Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC49■■■■■ 5.43
PTCH1Q13635 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC48.75■■■■■ 5.39
PTCH1Q13635 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.01■■■■■ 5.28
PTCH1Q13635 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
PTCH1Q13635 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
PTCH1Q13635 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.05■■■■■ 5.12
PTCH1Q13635 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
PTCH1Q13635 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.64■■■■■ 5.06
PTCH1Q13635 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
PTCH1Q13635 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC46.42■■■■■ 5.02
PTCH1Q13635 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.25■■■■■ 4.99
PTCH1Q13635 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.23■■■■■ 4.99
PTCH1Q13635 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
PTCH1Q13635 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
PTCH1Q13635 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
PTCH1Q13635 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
PTCH1Q13635 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
PTCH1Q13635 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
PTCH1Q13635 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
PTCH1Q13635 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
PTCH1Q13635 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
PTCH1Q13635 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
PTCH1Q13635 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
PTCH1Q13635 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC44.92■■■■■ 4.78
PTCH1Q13635 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
PTCH1Q13635 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.86■■■■■ 4.77
PTCH1Q13635 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
PTCH1Q13635 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
PTCH1Q13635 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
PTCH1Q13635 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
PTCH1Q13635 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
PTCH1Q13635 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC44.37■■■■■ 4.69
PTCH1Q13635 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
PTCH1Q13635 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC44.33■■■■■ 4.69
PTCH1Q13635 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
PTCH1Q13635 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
PTCH1Q13635 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
PTCH1Q13635 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
PTCH1Q13635 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
PTCH1Q13635 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
PTCH1Q13635 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
PTCH1Q13635 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
PTCH1Q13635 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
PTCH1Q13635 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
PTCH1Q13635 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
PTCH1Q13635 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
PTCH1Q13635 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
PTCH1Q13635 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
PTCH1Q13635 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
PTCH1Q13635 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
PTCH1Q13635 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
PTCH1Q13635 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
PTCH1Q13635 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
PTCH1Q13635 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
PTCH1Q13635 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
PTCH1Q13635 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
PTCH1Q13635 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
PTCH1Q13635 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
PTCH1Q13635 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
PTCH1Q13635 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
PTCH1Q13635 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
PTCH1Q13635 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
PTCH1Q13635 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
PTCH1Q13635 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
PTCH1Q13635 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
PTCH1Q13635 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PTCH1Q13635 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
PTCH1Q13635 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
PTCH1Q13635 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
PTCH1Q13635 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
PTCH1Q13635 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
PTCH1Q13635 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
PTCH1Q13635 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
PTCH1Q13635 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
PTCH1Q13635 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
PTCH1Q13635 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
PTCH1Q13635 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
PTCH1Q13635 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
PTCH1Q13635 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
PTCH1Q13635 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
PTCH1Q13635 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
PTCH1Q13635 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
PTCH1Q13635 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PTCH1Q13635 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.09■■■■■ 4.33
PTCH1Q13635 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
PTCH1Q13635 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC42.01■■■■■ 4.32
PTCH1Q13635 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
PTCH1Q13635 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
PTCH1Q13635 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
PTCH1Q13635 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
PTCH1Q13635 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
PTCH1Q13635 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
PTCH1Q13635 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
PTCH1Q13635 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
PTCH1Q13635 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
PTCH1Q13635 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
PTCH1Q13635 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
PTCH1Q13635 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
PTCH1Q13635 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
PTCH1Q13635 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
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