Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.58■■■■■ 4.09
NKX2-3Q8TAU0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
NKX2-3Q8TAU0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
NKX2-3Q8TAU0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
NKX2-3Q8TAU0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
NKX2-3Q8TAU0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NKX2-3Q8TAU0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NKX2-3Q8TAU0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
NKX2-3Q8TAU0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
NKX2-3Q8TAU0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NKX2-3Q8TAU0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NKX2-3Q8TAU0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NKX2-3Q8TAU0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
NKX2-3Q8TAU0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NKX2-3Q8TAU0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NKX2-3Q8TAU0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NKX2-3Q8TAU0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NKX2-3Q8TAU0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NKX2-3Q8TAU0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NKX2-3Q8TAU0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NKX2-3Q8TAU0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NKX2-3Q8TAU0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NKX2-3Q8TAU0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NKX2-3Q8TAU0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NKX2-3Q8TAU0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NKX2-3Q8TAU0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NKX2-3Q8TAU0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NKX2-3Q8TAU0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NKX2-3Q8TAU0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NKX2-3Q8TAU0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NKX2-3Q8TAU0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NKX2-3Q8TAU0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NKX2-3Q8TAU0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NKX2-3Q8TAU0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NKX2-3Q8TAU0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NKX2-3Q8TAU0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NKX2-3Q8TAU0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NKX2-3Q8TAU0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NKX2-3Q8TAU0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NKX2-3Q8TAU0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NKX2-3Q8TAU0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NKX2-3Q8TAU0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NKX2-3Q8TAU0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NKX2-3Q8TAU0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NKX2-3Q8TAU0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
NKX2-3Q8TAU0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
NKX2-3Q8TAU0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
NKX2-3Q8TAU0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NKX2-3Q8TAU0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NKX2-3Q8TAU0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NKX2-3Q8TAU0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NKX2-3Q8TAU0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NKX2-3Q8TAU0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NKX2-3Q8TAU0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NKX2-3Q8TAU0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NKX2-3Q8TAU0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NKX2-3Q8TAU0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
NKX2-3Q8TAU0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NKX2-3Q8TAU0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NKX2-3Q8TAU0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NKX2-3Q8TAU0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NKX2-3Q8TAU0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NKX2-3Q8TAU0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NKX2-3Q8TAU0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NKX2-3Q8TAU0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NKX2-3Q8TAU0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NKX2-3Q8TAU0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
NKX2-3Q8TAU0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NKX2-3Q8TAU0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NKX2-3Q8TAU0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NKX2-3Q8TAU0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NKX2-3Q8TAU0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NKX2-3Q8TAU0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NKX2-3Q8TAU0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NKX2-3Q8TAU0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NKX2-3Q8TAU0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NKX2-3Q8TAU0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NKX2-3Q8TAU0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NKX2-3Q8TAU0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NKX2-3Q8TAU0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NKX2-3Q8TAU0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NKX2-3Q8TAU0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NKX2-3Q8TAU0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NKX2-3Q8TAU0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NKX2-3Q8TAU0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NKX2-3Q8TAU0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NKX2-3Q8TAU0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NKX2-3Q8TAU0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NKX2-3Q8TAU0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NKX2-3Q8TAU0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NKX2-3Q8TAU0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NKX2-3Q8TAU0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NKX2-3Q8TAU0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NKX2-3Q8TAU0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NKX2-3Q8TAU0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NKX2-3Q8TAU0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NKX2-3Q8TAU0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NKX2-3Q8TAU0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NKX2-3Q8TAU0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NKX2-3Q8TAU0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms