Protein–RNA interactions for Protein: Q9P273

TENM3, Teneurin-3, humanhuman

Predictions only

Length 2,699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TENM3Q9P273 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TENM3Q9P273 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TENM3Q9P273 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TENM3Q9P273 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TENM3Q9P273 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TENM3Q9P273 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TENM3Q9P273 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TENM3Q9P273 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TENM3Q9P273 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TENM3Q9P273 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TENM3Q9P273 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TENM3Q9P273 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TENM3Q9P273 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TENM3Q9P273 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TENM3Q9P273 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TENM3Q9P273 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TENM3Q9P273 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TENM3Q9P273 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TENM3Q9P273 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TENM3Q9P273 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TENM3Q9P273 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TENM3Q9P273 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TENM3Q9P273 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TENM3Q9P273 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TENM3Q9P273 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TENM3Q9P273 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TENM3Q9P273 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TENM3Q9P273 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TENM3Q9P273 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TENM3Q9P273 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TENM3Q9P273 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TENM3Q9P273 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TENM3Q9P273 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TENM3Q9P273 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TENM3Q9P273 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TENM3Q9P273 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TENM3Q9P273 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TENM3Q9P273 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TENM3Q9P273 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TENM3Q9P273 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TENM3Q9P273 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TENM3Q9P273 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TENM3Q9P273 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TENM3Q9P273 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TENM3Q9P273 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TENM3Q9P273 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TENM3Q9P273 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TENM3Q9P273 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TENM3Q9P273 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TENM3Q9P273 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TENM3Q9P273 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TENM3Q9P273 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TENM3Q9P273 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TENM3Q9P273 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TENM3Q9P273 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TENM3Q9P273 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TENM3Q9P273 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TENM3Q9P273 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TENM3Q9P273 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TENM3Q9P273 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TENM3Q9P273 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TENM3Q9P273 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TENM3Q9P273 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TENM3Q9P273 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TENM3Q9P273 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TENM3Q9P273 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TENM3Q9P273 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TENM3Q9P273 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TENM3Q9P273 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TENM3Q9P273 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TENM3Q9P273 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TENM3Q9P273 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TENM3Q9P273 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TENM3Q9P273 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TENM3Q9P273 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TENM3Q9P273 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TENM3Q9P273 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TENM3Q9P273 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TENM3Q9P273 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TENM3Q9P273 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TENM3Q9P273 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TENM3Q9P273 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TENM3Q9P273 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TENM3Q9P273 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TENM3Q9P273 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TENM3Q9P273 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TENM3Q9P273 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TENM3Q9P273 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TENM3Q9P273 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TENM3Q9P273 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TENM3Q9P273 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TENM3Q9P273 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TENM3Q9P273 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TENM3Q9P273 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TENM3Q9P273 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TENM3Q9P273 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TENM3Q9P273 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TENM3Q9P273 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TENM3Q9P273 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TENM3Q9P273 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms