Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CDH18Q13634 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CDH18Q13634 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDH18Q13634 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDH18Q13634 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CDH18Q13634 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDH18Q13634 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CDH18Q13634 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CDH18Q13634 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CDH18Q13634 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDH18Q13634 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDH18Q13634 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDH18Q13634 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CDH18Q13634 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CDH18Q13634 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CDH18Q13634 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDH18Q13634 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CDH18Q13634 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDH18Q13634 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDH18Q13634 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CDH18Q13634 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
CDH18Q13634 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDH18Q13634 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDH18Q13634 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CDH18Q13634 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDH18Q13634 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDH18Q13634 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CDH18Q13634 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CDH18Q13634 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDH18Q13634 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CDH18Q13634 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CDH18Q13634 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDH18Q13634 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDH18Q13634 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDH18Q13634 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDH18Q13634 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDH18Q13634 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDH18Q13634 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CDH18Q13634 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDH18Q13634 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDH18Q13634 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDH18Q13634 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDH18Q13634 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDH18Q13634 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDH18Q13634 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CDH18Q13634 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDH18Q13634 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDH18Q13634 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CDH18Q13634 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CDH18Q13634 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CDH18Q13634 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CDH18Q13634 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDH18Q13634 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CDH18Q13634 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDH18Q13634 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CDH18Q13634 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CDH18Q13634 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CDH18Q13634 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDH18Q13634 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDH18Q13634 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDH18Q13634 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDH18Q13634 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDH18Q13634 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDH18Q13634 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDH18Q13634 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDH18Q13634 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDH18Q13634 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDH18Q13634 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDH18Q13634 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDH18Q13634 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CDH18Q13634 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDH18Q13634 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDH18Q13634 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDH18Q13634 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDH18Q13634 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDH18Q13634 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDH18Q13634 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDH18Q13634 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDH18Q13634 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDH18Q13634 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CDH18Q13634 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDH18Q13634 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDH18Q13634 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDH18Q13634 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDH18Q13634 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDH18Q13634 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDH18Q13634 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDH18Q13634 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CDH18Q13634 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CDH18Q13634 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDH18Q13634 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDH18Q13634 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDH18Q13634 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDH18Q13634 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDH18Q13634 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDH18Q13634 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDH18Q13634 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDH18Q13634 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CDH18Q13634 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDH18Q13634 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
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