Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MED13LQ71F56 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MED13LQ71F56 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MED13LQ71F56 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MED13LQ71F56 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED13LQ71F56 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED13LQ71F56 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MED13LQ71F56 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MED13LQ71F56 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MED13LQ71F56 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MED13LQ71F56 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED13LQ71F56 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MED13LQ71F56 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MED13LQ71F56 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MED13LQ71F56 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MED13LQ71F56 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MED13LQ71F56 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED13LQ71F56 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MED13LQ71F56 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED13LQ71F56 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MED13LQ71F56 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MED13LQ71F56 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MED13LQ71F56 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MED13LQ71F56 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MED13LQ71F56 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MED13LQ71F56 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MED13LQ71F56 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MED13LQ71F56 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MED13LQ71F56 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MED13LQ71F56 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MED13LQ71F56 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MED13LQ71F56 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED13LQ71F56 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MED13LQ71F56 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
MED13LQ71F56 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MED13LQ71F56 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MED13LQ71F56 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MED13LQ71F56 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MED13LQ71F56 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED13LQ71F56 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MED13LQ71F56 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED13LQ71F56 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MED13LQ71F56 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MED13LQ71F56 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MED13LQ71F56 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MED13LQ71F56 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MED13LQ71F56 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MED13LQ71F56 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MED13LQ71F56 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MED13LQ71F56 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
MED13LQ71F56 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED13LQ71F56 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED13LQ71F56 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED13LQ71F56 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MED13LQ71F56 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MED13LQ71F56 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MED13LQ71F56 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MED13LQ71F56 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED13LQ71F56 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED13LQ71F56 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED13LQ71F56 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED13LQ71F56 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED13LQ71F56 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED13LQ71F56 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED13LQ71F56 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED13LQ71F56 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED13LQ71F56 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED13LQ71F56 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED13LQ71F56 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED13LQ71F56 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED13LQ71F56 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MED13LQ71F56 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED13LQ71F56 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED13LQ71F56 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED13LQ71F56 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED13LQ71F56 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED13LQ71F56 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED13LQ71F56 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED13LQ71F56 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MED13LQ71F56 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MED13LQ71F56 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED13LQ71F56 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED13LQ71F56 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED13LQ71F56 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED13LQ71F56 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MED13LQ71F56 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MED13LQ71F56 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MED13LQ71F56 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED13LQ71F56 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED13LQ71F56 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED13LQ71F56 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MED13LQ71F56 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED13LQ71F56 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED13LQ71F56 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED13LQ71F56 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED13LQ71F56 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MED13LQ71F56 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED13LQ71F56 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED13LQ71F56 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED13LQ71F56 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.6 ms