Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ7

ABCA5, ATP-binding cassette sub-family A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA5Q8WWZ7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC58.09■■■■■ 6.89
ABCA5Q8WWZ7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC57.97■■■■■ 6.87
ABCA5Q8WWZ7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.2■■■■■ 6.75
ABCA5Q8WWZ7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.81■■■■■ 6.68
ABCA5Q8WWZ7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.21■■■■■ 6.59
ABCA5Q8WWZ7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.74■■■■■ 6.51
ABCA5Q8WWZ7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.34■■■■■ 6.45
ABCA5Q8WWZ7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.32■■■■■ 6.45
ABCA5Q8WWZ7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC55.26■■■■■ 6.44
ABCA5Q8WWZ7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC55.2■■■■■ 6.43
ABCA5Q8WWZ7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.17■■■■■ 6.42
ABCA5Q8WWZ7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC55.06■■■■■ 6.41
ABCA5Q8WWZ7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC54.98■■■■■ 6.39
ABCA5Q8WWZ7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC54.92■■■■■ 6.38
ABCA5Q8WWZ7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.62■■■■■ 6.34
ABCA5Q8WWZ7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.42■■■■■ 6.3
ABCA5Q8WWZ7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.24■■■■■ 6.27
ABCA5Q8WWZ7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.14■■■■■ 6.26
ABCA5Q8WWZ7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC54.04■■■■■ 6.24
ABCA5Q8WWZ7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.73■■■■■ 6.19
ABCA5Q8WWZ7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.63■■■■■ 6.18
ABCA5Q8WWZ7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC53.63■■■■■ 6.18
ABCA5Q8WWZ7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.44■■■■■ 6.15
ABCA5Q8WWZ7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.43■■■■■ 6.14
ABCA5Q8WWZ7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC53.41■■■■■ 6.14
ABCA5Q8WWZ7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.32■■■■■ 6.13
ABCA5Q8WWZ7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC53.17■■■■■ 6.1
ABCA5Q8WWZ7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC53.09■■■■■ 6.09
ABCA5Q8WWZ7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.09■■■■■ 6.09
ABCA5Q8WWZ7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.96■■■■■ 6.07
ABCA5Q8WWZ7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC52.85■■■■■ 6.05
ABCA5Q8WWZ7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC52.85■■■■■ 6.05
ABCA5Q8WWZ7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC52.84■■■■■ 6.05
ABCA5Q8WWZ7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC52.66■■■■■ 6.02
ABCA5Q8WWZ7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC52.39■■■■■ 5.98
ABCA5Q8WWZ7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC52.37■■■■■ 5.97
ABCA5Q8WWZ7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC52.31■■■■■ 5.96
ABCA5Q8WWZ7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.22■■■■■ 5.95
ABCA5Q8WWZ7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.09■■■■■ 5.93
ABCA5Q8WWZ7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC51.94■■■■■ 5.91
ABCA5Q8WWZ7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC51.77■■■■■ 5.88
ABCA5Q8WWZ7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC51.71■■■■■ 5.87
ABCA5Q8WWZ7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.44■■■■■ 5.83
ABCA5Q8WWZ7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC51.4■■■■■ 5.82
ABCA5Q8WWZ7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
ABCA5Q8WWZ7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.27■■■■■ 5.8
ABCA5Q8WWZ7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.26■■■■■ 5.8
ABCA5Q8WWZ7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC51.23■■■■■ 5.79
ABCA5Q8WWZ7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.16■■■■■ 5.78
ABCA5Q8WWZ7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC51.13■■■■■ 5.77
ABCA5Q8WWZ7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.1■■■■■ 5.77
ABCA5Q8WWZ7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC51.08■■■■■ 5.77
ABCA5Q8WWZ7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
ABCA5Q8WWZ7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC50.95■■■■■ 5.75
ABCA5Q8WWZ7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.74
ABCA5Q8WWZ7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.89■■■■■ 5.74
ABCA5Q8WWZ7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC50.88■■■■■ 5.74
ABCA5Q8WWZ7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC50.88■■■■■ 5.74
ABCA5Q8WWZ7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.87■■■■■ 5.73
ABCA5Q8WWZ7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC50.84■■■■■ 5.73
ABCA5Q8WWZ7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.8■■■■■ 5.72
ABCA5Q8WWZ7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
ABCA5Q8WWZ7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.66■■■■■ 5.7
ABCA5Q8WWZ7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.62■■■■■ 5.69
ABCA5Q8WWZ7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.58■■■■■ 5.69
ABCA5Q8WWZ7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
ABCA5Q8WWZ7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC50.46■■■■■ 5.67
ABCA5Q8WWZ7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC50.44■■■■■ 5.67
ABCA5Q8WWZ7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.42■■■■■ 5.66
ABCA5Q8WWZ7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
ABCA5Q8WWZ7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
ABCA5Q8WWZ7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.29■■■■■ 5.64
ABCA5Q8WWZ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
ABCA5Q8WWZ7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC50.21■■■■■ 5.63
ABCA5Q8WWZ7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
ABCA5Q8WWZ7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50.18■■■■■ 5.62
ABCA5Q8WWZ7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
ABCA5Q8WWZ7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
ABCA5Q8WWZ7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC50.16■■■■■ 5.62
ABCA5Q8WWZ7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC50.16■■■■■ 5.62
ABCA5Q8WWZ7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
ABCA5Q8WWZ7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC50.13■■■■■ 5.61
ABCA5Q8WWZ7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC50.11■■■■■ 5.61
ABCA5Q8WWZ7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
ABCA5Q8WWZ7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
ABCA5Q8WWZ7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
ABCA5Q8WWZ7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
ABCA5Q8WWZ7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC49.95■■■■■ 5.59
ABCA5Q8WWZ7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC49.8■■■■■ 5.56
ABCA5Q8WWZ7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC49.8■■■■■ 5.56
ABCA5Q8WWZ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC49.79■■■■■ 5.56
ABCA5Q8WWZ7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC49.77■■■■■ 5.56
ABCA5Q8WWZ7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC49.77■■■■■ 5.56
ABCA5Q8WWZ7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
ABCA5Q8WWZ7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
ABCA5Q8WWZ7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC49.7■■■■■ 5.55
ABCA5Q8WWZ7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
ABCA5Q8WWZ7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.63■■■■■ 5.53
ABCA5Q8WWZ7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
ABCA5Q8WWZ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC49.56■■■■■ 5.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms