Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F9

BTBD3, BTB/POZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTBD3Q9Y2F9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BTBD3Q9Y2F9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
BTBD3Q9Y2F9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
BTBD3Q9Y2F9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BTBD3Q9Y2F9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
BTBD3Q9Y2F9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
BTBD3Q9Y2F9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BTBD3Q9Y2F9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
BTBD3Q9Y2F9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
BTBD3Q9Y2F9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
BTBD3Q9Y2F9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
BTBD3Q9Y2F9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
BTBD3Q9Y2F9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
BTBD3Q9Y2F9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
BTBD3Q9Y2F9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
BTBD3Q9Y2F9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
BTBD3Q9Y2F9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
BTBD3Q9Y2F9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
BTBD3Q9Y2F9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
BTBD3Q9Y2F9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
BTBD3Q9Y2F9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
BTBD3Q9Y2F9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
BTBD3Q9Y2F9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
BTBD3Q9Y2F9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
BTBD3Q9Y2F9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BTBD3Q9Y2F9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
BTBD3Q9Y2F9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
BTBD3Q9Y2F9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
BTBD3Q9Y2F9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
BTBD3Q9Y2F9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
BTBD3Q9Y2F9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BTBD3Q9Y2F9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
BTBD3Q9Y2F9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BTBD3Q9Y2F9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
BTBD3Q9Y2F9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
BTBD3Q9Y2F9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
BTBD3Q9Y2F9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
BTBD3Q9Y2F9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
BTBD3Q9Y2F9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
BTBD3Q9Y2F9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BTBD3Q9Y2F9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BTBD3Q9Y2F9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BTBD3Q9Y2F9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BTBD3Q9Y2F9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
BTBD3Q9Y2F9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BTBD3Q9Y2F9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BTBD3Q9Y2F9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BTBD3Q9Y2F9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BTBD3Q9Y2F9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BTBD3Q9Y2F9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BTBD3Q9Y2F9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BTBD3Q9Y2F9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BTBD3Q9Y2F9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
BTBD3Q9Y2F9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BTBD3Q9Y2F9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BTBD3Q9Y2F9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BTBD3Q9Y2F9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BTBD3Q9Y2F9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BTBD3Q9Y2F9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BTBD3Q9Y2F9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BTBD3Q9Y2F9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BTBD3Q9Y2F9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BTBD3Q9Y2F9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BTBD3Q9Y2F9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BTBD3Q9Y2F9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BTBD3Q9Y2F9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BTBD3Q9Y2F9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BTBD3Q9Y2F9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BTBD3Q9Y2F9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BTBD3Q9Y2F9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BTBD3Q9Y2F9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BTBD3Q9Y2F9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
BTBD3Q9Y2F9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BTBD3Q9Y2F9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BTBD3Q9Y2F9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BTBD3Q9Y2F9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BTBD3Q9Y2F9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BTBD3Q9Y2F9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BTBD3Q9Y2F9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BTBD3Q9Y2F9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BTBD3Q9Y2F9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BTBD3Q9Y2F9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BTBD3Q9Y2F9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BTBD3Q9Y2F9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BTBD3Q9Y2F9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BTBD3Q9Y2F9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BTBD3Q9Y2F9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BTBD3Q9Y2F9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BTBD3Q9Y2F9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BTBD3Q9Y2F9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
BTBD3Q9Y2F9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BTBD3Q9Y2F9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BTBD3Q9Y2F9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BTBD3Q9Y2F9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BTBD3Q9Y2F9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BTBD3Q9Y2F9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BTBD3Q9Y2F9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BTBD3Q9Y2F9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
BTBD3Q9Y2F9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BTBD3Q9Y2F9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms