Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP9-2Q9BYQ4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRTAP9-2Q9BYQ4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRTAP9-2Q9BYQ4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRTAP9-2Q9BYQ4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP9-2Q9BYQ4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP9-2Q9BYQ4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRTAP9-2Q9BYQ4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRTAP9-2Q9BYQ4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP9-2Q9BYQ4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP9-2Q9BYQ4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP9-2Q9BYQ4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP9-2Q9BYQ4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP9-2Q9BYQ4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP9-2Q9BYQ4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP9-2Q9BYQ4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP9-2Q9BYQ4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP9-2Q9BYQ4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP9-2Q9BYQ4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP9-2Q9BYQ4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP9-2Q9BYQ4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP9-2Q9BYQ4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP9-2Q9BYQ4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP9-2Q9BYQ4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRTAP9-2Q9BYQ4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP9-2Q9BYQ4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP9-2Q9BYQ4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP9-2Q9BYQ4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP9-2Q9BYQ4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP9-2Q9BYQ4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP9-2Q9BYQ4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP9-2Q9BYQ4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP9-2Q9BYQ4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP9-2Q9BYQ4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP9-2Q9BYQ4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP9-2Q9BYQ4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms