Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC57.88■■■■■ 6.86
PBRM1Q86U86 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC57.85■■■■■ 6.85
PBRM1Q86U86 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.19■■■■■ 6.75
PBRM1Q86U86 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.59■■■■■ 6.65
PBRM1Q86U86 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.03■■■■■ 6.56
PBRM1Q86U86 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.53■■■■■ 6.48
PBRM1Q86U86 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.3■■■■■ 6.44
PBRM1Q86U86 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.3■■■■■ 6.44
PBRM1Q86U86 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC55.29■■■■■ 6.44
PBRM1Q86U86 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC55.01■■■■■ 6.4
PBRM1Q86U86 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC55.01■■■■■ 6.4
PBRM1Q86U86 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.98■■■■■ 6.39
PBRM1Q86U86 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC54.95■■■■■ 6.39
PBRM1Q86U86 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC54.84■■■■■ 6.37
PBRM1Q86U86 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.68■■■■■ 6.34
PBRM1Q86U86 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.4■■■■■ 6.3
PBRM1Q86U86 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.15■■■■■ 6.26
PBRM1Q86U86 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.01■■■■■ 6.24
PBRM1Q86U86 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.86■■■■■ 6.21
PBRM1Q86U86 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.84■■■■■ 6.21
PBRM1Q86U86 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.63■■■■■ 6.18
PBRM1Q86U86 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC53.63■■■■■ 6.18
PBRM1Q86U86 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.51■■■■■ 6.16
PBRM1Q86U86 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.41■■■■■ 6.14
PBRM1Q86U86 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC53.39■■■■■ 6.14
PBRM1Q86U86 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.13■■■■■ 6.1
PBRM1Q86U86 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.1■■■■■ 6.09
PBRM1Q86U86 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC53.01■■■■■ 6.08
PBRM1Q86U86 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC52.88■■■■■ 6.06
PBRM1Q86U86 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC52.86■■■■■ 6.05
PBRM1Q86U86 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC52.86■■■■■ 6.05
PBRM1Q86U86 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC52.82■■■■■ 6.05
PBRM1Q86U86 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.71■■■■■ 6.03
PBRM1Q86U86 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC52.45■■■■■ 5.99
PBRM1Q86U86 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC52.3■■■■■ 5.96
PBRM1Q86U86 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
PBRM1Q86U86 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC52.23■■■■■ 5.95
PBRM1Q86U86 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC52.09■■■■■ 5.93
PBRM1Q86U86 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC51.99■■■■■ 5.91
PBRM1Q86U86 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.87■■■■■ 5.89
PBRM1Q86U86 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC51.81■■■■■ 5.89
PBRM1Q86U86 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC51.64■■■■■ 5.86
PBRM1Q86U86 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.81
PBRM1Q86U86 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.28■■■■■ 5.8
PBRM1Q86U86 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
PBRM1Q86U86 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
PBRM1Q86U86 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.18■■■■■ 5.78
PBRM1Q86U86 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC51.16■■■■■ 5.78
PBRM1Q86U86 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC51.08■■■■■ 5.77
PBRM1Q86U86 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC51.07■■■■■ 5.77
PBRM1Q86U86 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC51.06■■■■■ 5.76
PBRM1Q86U86 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
PBRM1Q86U86 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC50.98■■■■■ 5.75
PBRM1Q86U86 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.75
PBRM1Q86U86 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC50.93■■■■■ 5.74
PBRM1Q86U86 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
PBRM1Q86U86 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC50.9■■■■■ 5.74
PBRM1Q86U86 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC50.88■■■■■ 5.74
PBRM1Q86U86 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.81■■■■■ 5.72
PBRM1Q86U86 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
PBRM1Q86U86 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.76■■■■■ 5.72
PBRM1Q86U86 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.65■■■■■ 5.7
PBRM1Q86U86 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
PBRM1Q86U86 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
PBRM1Q86U86 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
PBRM1Q86U86 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.46■■■■■ 5.67
PBRM1Q86U86 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC50.44■■■■■ 5.66
PBRM1Q86U86 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC50.43■■■■■ 5.66
PBRM1Q86U86 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
PBRM1Q86U86 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.35■■■■■ 5.65
PBRM1Q86U86 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC50.32■■■■■ 5.65
PBRM1Q86U86 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.32■■■■■ 5.65
PBRM1Q86U86 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC50.3■■■■■ 5.64
PBRM1Q86U86 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
PBRM1Q86U86 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50.16■■■■■ 5.62
PBRM1Q86U86 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.09■■■■■ 5.61
PBRM1Q86U86 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.08■■■■■ 5.61
PBRM1Q86U86 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC50.08■■■■■ 5.61
PBRM1Q86U86 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC50.06■■■■■ 5.6
PBRM1Q86U86 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
PBRM1Q86U86 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
PBRM1Q86U86 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
PBRM1Q86U86 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC49.99■■■■■ 5.59
PBRM1Q86U86 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
PBRM1Q86U86 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.9■■■■■ 5.58
PBRM1Q86U86 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC49.86■■■■■ 5.57
PBRM1Q86U86 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
PBRM1Q86U86 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC49.84■■■■■ 5.57
PBRM1Q86U86 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC49.84■■■■■ 5.57
PBRM1Q86U86 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC49.84■■■■■ 5.57
PBRM1Q86U86 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
PBRM1Q86U86 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC49.77■■■■■ 5.56
PBRM1Q86U86 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
PBRM1Q86U86 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC49.74■■■■■ 5.55
PBRM1Q86U86 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.71■■■■■ 5.55
PBRM1Q86U86 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC49.66■■■■■ 5.54
PBRM1Q86U86 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC49.66■■■■■ 5.54
PBRM1Q86U86 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC49.66■■■■■ 5.54
PBRM1Q86U86 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.54
PBRM1Q86U86 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC49.62■■■■■ 5.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms