Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMUB1Q9BVT8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMUB1Q9BVT8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMUB1Q9BVT8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMUB1Q9BVT8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMUB1Q9BVT8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMUB1Q9BVT8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMUB1Q9BVT8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMUB1Q9BVT8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMUB1Q9BVT8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMUB1Q9BVT8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMUB1Q9BVT8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMUB1Q9BVT8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMUB1Q9BVT8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMUB1Q9BVT8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMUB1Q9BVT8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMUB1Q9BVT8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMUB1Q9BVT8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMUB1Q9BVT8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMUB1Q9BVT8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMUB1Q9BVT8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMUB1Q9BVT8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMUB1Q9BVT8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMUB1Q9BVT8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TMUB1Q9BVT8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TMUB1Q9BVT8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMUB1Q9BVT8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMUB1Q9BVT8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMUB1Q9BVT8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMUB1Q9BVT8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMUB1Q9BVT8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMUB1Q9BVT8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMUB1Q9BVT8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMUB1Q9BVT8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMUB1Q9BVT8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMUB1Q9BVT8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TMUB1Q9BVT8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMUB1Q9BVT8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMUB1Q9BVT8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMUB1Q9BVT8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMUB1Q9BVT8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMUB1Q9BVT8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMUB1Q9BVT8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMUB1Q9BVT8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMUB1Q9BVT8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMUB1Q9BVT8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMUB1Q9BVT8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMUB1Q9BVT8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMUB1Q9BVT8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMUB1Q9BVT8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMUB1Q9BVT8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMUB1Q9BVT8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMUB1Q9BVT8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMUB1Q9BVT8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMUB1Q9BVT8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMUB1Q9BVT8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMUB1Q9BVT8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMUB1Q9BVT8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMUB1Q9BVT8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMUB1Q9BVT8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMUB1Q9BVT8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMUB1Q9BVT8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMUB1Q9BVT8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMUB1Q9BVT8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMUB1Q9BVT8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMUB1Q9BVT8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMUB1Q9BVT8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMUB1Q9BVT8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMUB1Q9BVT8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMUB1Q9BVT8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMUB1Q9BVT8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMUB1Q9BVT8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMUB1Q9BVT8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMUB1Q9BVT8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMUB1Q9BVT8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMUB1Q9BVT8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMUB1Q9BVT8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMUB1Q9BVT8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMUB1Q9BVT8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMUB1Q9BVT8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMUB1Q9BVT8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMUB1Q9BVT8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMUB1Q9BVT8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMUB1Q9BVT8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMUB1Q9BVT8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMUB1Q9BVT8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMUB1Q9BVT8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMUB1Q9BVT8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMUB1Q9BVT8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMUB1Q9BVT8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMUB1Q9BVT8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMUB1Q9BVT8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMUB1Q9BVT8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMUB1Q9BVT8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMUB1Q9BVT8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMUB1Q9BVT8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMUB1Q9BVT8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMUB1Q9BVT8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMUB1Q9BVT8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMUB1Q9BVT8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.1 ms