Protein–RNA interactions for Protein: P32610

VMA8, V-type proton ATPase subunit D, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VMA8P32610 NSR1YGR159C 1245 nt17.17■□□□□ 0.34
VMA8P32610 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.9■□□□□ 0.3
VMA8P32610 NOP1YDL014W 984 nt16.41■□□□□ 0.22
VMA8P32610 MDJ1YFL016C 1536 nt15.44■□□□□ 0.06
VMA8P32610 YKL036CYKL036C 393 nt14.74□□□□□ -0.05
VMA8P32610 SSA3YBL075C 1950 nt14.68□□□□□ -0.06
VMA8P32610 YJL027CYJL027C 417 nt14.33□□□□□ -0.12
VMA8P32610 SRX1YKL086W 384 nt14.26□□□□□ -0.13
VMA8P32610 Q0297Q0297 156 nt14.18□□□□□ -0.14
VMA8P32610 YCR051WYCR051W 669 nt13.5□□□□□ -0.25
VMA8P32610 DBP2YNL112W 1641 nt13.49□□□□□ -0.25
VMA8P32610 Q0182Q0182 405 nt13.47□□□□□ -0.25
VMA8P32610 YBR190WYBR190W 312 nt13.37□□□□□ -0.27
VMA8P32610 SCS3YGL126W 1143 nt13.16□□□□□ -0.3
VMA8P32610 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.06□□□□□ -0.32
VMA8P32610 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.06□□□□□ -0.32
VMA8P32610 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.06□□□□□ -0.32
VMA8P32610 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.06□□□□□ -0.32
VMA8P32610 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.06□□□□□ -0.32
VMA8P32610 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.06□□□□□ -0.32
VMA8P32610 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.06□□□□□ -0.32
VMA8P32610 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.06□□□□□ -0.32
VMA8P32610 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.06□□□□□ -0.32
VMA8P32610 RTC3YHR087W 336 nt13.05□□□□□ -0.32
VMA8P32610 CCC1YLR220W 969 nt12.92□□□□□ -0.34
VMA8P32610 RVS167YDR388W 1449 nt12.8□□□□□ -0.36
VMA8P32610 YOL085CYOL085C 342 nt12.73□□□□□ -0.37
VMA8P32610 RPP1BYDL130W 321 nt12.72□□□□□ -0.37
VMA8P32610 PUT4YOR348C 1884 nt12.68□□□□□ -0.38
VMA8P32610 MOT3YMR070W 1473 nt12.66□□□□□ -0.38
VMA8P32610 SSA4YER103W 1929 nt12.59□□□□□ -0.39
VMA8P32610 PKP1YIL042C 1185 nt12.53□□□□□ -0.4
VMA8P32610 SCJ1YMR214W 1134 nt12.46□□□□□ -0.41
VMA8P32610 SPT5YML010W 3192 nt12.42□□□□□ -0.42
VMA8P32610 PAC11YDR488C 1602 nt12.41□□□□□ -0.42
VMA8P32610 SSA1YAL005C 1929 nt12.36□□□□□ -0.43
VMA8P32610 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.25□□□□□ -0.45
VMA8P32610 BDF1YLR399C 2061 nt12.22□□□□□ -0.45
VMA8P32610 SHR5YOL110W 714 nt12.2□□□□□ -0.46
VMA8P32610 NVJ2YPR091C 2313 nt12.19□□□□□ -0.46
VMA8P32610 POA1YBR022W 534 nt12.16□□□□□ -0.46
VMA8P32610 BSC6YOL137W 1494 nt12.14□□□□□ -0.47
VMA8P32610 PET122YER153C 765 nt12.13□□□□□ -0.47
VMA8P32610 ARE1YCR048W 1833 nt12.08□□□□□ -0.48
VMA8P32610 TAT1YBR069C 1860 nt12.06□□□□□ -0.48
VMA8P32610 URN1YPR152C 1398 nt12.05□□□□□ -0.48
VMA8P32610 SCR1SCR1 522 nt12.04□□□□□ -0.48
VMA8P32610 OPI9YLR338W 858 nt11.97□□□□□ -0.49
VMA8P32610 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.95□□□□□ -0.5
VMA8P32610 SAH1YER043C 1350 nt11.92□□□□□ -0.5
VMA8P32610 RPN10YHR200W 807 nt11.91□□□□□ -0.5
VMA8P32610 YDJ1YNL064C 1230 nt11.91□□□□□ -0.5
VMA8P32610 FPS1YLL043W 2010 nt11.89□□□□□ -0.51
VMA8P32610 DEP1YAL013W 1218 nt11.89□□□□□ -0.51
VMA8P32610 YNL208WYNL208W 600 nt11.77□□□□□ -0.53
VMA8P32610 RRN5YLR141W 1092 nt11.76□□□□□ -0.53
VMA8P32610 ATS1YAL020C 1002 nt11.7□□□□□ -0.54
VMA8P32610 PUN1YLR414C 792 nt11.67□□□□□ -0.54
VMA8P32610 GAR1YHR089C 618 nt11.63□□□□□ -0.55
VMA8P32610 BUD23YCR047C 828 nt11.58□□□□□ -0.56
VMA8P32610 YJL225CYJL225C 5277 nt11.56□□□□□ -0.56
VMA8P32610 MEP2YNL142W 1500 nt11.54□□□□□ -0.56
VMA8P32610 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.52□□□□□ -0.57
VMA8P32610 PTC2YER089C 1395 nt11.52□□□□□ -0.57
VMA8P32610 YJR018WYJR018W 363 nt11.5□□□□□ -0.57
VMA8P32610 NAB2YGL122C 1578 nt11.46□□□□□ -0.57
VMA8P32610 RSB1YOR049C 1065 nt11.44□□□□□ -0.58
VMA8P32610 YBR220CYBR220C 1683 nt11.31□□□□□ -0.6
VMA8P32610 TIR1YER011W 765 nt11.28□□□□□ -0.6
VMA8P32610 DCW1YKL046C 1350 nt11.27□□□□□ -0.61
VMA8P32610 RPP2BYDR382W 333 nt11.25□□□□□ -0.61
VMA8P32610 UME6YDR207C 2511 nt11.25□□□□□ -0.61
VMA8P32610 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.24□□□□□ -0.61
VMA8P32610 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.24□□□□□ -0.61
VMA8P32610 PCH2YBR186W 1695 nt11.24□□□□□ -0.61
VMA8P32610 YMR090WYMR090W 684 nt11.23□□□□□ -0.61
VMA8P32610 DAL1YIR027C 1383 nt11.23□□□□□ -0.61
VMA8P32610 GUT2YIL155C 1950 nt11.21□□□□□ -0.61
VMA8P32610 INM2YDR287W 879 nt11.19□□□□□ -0.62
VMA8P32610 FPR4YLR449W 1179 nt11.18□□□□□ -0.62
VMA8P32610 FIS1YIL065C 468 nt11.16□□□□□ -0.62
VMA8P32610 SEC11YIR022W 504 nt11.16□□□□□ -0.62
VMA8P32610 EMI2YDR516C 1503 nt11.13□□□□□ -0.63
VMA8P32610 YJR120WYJR120W 351 nt11.11□□□□□ -0.63
VMA8P32610 RPM1RPM1 483 nt11.1□□□□□ -0.63
VMA8P32610 PHO4YFR034C 939 nt11.08□□□□□ -0.64
VMA8P32610 SDH1YKL148C 1923 nt11.05□□□□□ -0.64
VMA8P32610 BOR1YNL275W 1731 nt11.03□□□□□ -0.64
VMA8P32610 YPS1YLR120C 1710 nt10.99□□□□□ -0.65
VMA8P32610 YBL100CYBL100C 315 nt10.97□□□□□ -0.65
VMA8P32610 PIB2YGL023C 1908 nt10.96□□□□□ -0.66
VMA8P32610 YDL221WYDL221W 552 nt10.95□□□□□ -0.66
VMA8P32610 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.93□□□□□ -0.66
VMA8P32610 BDH2YAL061W 1254 nt10.9□□□□□ -0.66
VMA8P32610 PST2YDR032C 597 nt10.88□□□□□ -0.67
VMA8P32610 YDR095CYDR095C 411 nt10.88□□□□□ -0.67
VMA8P32610 RTF1YGL244W 1677 nt10.83□□□□□ -0.68
VMA8P32610 FUN26YAL022C 1554 nt10.82□□□□□ -0.68
VMA8P32610 ALF1YNL148C 765 nt10.81□□□□□ -0.68
VMA8P32610 MCH5YOR306C 1566 nt10.8□□□□□ -0.68
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