Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LIX1LQ8IVB5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
LIX1LQ8IVB5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LIX1LQ8IVB5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LIX1LQ8IVB5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LIX1LQ8IVB5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LIX1LQ8IVB5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LIX1LQ8IVB5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LIX1LQ8IVB5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LIX1LQ8IVB5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LIX1LQ8IVB5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LIX1LQ8IVB5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LIX1LQ8IVB5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LIX1LQ8IVB5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LIX1LQ8IVB5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LIX1LQ8IVB5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LIX1LQ8IVB5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LIX1LQ8IVB5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LIX1LQ8IVB5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LIX1LQ8IVB5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LIX1LQ8IVB5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LIX1LQ8IVB5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LIX1LQ8IVB5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LIX1LQ8IVB5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LIX1LQ8IVB5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LIX1LQ8IVB5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LIX1LQ8IVB5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LIX1LQ8IVB5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LIX1LQ8IVB5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LIX1LQ8IVB5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LIX1LQ8IVB5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LIX1LQ8IVB5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LIX1LQ8IVB5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LIX1LQ8IVB5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LIX1LQ8IVB5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LIX1LQ8IVB5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LIX1LQ8IVB5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LIX1LQ8IVB5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LIX1LQ8IVB5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LIX1LQ8IVB5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LIX1LQ8IVB5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIX1LQ8IVB5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LIX1LQ8IVB5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LIX1LQ8IVB5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIX1LQ8IVB5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIX1LQ8IVB5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIX1LQ8IVB5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LIX1LQ8IVB5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LIX1LQ8IVB5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LIX1LQ8IVB5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LIX1LQ8IVB5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LIX1LQ8IVB5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIX1LQ8IVB5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LIX1LQ8IVB5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIX1LQ8IVB5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIX1LQ8IVB5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LIX1LQ8IVB5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LIX1LQ8IVB5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIX1LQ8IVB5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LIX1LQ8IVB5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIX1LQ8IVB5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIX1LQ8IVB5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LIX1LQ8IVB5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIX1LQ8IVB5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIX1LQ8IVB5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LIX1LQ8IVB5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIX1LQ8IVB5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LIX1LQ8IVB5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LIX1LQ8IVB5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LIX1LQ8IVB5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIX1LQ8IVB5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LIX1LQ8IVB5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LIX1LQ8IVB5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIX1LQ8IVB5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIX1LQ8IVB5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIX1LQ8IVB5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIX1LQ8IVB5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIX1LQ8IVB5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIX1LQ8IVB5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIX1LQ8IVB5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIX1LQ8IVB5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIX1LQ8IVB5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIX1LQ8IVB5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LIX1LQ8IVB5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LIX1LQ8IVB5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LIX1LQ8IVB5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LIX1LQ8IVB5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LIX1LQ8IVB5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LIX1LQ8IVB5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LIX1LQ8IVB5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LIX1LQ8IVB5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LIX1LQ8IVB5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LIX1LQ8IVB5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIX1LQ8IVB5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIX1LQ8IVB5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIX1LQ8IVB5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LIX1LQ8IVB5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LIX1LQ8IVB5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LIX1LQ8IVB5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LIX1LQ8IVB5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms