Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
OTUD7BQ6GQQ9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.38■■■■■ 4.06
OTUD7BQ6GQQ9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
OTUD7BQ6GQQ9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
OTUD7BQ6GQQ9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
OTUD7BQ6GQQ9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
OTUD7BQ6GQQ9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
OTUD7BQ6GQQ9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
OTUD7BQ6GQQ9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
OTUD7BQ6GQQ9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
OTUD7BQ6GQQ9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
OTUD7BQ6GQQ9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
OTUD7BQ6GQQ9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
OTUD7BQ6GQQ9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
OTUD7BQ6GQQ9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
OTUD7BQ6GQQ9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
OTUD7BQ6GQQ9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
OTUD7BQ6GQQ9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
OTUD7BQ6GQQ9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
OTUD7BQ6GQQ9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
OTUD7BQ6GQQ9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
OTUD7BQ6GQQ9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
OTUD7BQ6GQQ9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
OTUD7BQ6GQQ9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
OTUD7BQ6GQQ9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
OTUD7BQ6GQQ9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
OTUD7BQ6GQQ9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
OTUD7BQ6GQQ9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
OTUD7BQ6GQQ9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
OTUD7BQ6GQQ9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
OTUD7BQ6GQQ9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
OTUD7BQ6GQQ9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
OTUD7BQ6GQQ9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
OTUD7BQ6GQQ9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
OTUD7BQ6GQQ9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
OTUD7BQ6GQQ9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
OTUD7BQ6GQQ9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
OTUD7BQ6GQQ9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
OTUD7BQ6GQQ9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
OTUD7BQ6GQQ9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
OTUD7BQ6GQQ9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
OTUD7BQ6GQQ9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
OTUD7BQ6GQQ9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
OTUD7BQ6GQQ9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
OTUD7BQ6GQQ9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
OTUD7BQ6GQQ9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
OTUD7BQ6GQQ9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
OTUD7BQ6GQQ9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
OTUD7BQ6GQQ9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
OTUD7BQ6GQQ9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
OTUD7BQ6GQQ9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
OTUD7BQ6GQQ9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
OTUD7BQ6GQQ9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
OTUD7BQ6GQQ9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
OTUD7BQ6GQQ9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
OTUD7BQ6GQQ9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
OTUD7BQ6GQQ9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
OTUD7BQ6GQQ9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
OTUD7BQ6GQQ9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
OTUD7BQ6GQQ9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
OTUD7BQ6GQQ9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
OTUD7BQ6GQQ9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
OTUD7BQ6GQQ9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
OTUD7BQ6GQQ9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
OTUD7BQ6GQQ9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
OTUD7BQ6GQQ9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
OTUD7BQ6GQQ9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
OTUD7BQ6GQQ9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
OTUD7BQ6GQQ9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
OTUD7BQ6GQQ9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
OTUD7BQ6GQQ9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
OTUD7BQ6GQQ9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
OTUD7BQ6GQQ9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
OTUD7BQ6GQQ9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
OTUD7BQ6GQQ9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
OTUD7BQ6GQQ9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
OTUD7BQ6GQQ9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
OTUD7BQ6GQQ9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
OTUD7BQ6GQQ9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
OTUD7BQ6GQQ9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
OTUD7BQ6GQQ9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
OTUD7BQ6GQQ9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
OTUD7BQ6GQQ9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
OTUD7BQ6GQQ9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
OTUD7BQ6GQQ9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
OTUD7BQ6GQQ9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
OTUD7BQ6GQQ9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
OTUD7BQ6GQQ9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
OTUD7BQ6GQQ9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
OTUD7BQ6GQQ9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
OTUD7BQ6GQQ9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
OTUD7BQ6GQQ9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
OTUD7BQ6GQQ9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
OTUD7BQ6GQQ9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
OTUD7BQ6GQQ9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
OTUD7BQ6GQQ9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
OTUD7BQ6GQQ9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
OTUD7BQ6GQQ9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
OTUD7BQ6GQQ9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms