Protein–RNA interactions for Protein: P60411

KRTAP10-9, Keratin-associated protein 10-9, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-9P60411 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRTAP10-9P60411 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRTAP10-9P60411 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRTAP10-9P60411 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRTAP10-9P60411 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRTAP10-9P60411 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRTAP10-9P60411 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRTAP10-9P60411 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRTAP10-9P60411 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRTAP10-9P60411 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRTAP10-9P60411 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRTAP10-9P60411 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRTAP10-9P60411 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRTAP10-9P60411 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KRTAP10-9P60411 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRTAP10-9P60411 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRTAP10-9P60411 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRTAP10-9P60411 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRTAP10-9P60411 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRTAP10-9P60411 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRTAP10-9P60411 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRTAP10-9P60411 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRTAP10-9P60411 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRTAP10-9P60411 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRTAP10-9P60411 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRTAP10-9P60411 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRTAP10-9P60411 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRTAP10-9P60411 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KRTAP10-9P60411 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRTAP10-9P60411 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KRTAP10-9P60411 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRTAP10-9P60411 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRTAP10-9P60411 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRTAP10-9P60411 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRTAP10-9P60411 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KRTAP10-9P60411 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRTAP10-9P60411 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRTAP10-9P60411 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRTAP10-9P60411 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KRTAP10-9P60411 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRTAP10-9P60411 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRTAP10-9P60411 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRTAP10-9P60411 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRTAP10-9P60411 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRTAP10-9P60411 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRTAP10-9P60411 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRTAP10-9P60411 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRTAP10-9P60411 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRTAP10-9P60411 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRTAP10-9P60411 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRTAP10-9P60411 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRTAP10-9P60411 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRTAP10-9P60411 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRTAP10-9P60411 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRTAP10-9P60411 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRTAP10-9P60411 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRTAP10-9P60411 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRTAP10-9P60411 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRTAP10-9P60411 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRTAP10-9P60411 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRTAP10-9P60411 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRTAP10-9P60411 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRTAP10-9P60411 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRTAP10-9P60411 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRTAP10-9P60411 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRTAP10-9P60411 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRTAP10-9P60411 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRTAP10-9P60411 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRTAP10-9P60411 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRTAP10-9P60411 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRTAP10-9P60411 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRTAP10-9P60411 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRTAP10-9P60411 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRTAP10-9P60411 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KRTAP10-9P60411 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRTAP10-9P60411 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRTAP10-9P60411 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRTAP10-9P60411 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRTAP10-9P60411 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRTAP10-9P60411 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRTAP10-9P60411 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRTAP10-9P60411 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRTAP10-9P60411 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRTAP10-9P60411 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRTAP10-9P60411 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KRTAP10-9P60411 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRTAP10-9P60411 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRTAP10-9P60411 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRTAP10-9P60411 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRTAP10-9P60411 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRTAP10-9P60411 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRTAP10-9P60411 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRTAP10-9P60411 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRTAP10-9P60411 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRTAP10-9P60411 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRTAP10-9P60411 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRTAP10-9P60411 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRTAP10-9P60411 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRTAP10-9P60411 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRTAP10-9P60411 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms