Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP2-4Q9BYR9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP2-4Q9BYR9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP2-4Q9BYR9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP2-4Q9BYR9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP2-4Q9BYR9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP2-4Q9BYR9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP2-4Q9BYR9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP2-4Q9BYR9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP2-4Q9BYR9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP2-4Q9BYR9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP2-4Q9BYR9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP2-4Q9BYR9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP2-4Q9BYR9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP2-4Q9BYR9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP2-4Q9BYR9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP2-4Q9BYR9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP2-4Q9BYR9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP2-4Q9BYR9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP2-4Q9BYR9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP2-4Q9BYR9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP2-4Q9BYR9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP2-4Q9BYR9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP2-4Q9BYR9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP2-4Q9BYR9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP2-4Q9BYR9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP2-4Q9BYR9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP2-4Q9BYR9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP2-4Q9BYR9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP2-4Q9BYR9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP2-4Q9BYR9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP2-4Q9BYR9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP2-4Q9BYR9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP2-4Q9BYR9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP2-4Q9BYR9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP2-4Q9BYR9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP2-4Q9BYR9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP2-4Q9BYR9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP2-4Q9BYR9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP2-4Q9BYR9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP2-4Q9BYR9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP2-4Q9BYR9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP2-4Q9BYR9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP2-4Q9BYR9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP2-4Q9BYR9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP2-4Q9BYR9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP2-4Q9BYR9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP2-4Q9BYR9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP2-4Q9BYR9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP2-4Q9BYR9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms