Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC61.57■■■■■ 7.45
LAMC3Q9Y6N6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC61.03■■■■■ 7.36
LAMC3Q9Y6N6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC60.86■■■■■ 7.33
LAMC3Q9Y6N6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.83■■■■■ 7.17
LAMC3Q9Y6N6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.01■■■■■ 7.04
LAMC3Q9Y6N6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC58.92■■■■■ 7.02
LAMC3Q9Y6N6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.71■■■■■ 6.99
LAMC3Q9Y6N6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC58.67■■■■■ 6.98
LAMC3Q9Y6N6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC58.56■■■■■ 6.97
LAMC3Q9Y6N6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.51■■■■■ 6.96
LAMC3Q9Y6N6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.3■■■■■ 6.92
LAMC3Q9Y6N6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC58.16■■■■■ 6.9
LAMC3Q9Y6N6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC57.99■■■■■ 6.87
LAMC3Q9Y6N6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.87■■■■■ 6.86
LAMC3Q9Y6N6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.73■■■■■ 6.83
LAMC3Q9Y6N6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC57.57■■■■■ 6.81
LAMC3Q9Y6N6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC57.52■■■■■ 6.8
LAMC3Q9Y6N6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.04■■■■■ 6.72
LAMC3Q9Y6N6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC57■■■■■ 6.72
LAMC3Q9Y6N6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC56.93■■■■■ 6.7
LAMC3Q9Y6N6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.84■■■■■ 6.69
LAMC3Q9Y6N6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC56.84■■■■■ 6.69
LAMC3Q9Y6N6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC56.72■■■■■ 6.67
LAMC3Q9Y6N6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.62■■■■■ 6.65
LAMC3Q9Y6N6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.59■■■■■ 6.65
LAMC3Q9Y6N6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC56.45■■■■■ 6.63
LAMC3Q9Y6N6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC56.41■■■■■ 6.62
LAMC3Q9Y6N6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC56.38■■■■■ 6.62
LAMC3Q9Y6N6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC56.27■■■■■ 6.6
LAMC3Q9Y6N6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC56.16■■■■■ 6.58
LAMC3Q9Y6N6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.94■■■■■ 6.55
LAMC3Q9Y6N6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.8■■■■■ 6.52
LAMC3Q9Y6N6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC55.65■■■■■ 6.5
LAMC3Q9Y6N6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC55.42■■■■■ 6.46
LAMC3Q9Y6N6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC55.4■■■■■ 6.46
LAMC3Q9Y6N6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.16■■■■■ 6.42
LAMC3Q9Y6N6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC55.14■■■■■ 6.42
LAMC3Q9Y6N6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC55.04■■■■■ 6.4
LAMC3Q9Y6N6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.78■■■■■ 6.36
LAMC3Q9Y6N6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC54.59■■■■■ 6.33
LAMC3Q9Y6N6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC54.56■■■■■ 6.32
LAMC3Q9Y6N6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.55■■■■■ 6.32
LAMC3Q9Y6N6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC54.49■■■■■ 6.31
LAMC3Q9Y6N6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC54.39■■■■■ 6.3
LAMC3Q9Y6N6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC54.35■■■■■ 6.29
LAMC3Q9Y6N6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC54.35■■■■■ 6.29
LAMC3Q9Y6N6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC54.33■■■■■ 6.29
LAMC3Q9Y6N6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.31■■■■■ 6.28
LAMC3Q9Y6N6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC54.29■■■■■ 6.28
LAMC3Q9Y6N6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC54.29■■■■■ 6.28
LAMC3Q9Y6N6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC54.27■■■■■ 6.28
LAMC3Q9Y6N6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC54.17■■■■■ 6.26
LAMC3Q9Y6N6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC54.16■■■■■ 6.26
LAMC3Q9Y6N6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC54.08■■■■■ 6.25
LAMC3Q9Y6N6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC54.05■■■■■ 6.24
LAMC3Q9Y6N6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.05■■■■■ 6.24
LAMC3Q9Y6N6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC54.01■■■■■ 6.24
LAMC3Q9Y6N6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54■■■■■ 6.24
LAMC3Q9Y6N6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC54■■■■■ 6.24
LAMC3Q9Y6N6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.83■■■■■ 6.21
LAMC3Q9Y6N6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC53.75■■■■■ 6.2
LAMC3Q9Y6N6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.71■■■■■ 6.19
LAMC3Q9Y6N6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.71■■■■■ 6.19
LAMC3Q9Y6N6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC53.69■■■■■ 6.19
LAMC3Q9Y6N6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC53.57■■■■■ 6.17
LAMC3Q9Y6N6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.57■■■■■ 6.17
LAMC3Q9Y6N6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC53.5■■■■■ 6.16
LAMC3Q9Y6N6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.48■■■■■ 6.15
LAMC3Q9Y6N6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC53.44■■■■■ 6.15
LAMC3Q9Y6N6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.38■■■■■ 6.14
LAMC3Q9Y6N6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.36■■■■■ 6.13
LAMC3Q9Y6N6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC53.31■■■■■ 6.12
LAMC3Q9Y6N6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC53.26■■■■■ 6.12
LAMC3Q9Y6N6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.16■■■■■ 6.1
LAMC3Q9Y6N6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC53.16■■■■■ 6.1
LAMC3Q9Y6N6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC53.15■■■■■ 6.1
LAMC3Q9Y6N6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.13■■■■■ 6.1
LAMC3Q9Y6N6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC53.11■■■■■ 6.09
LAMC3Q9Y6N6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC53.1■■■■■ 6.09
LAMC3Q9Y6N6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.04■■■■■ 6.08
LAMC3Q9Y6N6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.03■■■■■ 6.08
LAMC3Q9Y6N6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.98■■■■■ 6.07
LAMC3Q9Y6N6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.95■■■■■ 6.07
LAMC3Q9Y6N6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC52.94■■■■■ 6.07
LAMC3Q9Y6N6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC52.93■■■■■ 6.06
LAMC3Q9Y6N6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC52.92■■■■■ 6.06
LAMC3Q9Y6N6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC52.9■■■■■ 6.06
LAMC3Q9Y6N6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.87■■■■■ 6.05
LAMC3Q9Y6N6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC52.87■■■■■ 6.05
LAMC3Q9Y6N6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC52.85■■■■■ 6.05
LAMC3Q9Y6N6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC52.85■■■■■ 6.05
LAMC3Q9Y6N6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.83■■■■■ 6.05
LAMC3Q9Y6N6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.81■■■■■ 6.04
LAMC3Q9Y6N6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC52.81■■■■■ 6.04
LAMC3Q9Y6N6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.78■■■■■ 6.04
LAMC3Q9Y6N6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC52.74■■■■■ 6.03
LAMC3Q9Y6N6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC52.72■■■■■ 6.03
LAMC3Q9Y6N6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC52.72■■■■■ 6.03
LAMC3Q9Y6N6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC52.68■■■■■ 6.02
LAMC3Q9Y6N6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC52.67■■■■■ 6.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms