Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIPPLY3P57055 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIPPLY3P57055 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIPPLY3P57055 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIPPLY3P57055 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIPPLY3P57055 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPPLY3P57055 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIPPLY3P57055 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIPPLY3P57055 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIPPLY3P57055 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIPPLY3P57055 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIPPLY3P57055 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIPPLY3P57055 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIPPLY3P57055 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RIPPLY3P57055 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIPPLY3P57055 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIPPLY3P57055 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPPLY3P57055 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIPPLY3P57055 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIPPLY3P57055 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPPLY3P57055 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPPLY3P57055 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPPLY3P57055 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPPLY3P57055 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPPLY3P57055 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPPLY3P57055 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPPLY3P57055 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIPPLY3P57055 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIPPLY3P57055 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RIPPLY3P57055 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIPPLY3P57055 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIPPLY3P57055 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIPPLY3P57055 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIPPLY3P57055 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIPPLY3P57055 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIPPLY3P57055 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPPLY3P57055 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIPPLY3P57055 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIPPLY3P57055 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIPPLY3P57055 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPPLY3P57055 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPPLY3P57055 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPPLY3P57055 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPPLY3P57055 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPPLY3P57055 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPPLY3P57055 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPPLY3P57055 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPPLY3P57055 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPPLY3P57055 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPPLY3P57055 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIPPLY3P57055 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIPPLY3P57055 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPPLY3P57055 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPPLY3P57055 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPPLY3P57055 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPPLY3P57055 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIPPLY3P57055 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIPPLY3P57055 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIPPLY3P57055 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIPPLY3P57055 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIPPLY3P57055 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RIPPLY3P57055 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIPPLY3P57055 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPPLY3P57055 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPPLY3P57055 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIPPLY3P57055 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIPPLY3P57055 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIPPLY3P57055 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPPLY3P57055 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIPPLY3P57055 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPPLY3P57055 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPPLY3P57055 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPPLY3P57055 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPPLY3P57055 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPPLY3P57055 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPPLY3P57055 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPPLY3P57055 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPPLY3P57055 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPPLY3P57055 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPPLY3P57055 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIPPLY3P57055 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIPPLY3P57055 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPPLY3P57055 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPPLY3P57055 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPPLY3P57055 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPPLY3P57055 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPPLY3P57055 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPPLY3P57055 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPPLY3P57055 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPPLY3P57055 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPPLY3P57055 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPPLY3P57055 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPPLY3P57055 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPPLY3P57055 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPPLY3P57055 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPPLY3P57055 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPPLY3P57055 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPPLY3P57055 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPPLY3P57055 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPPLY3P57055 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms