Protein–RNA interactions for Protein: Q92888

ARHGEF1, Rho guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF1Q92888 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.34■■■■■ 4.69
ARHGEF1Q92888 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
ARHGEF1Q92888 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.44■■■■■ 4.54
ARHGEF1Q92888 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
ARHGEF1Q92888 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
ARHGEF1Q92888 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
ARHGEF1Q92888 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
ARHGEF1Q92888 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
ARHGEF1Q92888 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
ARHGEF1Q92888 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
ARHGEF1Q92888 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
ARHGEF1Q92888 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ARHGEF1Q92888 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
ARHGEF1Q92888 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
ARHGEF1Q92888 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ARHGEF1Q92888 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
ARHGEF1Q92888 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ARHGEF1Q92888 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
ARHGEF1Q92888 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ARHGEF1Q92888 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ARHGEF1Q92888 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ARHGEF1Q92888 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ARHGEF1Q92888 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
ARHGEF1Q92888 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
ARHGEF1Q92888 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ARHGEF1Q92888 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
ARHGEF1Q92888 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
ARHGEF1Q92888 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
ARHGEF1Q92888 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ARHGEF1Q92888 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
ARHGEF1Q92888 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
ARHGEF1Q92888 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
ARHGEF1Q92888 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
ARHGEF1Q92888 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
ARHGEF1Q92888 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
ARHGEF1Q92888 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
ARHGEF1Q92888 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
ARHGEF1Q92888 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
ARHGEF1Q92888 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
ARHGEF1Q92888 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
ARHGEF1Q92888 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
ARHGEF1Q92888 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
ARHGEF1Q92888 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ARHGEF1Q92888 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ARHGEF1Q92888 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
ARHGEF1Q92888 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ARHGEF1Q92888 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ARHGEF1Q92888 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
ARHGEF1Q92888 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
ARHGEF1Q92888 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
ARHGEF1Q92888 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ARHGEF1Q92888 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ARHGEF1Q92888 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ARHGEF1Q92888 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
ARHGEF1Q92888 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
ARHGEF1Q92888 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ARHGEF1Q92888 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ARHGEF1Q92888 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ARHGEF1Q92888 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ARHGEF1Q92888 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ARHGEF1Q92888 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARHGEF1Q92888 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ARHGEF1Q92888 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ARHGEF1Q92888 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ARHGEF1Q92888 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF1Q92888 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
ARHGEF1Q92888 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ARHGEF1Q92888 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
ARHGEF1Q92888 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ARHGEF1Q92888 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ARHGEF1Q92888 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ARHGEF1Q92888 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ARHGEF1Q92888 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ARHGEF1Q92888 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ARHGEF1Q92888 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ARHGEF1Q92888 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
ARHGEF1Q92888 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ARHGEF1Q92888 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ARHGEF1Q92888 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ARHGEF1Q92888 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ARHGEF1Q92888 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ARHGEF1Q92888 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ARHGEF1Q92888 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ARHGEF1Q92888 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
ARHGEF1Q92888 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ARHGEF1Q92888 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ARHGEF1Q92888 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ARHGEF1Q92888 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARHGEF1Q92888 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
ARHGEF1Q92888 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARHGEF1Q92888 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ARHGEF1Q92888 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ARHGEF1Q92888 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
ARHGEF1Q92888 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ARHGEF1Q92888 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ARHGEF1Q92888 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ARHGEF1Q92888 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ARHGEF1Q92888 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ARHGEF1Q92888 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ARHGEF1Q92888 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
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