□□□□ -0.08
YDR056CQ12025 SCJ1YMR214W 1134 nt14.58□□□□□ -0.08
YDR056CQ12025 PET122YER153C 765 nt14.55□□□□□ -0.08
YDR056CQ12025 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.5□□□□□ -0.09
YDR056CQ12025 SCR1SCR1 522 nt14.41□□□□□ -0.1
YDR056CQ12025 SHR5YOL110W 714 nt14.17□□□□□ -0.14
YDR056CQ12025 RRN5YLR141W 1092 nt14.1□□□□□ -0.15
YDR056CQ12025 YDJ1YNL064C 1230 nt14.09□□□□□ -0.15
YDR056CQ12025 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.86□□□□□ -0.19
YDR056CQ12025 RSB1YOR049C 1065 nt13.8□□□□□ -0.2
YDR056CQ12025 PUT4YOR348C 1884 nt13.74□□□□□ -0.21
YDR056CQ12025 URN1YPR152C 1398 nt13.71□□□□□ -0.21
YDR056CQ12025 Q0182Q0182 405 nt13.7□□□□□ -0.22
YDR056CQ12025 DEP1YAL013W 1218 nt13.68□□□□□ -0.22
YDR056CQ12025 GAR1YHR089C 618 nt13.66□□□□□ -0.22
YDR056CQ12025 RPN10YHR200W 807 nt13.57□□□□□ -0.24
YDR056CQ12025 OPI9YLR338W 858 nt13.56□□□□□ -0.24
YDR056CQ12025 YNL208WYNL208W 600 nt13.53□□□□□ -0.24
YDR056CQ12025 PST2YDR032C 597 nt13.52□□□□□ -0.25
YDR056CQ12025 SAH1YER043C 1350 nt13.49□□□□□ -0.25
YDR056CQ12025 ARE1YCR048W 1833 nt13.45□□□□□ -0.26
YDR056CQ12025 POA1YBR022W 534 nt13.35□□□□□ -0.27
YDR056CQ12025 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.33□□□□□ -0.28
YDR056CQ12025 TIR1YER011W 765 nt13.25□□□□□ -0.29
YDR056CQ12025 SSA3YBL075C 1950 nt13.22□□□□□ -0.29
YDR056CQ12025 PUN1YLR414C 792 nt13.18□□□□□ -0.3
YDR056CQ12025 YJR018WYJR018W 363 nt13.09□□□□□ -0.31
YDR056CQ12025 MOT3YMR070W 1473 nt13.08□□□□□ -0.32
YDR056CQ12025 BSC6YOL137W 1494 nt13.08□□□□□ -0.32
YDR056CQ12025 SSA1YAL005C 1929 nt13.07□□□□□ -0.32
YDR056CQ12025 BUD23YCR047C 828 nt13.05□□□□□ -0.32
YDR056CQ12025 PTC2YER089C 1395 nt13.03□□□□□ -0.32
YDR056CQ12025 YKL097CYKL097C 411 nt12.97□□□□□ -0.33
YDR056CQ12025 SHU1YHL006C 453 nt12.93□□□□□ -0.34
YDR056CQ12025 YJR120WYJR120W 351 nt12.93□□□□□ -0.34
YDR056CQ12025 NAB2YGL122C 1578 nt12.87□□□□□ -0.35
YDR056CQ12025 RPP2BYDR382W 333 nt12.85□□□□□ -0.35
YDR056CQ12025 SRB2YHR041C 633 nt12.84□□□□□ -0.35
YDR056CQ12025 FPR4YLR449W 1179 nt12.7□□□□□ -0.38
YDR056CQ12025 FIS1YIL065C 468 nt12.68□□□□□ -0.38
YDR056CQ12025 DAL1YIR027C 1383 nt12.68□□□□□ -0.38
YDR056CQ12025 INM2YDR287W 879 nt12.65□□□□□ -0.38
YDR056CQ12025 YGR021WYGR021W 873 nt12.65□□□□□ -0.38
YDR056CQ12025 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.64□□□□□ -0.39
YDR056CQ12025 WWM1YFL010C 636 nt12.63□□□□□ -0.39
YDR056CQ12025 BDH2YAL061W 1254 nt12.62□□□□□ -0.39
YDR056CQ12025 HOM6YJR139C 1080 nt12.59□□□□□ -0.39
YDR056CQ12025 PHO4YFR034C 939 nt12.56□□□□□ -0.4
YDR056CQ12025 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.51□□□□□ -0.41
YDR056CQ12025 YBL100CYBL100C 315 nt12.51□□□□□ -0.41
YDR056CQ12025 LSM3YLR438C-A 270 nt12.48□□□□□ -0.41
YDR056CQ12025 MNP1YGL068W 585 nt12.46□□□□□ -0.41
YDR056CQ12025 YOR139CYOR139C 393 nt12.45□□□□□ -0.42
YDR056CQ12025 SPT5YML010W 3192 nt12.44□□□□□ -0.42
YDR056CQ12025 RKM5YLR137W 1104 nt12.4□□□□□ -0.42
YDR056CQ12025 YOL037CYOL037C 354 nt12.37□□□□□ -0.43
YDR056CQ12025 FUN26YAL022C 1554 nt12.37□□□□□ -0.43
YDR056CQ12025 YPS1YLR120C 1710 nt12.34□□□□□ -0.43
YDR056CQ12025 NPL3YDR432W 1245 nt12.33□□□□□ -0.44
YDR056CQ12025 TRM9YML014W 840 nt12.32□□□□□ -0.44
YDR056CQ12025 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.28□□□□□ -0.44
YDR056CQ12025 CCT6YDR188W 1641 nt12.28□□□□□ -0.44
YDR056CQ12025 MEP2YNL142W 1500 nt12.27□□□□□ -0.44
YDR056CQ12025 YDR095CYDR095C 411 nt12.25□□□□□ -0.45
YDR056CQ12025 ALF1YNL148C 765 nt12.25□□□□□ -0.45
YDR056CQ12025 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.16□□□□□ -0.46
YDR056CQ12025 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.16□□□□□ -0.46
YDR056CQ12025 SSA4YER103W 1929 nt12.15□□□□□ -0.46
YDR056CQ12025 DCW1YKL046C 1350 nt12.07□□□□□ -0.48
YDR056CQ12025 SIS1YNL007C 1059 nt12.04□□□□□ -0.48
YDR056CQ12025 RPP2AYOL039W 321 nt12.04□□□□□ -0.48
YDR056CQ12025 YLR281CYLR281C 468 nt12.02□□□□□ -0.49
YDR056CQ12025 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.97□□□□□ -0.49
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