Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC64.68■■■■■ 7.95
CC2D2AQ9P2K1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC64.07■■■■■ 7.85
CC2D2AQ9P2K1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC63.73■■■■■ 7.79
CC2D2AQ9P2K1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.55■■■■■ 7.6
CC2D2AQ9P2K1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC62.28■■■■■ 7.56
CC2D2AQ9P2K1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.96■■■■■ 7.51
CC2D2AQ9P2K1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC61.91■■■■■ 7.5
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC61.69■■■■■ 7.47
CC2D2AQ9P2K1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC61.68■■■■■ 7.46
CC2D2AQ9P2K1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.59■■■■■ 7.45
CC2D2AQ9P2K1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC61.02■■■■■ 7.36
CC2D2AQ9P2K1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC61■■■■■ 7.35
CC2D2AQ9P2K1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.93■■■■■ 7.34
CC2D2AQ9P2K1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC60.75■■■■■ 7.32
CC2D2AQ9P2K1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC60.7■■■■■ 7.31
CC2D2AQ9P2K1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.57■■■■■ 7.29
CC2D2AQ9P2K1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.32■■■■■ 7.25
CC2D2AQ9P2K1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC59.92■■■■■ 7.18
CC2D2AQ9P2K1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.79■■■■■ 7.16
CC2D2AQ9P2K1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC59.79■■■■■ 7.16
CC2D2AQ9P2K1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC59.67■■■■■ 7.14
CC2D2AQ9P2K1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC59.67■■■■■ 7.14
CC2D2AQ9P2K1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC59.57■■■■■ 7.13
CC2D2AQ9P2K1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC59.57■■■■■ 7.13
CC2D2AQ9P2K1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.45■■■■■ 7.11
CC2D2AQ9P2K1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC59.4■■■■■ 7.1
CC2D2AQ9P2K1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC59.37■■■■■ 7.1
CC2D2AQ9P2K1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC59.23■■■■■ 7.07
CC2D2AQ9P2K1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC59.17■■■■■ 7.06
CC2D2AQ9P2K1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC59.16■■■■■ 7.06
CC2D2AQ9P2K1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC58.65■■■■■ 6.98
CC2D2AQ9P2K1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC58.49■■■■■ 6.95
CC2D2AQ9P2K1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC58.42■■■■■ 6.94
CC2D2AQ9P2K1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC58.41■■■■■ 6.94
CC2D2AQ9P2K1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC58.19■■■■■ 6.91
CC2D2AQ9P2K1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC58.17■■■■■ 6.9
CC2D2AQ9P2K1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC58.07■■■■■ 6.89
CC2D2AQ9P2K1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC57.61■■■■■ 6.81
CC2D2AQ9P2K1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC57.6■■■■■ 6.81
CC2D2AQ9P2K1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC57.47■■■■■ 6.79
CC2D2AQ9P2K1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC57.47■■■■■ 6.79
CC2D2AQ9P2K1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC57.33■■■■■ 6.77
CC2D2AQ9P2K1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC57.32■■■■■ 6.77
CC2D2AQ9P2K1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.27■■■■■ 6.76
CC2D2AQ9P2K1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC57.23■■■■■ 6.75
CC2D2AQ9P2K1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.21■■■■■ 6.75
CC2D2AQ9P2K1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC57.21■■■■■ 6.75
CC2D2AQ9P2K1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.12■■■■■ 6.73
CC2D2AQ9P2K1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC57.09■■■■■ 6.73
CC2D2AQ9P2K1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC56.97■■■■■ 6.71
CC2D2AQ9P2K1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC56.96■■■■■ 6.71
CC2D2AQ9P2K1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC56.95■■■■■ 6.71
CC2D2AQ9P2K1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC56.93■■■■■ 6.7
CC2D2AQ9P2K1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC56.82■■■■■ 6.69
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.82■■■■■ 6.69
CC2D2AQ9P2K1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC56.8■■■■■ 6.68
CC2D2AQ9P2K1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC56.75■■■■■ 6.68
CC2D2AQ9P2K1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.66■■■■■ 6.66
CC2D2AQ9P2K1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC56.66■■■■■ 6.66
CC2D2AQ9P2K1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC56.63■■■■■ 6.66
CC2D2AQ9P2K1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC56.57■■■■■ 6.65
CC2D2AQ9P2K1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC56.44■■■■■ 6.63
CC2D2AQ9P2K1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.43■■■■■ 6.62
CC2D2AQ9P2K1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.41■■■■■ 6.62
CC2D2AQ9P2K1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC56.31■■■■■ 6.61
CC2D2AQ9P2K1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC56.27■■■■■ 6.6
CC2D2AQ9P2K1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC56.23■■■■■ 6.59
CC2D2AQ9P2K1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC56.21■■■■■ 6.59
CC2D2AQ9P2K1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC56.19■■■■■ 6.59
CC2D2AQ9P2K1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC56.18■■■■■ 6.58
CC2D2AQ9P2K1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.15■■■■■ 6.58
CC2D2AQ9P2K1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC56.12■■■■■ 6.57
CC2D2AQ9P2K1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC56.07■■■■■ 6.57
CC2D2AQ9P2K1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC56.01■■■■■ 6.56
CC2D2AQ9P2K1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC56.01■■■■■ 6.56
CC2D2AQ9P2K1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56■■■■■ 6.56
CC2D2AQ9P2K1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.94■■■■■ 6.55
CC2D2AQ9P2K1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC55.94■■■■■ 6.54
CC2D2AQ9P2K1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.93■■■■■ 6.54
CC2D2AQ9P2K1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.93■■■■■ 6.54
CC2D2AQ9P2K1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC55.93■■■■■ 6.54
CC2D2AQ9P2K1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.9■■■■■ 6.54
CC2D2AQ9P2K1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC55.88■■■■■ 6.54
CC2D2AQ9P2K1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC55.84■■■■■ 6.53
CC2D2AQ9P2K1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC55.82■■■■■ 6.53
CC2D2AQ9P2K1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC55.79■■■■■ 6.52
CC2D2AQ9P2K1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC55.79■■■■■ 6.52
CC2D2AQ9P2K1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.75■■■■■ 6.51
CC2D2AQ9P2K1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC55.69■■■■■ 6.51
CC2D2AQ9P2K1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.68■■■■■ 6.5
CC2D2AQ9P2K1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC55.64■■■■■ 6.5
CC2D2AQ9P2K1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC55.64■■■■■ 6.5
CC2D2AQ9P2K1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.61■■■■■ 6.49
CC2D2AQ9P2K1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.54■■■■■ 6.48
CC2D2AQ9P2K1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.54■■■■■ 6.48
CC2D2AQ9P2K1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC55.52■■■■■ 6.48
CC2D2AQ9P2K1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC55.49■■■■■ 6.47
CC2D2AQ9P2K1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC55.46■■■■■ 6.47
CC2D2AQ9P2K1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC55.41■■■■■ 6.46
CC2D2AQ9P2K1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC55.37■■■■■ 6.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms