Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SIM1P81133 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SIM1P81133 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SIM1P81133 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SIM1P81133 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SIM1P81133 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIM1P81133 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIM1P81133 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SIM1P81133 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SIM1P81133 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SIM1P81133 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIM1P81133 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SIM1P81133 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
SIM1P81133 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SIM1P81133 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SIM1P81133 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SIM1P81133 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SIM1P81133 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SIM1P81133 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SIM1P81133 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIM1P81133 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIM1P81133 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SIM1P81133 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SIM1P81133 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SIM1P81133 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIM1P81133 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SIM1P81133 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SIM1P81133 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SIM1P81133 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SIM1P81133 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SIM1P81133 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIM1P81133 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SIM1P81133 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SIM1P81133 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SIM1P81133 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SIM1P81133 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SIM1P81133 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIM1P81133 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIM1P81133 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SIM1P81133 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIM1P81133 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIM1P81133 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SIM1P81133 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIM1P81133 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIM1P81133 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIM1P81133 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIM1P81133 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIM1P81133 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIM1P81133 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIM1P81133 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIM1P81133 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIM1P81133 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIM1P81133 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIM1P81133 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIM1P81133 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIM1P81133 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIM1P81133 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIM1P81133 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIM1P81133 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIM1P81133 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIM1P81133 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIM1P81133 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIM1P81133 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIM1P81133 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIM1P81133 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIM1P81133 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIM1P81133 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIM1P81133 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIM1P81133 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIM1P81133 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIM1P81133 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIM1P81133 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIM1P81133 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIM1P81133 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIM1P81133 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIM1P81133 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIM1P81133 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIM1P81133 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIM1P81133 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIM1P81133 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SIM1P81133 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIM1P81133 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIM1P81133 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIM1P81133 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIM1P81133 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIM1P81133 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIM1P81133 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIM1P81133 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIM1P81133 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIM1P81133 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIM1P81133 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIM1P81133 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIM1P81133 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIM1P81133 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIM1P81133 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIM1P81133 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIM1P81133 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIM1P81133 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIM1P81133 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIM1P81133 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms