Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC61.7■■■■■ 7.47
NESP48681 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC61.2■■■■■ 7.39
NESP48681 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC61.07■■■■■ 7.37
NESP48681 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.94■■■■■ 7.19
NESP48681 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC59.26■■■■■ 7.08
NESP48681 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.13■■■■■ 7.06
NESP48681 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC59.01■■■■■ 7.04
NESP48681 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.92■■■■■ 7.02
NESP48681 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.85■■■■■ 7.01
NESP48681 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC58.81■■■■■ 7.01
NESP48681 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.4■■■■■ 6.94
NESP48681 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC58.34■■■■■ 6.93
NESP48681 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC58.16■■■■■ 6.9
NESP48681 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.09■■■■■ 6.89
NESP48681 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC57.95■■■■■ 6.87
NESP48681 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.92■■■■■ 6.86
NESP48681 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC57.64■■■■■ 6.82
NESP48681 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.44■■■■■ 6.79
NESP48681 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC57.2■■■■■ 6.75
NESP48681 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.11■■■■■ 6.73
NESP48681 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC57.11■■■■■ 6.73
NESP48681 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC56.99■■■■■ 6.71
NESP48681 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC56.94■■■■■ 6.71
NESP48681 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.8■■■■■ 6.68
NESP48681 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.77■■■■■ 6.68
NESP48681 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC56.69■■■■■ 6.67
NESP48681 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC56.68■■■■■ 6.66
NESP48681 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC56.52■■■■■ 6.64
NESP48681 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC56.45■■■■■ 6.63
NESP48681 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.42■■■■■ 6.62
NESP48681 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC56.39■■■■■ 6.62
NESP48681 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.12■■■■■ 6.57
NESP48681 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC55.75■■■■■ 6.52
NESP48681 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC55.66■■■■■ 6.5
NESP48681 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC55.62■■■■■ 6.49
NESP48681 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC55.35■■■■■ 6.45
NESP48681 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.24■■■■■ 6.43
NESP48681 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.17■■■■■ 6.42
NESP48681 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC54.92■■■■■ 6.38
NESP48681 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC54.92■■■■■ 6.38
NESP48681 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC54.81■■■■■ 6.37
NESP48681 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC54.78■■■■■ 6.36
NESP48681 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC54.77■■■■■ 6.36
NESP48681 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC54.77■■■■■ 6.36
NESP48681 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC54.68■■■■■ 6.34
NESP48681 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.63■■■■■ 6.34
NESP48681 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC54.55■■■■■ 6.32
NESP48681 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.52■■■■■ 6.32
NESP48681 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC54.5■■■■■ 6.32
NESP48681 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC54.5■■■■■ 6.31
NESP48681 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC54.48■■■■■ 6.31
NESP48681 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC54.45■■■■■ 6.31
NESP48681 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC54.4■■■■■ 6.3
NESP48681 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC54.37■■■■■ 6.29
NESP48681 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC54.27■■■■■ 6.28
NESP48681 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.26■■■■■ 6.28
NESP48681 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC54.26■■■■■ 6.28
NESP48681 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC54.19■■■■■ 6.27
NESP48681 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC54.19■■■■■ 6.26
NESP48681 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC54.18■■■■■ 6.26
NESP48681 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.16■■■■■ 6.26
NESP48681 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.16■■■■■ 6.26
NESP48681 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.04■■■■■ 6.24
NESP48681 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.85■■■■■ 6.21
NESP48681 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.84■■■■■ 6.21
NESP48681 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC53.79■■■■■ 6.2
NESP48681 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.7■■■■■ 6.19
NESP48681 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC53.66■■■■■ 6.18
NESP48681 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC53.65■■■■■ 6.18
NESP48681 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC53.6■■■■■ 6.17
NESP48681 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.6■■■■■ 6.17
NESP48681 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC53.56■■■■■ 6.16
NESP48681 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC53.56■■■■■ 6.16
NESP48681 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.5■■■■■ 6.15
NESP48681 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC53.5■■■■■ 6.15
NESP48681 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.43■■■■■ 6.14
NESP48681 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC53.42■■■■■ 6.14
NESP48681 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.41■■■■■ 6.14
NESP48681 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC53.38■■■■■ 6.14
NESP48681 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.36■■■■■ 6.13
NESP48681 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.29■■■■■ 6.12
NESP48681 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC53.24■■■■■ 6.11
NESP48681 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.24■■■■■ 6.11
NESP48681 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC53.23■■■■■ 6.11
NESP48681 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC53.23■■■■■ 6.11
NESP48681 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.21■■■■■ 6.11
NESP48681 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.21■■■■■ 6.11
NESP48681 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC53.16■■■■■ 6.1
NESP48681 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC53.13■■■■■ 6.1
NESP48681 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC53.12■■■■■ 6.09
NESP48681 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC53.09■■■■■ 6.09
NESP48681 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC53.09■■■■■ 6.09
NESP48681 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC53.08■■■■■ 6.09
NESP48681 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.06■■■■■ 6.09
NESP48681 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC53.06■■■■■ 6.09
NESP48681 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC52.99■■■■■ 6.07
NESP48681 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC52.99■■■■■ 6.07
NESP48681 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.95■■■■■ 6.07
NESP48681 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.9■■■■■ 6.06
NESP48681 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC52.9■■■■■ 6.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms