Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR9

ARHGAP9, Rho GTPase-activating protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP9Q9BRR9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
ARHGAP9Q9BRR9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARHGAP9Q9BRR9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ARHGAP9Q9BRR9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ARHGAP9Q9BRR9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARHGAP9Q9BRR9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ARHGAP9Q9BRR9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARHGAP9Q9BRR9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ARHGAP9Q9BRR9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ARHGAP9Q9BRR9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGAP9Q9BRR9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ARHGAP9Q9BRR9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARHGAP9Q9BRR9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARHGAP9Q9BRR9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARHGAP9Q9BRR9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGAP9Q9BRR9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP9Q9BRR9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGAP9Q9BRR9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGAP9Q9BRR9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGAP9Q9BRR9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
ARHGAP9Q9BRR9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP9Q9BRR9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARHGAP9Q9BRR9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARHGAP9Q9BRR9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARHGAP9Q9BRR9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGAP9Q9BRR9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARHGAP9Q9BRR9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARHGAP9Q9BRR9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARHGAP9Q9BRR9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGAP9Q9BRR9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGAP9Q9BRR9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGAP9Q9BRR9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGAP9Q9BRR9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGAP9Q9BRR9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGAP9Q9BRR9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGAP9Q9BRR9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGAP9Q9BRR9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGAP9Q9BRR9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP9Q9BRR9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGAP9Q9BRR9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP9Q9BRR9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP9Q9BRR9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGAP9Q9BRR9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGAP9Q9BRR9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGAP9Q9BRR9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGAP9Q9BRR9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGAP9Q9BRR9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGAP9Q9BRR9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGAP9Q9BRR9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGAP9Q9BRR9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGAP9Q9BRR9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGAP9Q9BRR9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGAP9Q9BRR9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGAP9Q9BRR9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGAP9Q9BRR9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP9Q9BRR9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGAP9Q9BRR9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGAP9Q9BRR9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGAP9Q9BRR9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGAP9Q9BRR9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP9Q9BRR9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP9Q9BRR9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP9Q9BRR9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP9Q9BRR9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP9Q9BRR9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP9Q9BRR9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGAP9Q9BRR9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGAP9Q9BRR9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGAP9Q9BRR9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGAP9Q9BRR9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGAP9Q9BRR9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGAP9Q9BRR9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGAP9Q9BRR9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP9Q9BRR9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGAP9Q9BRR9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGAP9Q9BRR9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGAP9Q9BRR9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGAP9Q9BRR9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP9Q9BRR9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP9Q9BRR9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGAP9Q9BRR9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGAP9Q9BRR9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGAP9Q9BRR9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGAP9Q9BRR9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGAP9Q9BRR9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGAP9Q9BRR9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGAP9Q9BRR9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGAP9Q9BRR9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP9Q9BRR9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP9Q9BRR9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP9Q9BRR9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP9Q9BRR9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP9Q9BRR9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP9Q9BRR9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP9Q9BRR9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP9Q9BRR9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP9Q9BRR9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP9Q9BRR9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP9Q9BRR9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP9Q9BRR9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms