Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC48.15■■■■■ 5.3
SHPRHQ149N8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.67■■■■■ 5.22
SHPRHQ149N8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC47.53■■■■■ 5.2
SHPRHQ149N8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
SHPRHQ149N8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
SHPRHQ149N8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
SHPRHQ149N8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
SHPRHQ149N8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
SHPRHQ149N8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC45.96■■■■■ 4.95
SHPRHQ149N8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
SHPRHQ149N8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
SHPRHQ149N8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.37■■■■■ 4.85
SHPRHQ149N8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
SHPRHQ149N8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
SHPRHQ149N8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
SHPRHQ149N8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
SHPRHQ149N8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
SHPRHQ149N8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
SHPRHQ149N8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
SHPRHQ149N8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
SHPRHQ149N8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
SHPRHQ149N8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
SHPRHQ149N8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC44.4■■■■■ 4.7
SHPRHQ149N8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
SHPRHQ149N8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SHPRHQ149N8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
SHPRHQ149N8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
SHPRHQ149N8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC44.03■■■■■ 4.64
SHPRHQ149N8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
SHPRHQ149N8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
SHPRHQ149N8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
SHPRHQ149N8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
SHPRHQ149N8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
SHPRHQ149N8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
SHPRHQ149N8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
SHPRHQ149N8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
SHPRHQ149N8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
SHPRHQ149N8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
SHPRHQ149N8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
SHPRHQ149N8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
SHPRHQ149N8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
SHPRHQ149N8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
SHPRHQ149N8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SHPRHQ149N8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
SHPRHQ149N8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
SHPRHQ149N8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
SHPRHQ149N8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.42
SHPRHQ149N8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
SHPRHQ149N8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SHPRHQ149N8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.39
SHPRHQ149N8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
SHPRHQ149N8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SHPRHQ149N8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
SHPRHQ149N8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
SHPRHQ149N8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
SHPRHQ149N8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SHPRHQ149N8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
SHPRHQ149N8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
SHPRHQ149N8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SHPRHQ149N8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SHPRHQ149N8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
SHPRHQ149N8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SHPRHQ149N8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
SHPRHQ149N8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
SHPRHQ149N8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
SHPRHQ149N8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SHPRHQ149N8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SHPRHQ149N8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
SHPRHQ149N8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SHPRHQ149N8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
SHPRHQ149N8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SHPRHQ149N8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
SHPRHQ149N8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
SHPRHQ149N8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
SHPRHQ149N8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SHPRHQ149N8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SHPRHQ149N8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SHPRHQ149N8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
SHPRHQ149N8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SHPRHQ149N8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
SHPRHQ149N8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SHPRHQ149N8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SHPRHQ149N8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SHPRHQ149N8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
SHPRHQ149N8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SHPRHQ149N8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
SHPRHQ149N8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
SHPRHQ149N8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
SHPRHQ149N8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SHPRHQ149N8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SHPRHQ149N8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SHPRHQ149N8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SHPRHQ149N8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SHPRHQ149N8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SHPRHQ149N8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SHPRHQ149N8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
SHPRHQ149N8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
SHPRHQ149N8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SHPRHQ149N8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SHPRHQ149N8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
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