Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM1

SEPT12, Septin-12, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT12Q8IYM1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC46.59■■■■■ 5.05
SEPT12Q8IYM1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC46.21■■■■■ 4.99
SEPT12Q8IYM1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.1■■■■■ 4.97
SEPT12Q8IYM1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
SEPT12Q8IYM1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
SEPT12Q8IYM1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
SEPT12Q8IYM1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
SEPT12Q8IYM1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
SEPT12Q8IYM1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC44.4■■■■■ 4.7
SEPT12Q8IYM1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
SEPT12Q8IYM1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
SEPT12Q8IYM1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC43.93■■■■■ 4.62
SEPT12Q8IYM1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
SEPT12Q8IYM1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
SEPT12Q8IYM1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
SEPT12Q8IYM1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
SEPT12Q8IYM1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
SEPT12Q8IYM1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
SEPT12Q8IYM1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
SEPT12Q8IYM1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
SEPT12Q8IYM1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
SEPT12Q8IYM1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
SEPT12Q8IYM1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
SEPT12Q8IYM1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
SEPT12Q8IYM1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
SEPT12Q8IYM1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
SEPT12Q8IYM1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
SEPT12Q8IYM1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
SEPT12Q8IYM1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
SEPT12Q8IYM1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SEPT12Q8IYM1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
SEPT12Q8IYM1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
SEPT12Q8IYM1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
SEPT12Q8IYM1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
SEPT12Q8IYM1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
SEPT12Q8IYM1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
SEPT12Q8IYM1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
SEPT12Q8IYM1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SEPT12Q8IYM1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SEPT12Q8IYM1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SEPT12Q8IYM1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
SEPT12Q8IYM1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
SEPT12Q8IYM1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SEPT12Q8IYM1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SEPT12Q8IYM1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
SEPT12Q8IYM1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
SEPT12Q8IYM1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.19
SEPT12Q8IYM1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
SEPT12Q8IYM1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
SEPT12Q8IYM1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SEPT12Q8IYM1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SEPT12Q8IYM1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
SEPT12Q8IYM1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
SEPT12Q8IYM1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SEPT12Q8IYM1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
SEPT12Q8IYM1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SEPT12Q8IYM1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.87■■■■■ 4.13
SEPT12Q8IYM1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
SEPT12Q8IYM1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SEPT12Q8IYM1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SEPT12Q8IYM1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SEPT12Q8IYM1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SEPT12Q8IYM1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
SEPT12Q8IYM1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
SEPT12Q8IYM1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
SEPT12Q8IYM1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SEPT12Q8IYM1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
SEPT12Q8IYM1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SEPT12Q8IYM1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SEPT12Q8IYM1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SEPT12Q8IYM1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SEPT12Q8IYM1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
SEPT12Q8IYM1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SEPT12Q8IYM1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
SEPT12Q8IYM1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
SEPT12Q8IYM1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SEPT12Q8IYM1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SEPT12Q8IYM1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SEPT12Q8IYM1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SEPT12Q8IYM1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SEPT12Q8IYM1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SEPT12Q8IYM1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
SEPT12Q8IYM1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SEPT12Q8IYM1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SEPT12Q8IYM1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SEPT12Q8IYM1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
SEPT12Q8IYM1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SEPT12Q8IYM1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SEPT12Q8IYM1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
SEPT12Q8IYM1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC40.06■■■■■ 4
SEPT12Q8IYM1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
SEPT12Q8IYM1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
SEPT12Q8IYM1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
SEPT12Q8IYM1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
SEPT12Q8IYM1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
SEPT12Q8IYM1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
SEPT12Q8IYM1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
SEPT12Q8IYM1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
SEPT12Q8IYM1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SEPT12Q8IYM1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms