Protein–RNA interactions for Protein: P36070

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, yeastyeast

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Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN3P36070 NSR1YGR159C 1245 nt20.27■□□□□ 0.84
RRN3P36070 YML009W-BYML009W-B 477 nt20■□□□□ 0.79
RRN3P36070 NOP1YDL014W 984 nt19.31■□□□□ 0.68
RRN3P36070 MDJ1YFL016C 1536 nt18.26■□□□□ 0.51
RRN3P36070 YKL036CYKL036C 393 nt17.54■□□□□ 0.4
RRN3P36070 SRX1YKL086W 384 nt16.95■□□□□ 0.3
RRN3P36070 Q0297Q0297 156 nt16.9■□□□□ 0.3
RRN3P36070 YJL027CYJL027C 417 nt16.79■□□□□ 0.28
RRN3P36070 DBP2YNL112W 1641 nt16.14■□□□□ 0.17
RRN3P36070 YCR051WYCR051W 669 nt15.95■□□□□ 0.14
RRN3P36070 SCS3YGL126W 1143 nt15.81■□□□□ 0.12
RRN3P36070 YBR190WYBR190W 312 nt15.7■□□□□ 0.1
RRN3P36070 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.54■□□□□ 0.08
RRN3P36070 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.54■□□□□ 0.08
RRN3P36070 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.54■□□□□ 0.08
RRN3P36070 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.54■□□□□ 0.08
RRN3P36070 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.54■□□□□ 0.08
RRN3P36070 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.54■□□□□ 0.08
RRN3P36070 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.54■□□□□ 0.08
RRN3P36070 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.54■□□□□ 0.08
RRN3P36070 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.54■□□□□ 0.08
RRN3P36070 CCC1YLR220W 969 nt15.26■□□□□ 0.03
RRN3P36070 YOL085CYOL085C 342 nt15.24■□□□□ 0.03
RRN3P36070 RTC3YHR087W 336 nt15.2■□□□□ 0.02
RRN3P36070 RPP1BYDL130W 321 nt15.12■□□□□ 0.01
RRN3P36070 PKP1YIL042C 1185 nt14.98□□□□□ -0.01
RRN3P36070 RVS167YDR388W 1449 nt14.92□□□□□ -0.02
RRN3P36070 SCJ1YMR214W 1134 nt14.9□□□□□ -0.02
RRN3P36070 PUT4YOR348C 1884 nt14.58□□□□□ -0.08
RRN3P36070 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.56□□□□□ -0.08
RRN3P36070 PET122YER153C 765 nt14.49□□□□□ -0.09
RRN3P36070 SSA3YBL075C 1950 nt14.45□□□□□ -0.1
RRN3P36070 SHR5YOL110W 714 nt14.4□□□□□ -0.1
RRN3P36070 ARE1YCR048W 1833 nt14.2□□□□□ -0.14
RRN3P36070 URN1YPR152C 1398 nt14.19□□□□□ -0.14
RRN3P36070 SCR1SCR1 522 nt14.16□□□□□ -0.14
RRN3P36070 YDJ1YNL064C 1230 nt14.12□□□□□ -0.15
RRN3P36070 ATS1YAL020C 1002 nt14.11□□□□□ -0.15
RRN3P36070 OPI9YLR338W 858 nt14.1□□□□□ -0.15
RRN3P36070 SAH1YER043C 1350 nt14.07□□□□□ -0.16
RRN3P36070 DEP1YAL013W 1218 nt14.04□□□□□ -0.16
RRN3P36070 RRN5YLR141W 1092 nt14.03□□□□□ -0.16
RRN3P36070 POA1YBR022W 534 nt14.01□□□□□ -0.17
RRN3P36070 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.93□□□□□ -0.18
RRN3P36070 RPN10YHR200W 807 nt13.84□□□□□ -0.19
RRN3P36070 YNL208WYNL208W 600 nt13.83□□□□□ -0.2
RRN3P36070 BSC6YOL137W 1494 nt13.79□□□□□ -0.2
RRN3P36070 Q0182Q0182 405 nt13.78□□□□□ -0.2
RRN3P36070 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.77□□□□□ -0.21
RRN3P36070 GAR1YHR089C 618 nt13.77□□□□□ -0.21
RRN3P36070 PUN1YLR414C 792 nt13.64□□□□□ -0.23
RRN3P36070 SPT5YML010W 3192 nt13.63□□□□□ -0.23
RRN3P36070 RSB1YOR049C 1065 nt13.56□□□□□ -0.24
RRN3P36070 PTC2YER089C 1395 nt13.53□□□□□ -0.24
RRN3P36070 BUD23YCR047C 828 nt13.51□□□□□ -0.25
RRN3P36070 YJR018WYJR018W 363 nt13.51□□□□□ -0.25
RRN3P36070 NAB2YGL122C 1578 nt13.42□□□□□ -0.26
RRN3P36070 TIR1YER011W 765 nt13.37□□□□□ -0.27
RRN3P36070 YJR120WYJR120W 351 nt13.36□□□□□ -0.27
RRN3P36070 SSA1YAL005C 1929 nt13.33□□□□□ -0.28
RRN3P36070 FIS1YIL065C 468 nt13.25□□□□□ -0.29
RRN3P36070 DAL1YIR027C 1383 nt13.18□□□□□ -0.3
RRN3P36070 SSA4YER103W 1929 nt13.14□□□□□ -0.31
RRN3P36070 PST2YDR032C 597 nt13.13□□□□□ -0.31
RRN3P36070 SRB2YHR041C 633 nt13.1□□□□□ -0.31
RRN3P36070 INM2YDR287W 879 nt13.08□□□□□ -0.32
RRN3P36070 RPP2BYDR382W 333 nt13.08□□□□□ -0.32
RRN3P36070 PHO4YFR034C 939 nt13.06□□□□□ -0.32
RRN3P36070 FPR4YLR449W 1179 nt13.02□□□□□ -0.33
RRN3P36070 MEP2YNL142W 1500 nt13.01□□□□□ -0.33
RRN3P36070 YPS1YLR120C 1710 nt12.96□□□□□ -0.33
RRN3P36070 YBL100CYBL100C 315 nt12.89□□□□□ -0.35
RRN3P36070 MOT3YMR070W 1473 nt12.88□□□□□ -0.35
RRN3P36070 BDH2YAL061W 1254 nt12.86□□□□□ -0.35
RRN3P36070 YDR095CYDR095C 411 nt12.83□□□□□ -0.36
RRN3P36070 DCW1YKL046C 1350 nt12.8□□□□□ -0.36
RRN3P36070 BDF1YLR399C 2061 nt12.75□□□□□ -0.37
RRN3P36070 FUN26YAL022C 1554 nt12.74□□□□□ -0.37
RRN3P36070 WWM1YFL010C 636 nt12.73□□□□□ -0.37
RRN3P36070 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.73□□□□□ -0.37
RRN3P36070 SHU1YHL006C 453 nt12.64□□□□□ -0.39
RRN3P36070 LSM3YLR438C-A 270 nt12.64□□□□□ -0.39
RRN3P36070 PTP1YDL230W 1008 nt12.63□□□□□ -0.39
RRN3P36070 TRM9YML014W 840 nt12.62□□□□□ -0.39
RRN3P36070 EMI2YDR516C 1503 nt12.6□□□□□ -0.39
RRN3P36070 CCT6YDR188W 1641 nt12.59□□□□□ -0.39
RRN3P36070 YKL097CYKL097C 411 nt12.56□□□□□ -0.4
RRN3P36070 RPP2AYOL039W 321 nt12.56□□□□□ -0.4
RRN3P36070 TAT1YBR069C 1860 nt12.56□□□□□ -0.4
RRN3P36070 CAC2YML102W 1407 nt12.55□□□□□ -0.4
RRN3P36070 ALF1YNL148C 765 nt12.54□□□□□ -0.4
RRN3P36070 YBR220CYBR220C 1683 nt12.54□□□□□ -0.4
RRN3P36070 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.53□□□□□ -0.4
RRN3P36070 YGR021WYGR021W 873 nt12.53□□□□□ -0.4
RRN3P36070 HOM6YJR139C 1080 nt12.53□□□□□ -0.4
RRN3P36070 SIS1YNL007C 1059 nt12.51□□□□□ -0.41
RRN3P36070 YDL221WYDL221W 552 nt12.5□□□□□ -0.41
RRN3P36070 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.5□□□□□ -0.41
RRN3P36070 YMR090WYMR090W 684 nt12.46□□□□□ -0.41
RRN3P36070 SDH1YKL148C 1923 nt12.43□□□□□ -0.42
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