Protein–RNA interactions for Protein: P34931

HSPA1L, Heat shock 70 kDa protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA1LP34931 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC49.14■■■■■ 5.46
HSPA1LP34931 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.75■■■■■ 5.39
HSPA1LP34931 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC48.09■■■■■ 5.29
HSPA1LP34931 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
HSPA1LP34931 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
HSPA1LP34931 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
HSPA1LP34931 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
HSPA1LP34931 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.9■■■■■ 5.1
HSPA1LP34931 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC46.83■■■■■ 5.09
HSPA1LP34931 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
HSPA1LP34931 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
HSPA1LP34931 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
HSPA1LP34931 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.14■■■■■ 4.98
HSPA1LP34931 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
HSPA1LP34931 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC45.91■■■■■ 4.94
HSPA1LP34931 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
HSPA1LP34931 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
HSPA1LP34931 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
HSPA1LP34931 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC45.48■■■■■ 4.87
HSPA1LP34931 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC45.46■■■■■ 4.87
HSPA1LP34931 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
HSPA1LP34931 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
HSPA1LP34931 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
HSPA1LP34931 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
HSPA1LP34931 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC45.18■■■■■ 4.82
HSPA1LP34931 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.82
HSPA1LP34931 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
HSPA1LP34931 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
HSPA1LP34931 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC44.96■■■■■ 4.79
HSPA1LP34931 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
HSPA1LP34931 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
HSPA1LP34931 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
HSPA1LP34931 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
HSPA1LP34931 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
HSPA1LP34931 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
HSPA1LP34931 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
HSPA1LP34931 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
HSPA1LP34931 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
HSPA1LP34931 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
HSPA1LP34931 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
HSPA1LP34931 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.62
HSPA1LP34931 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
HSPA1LP34931 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.74■■■■■ 4.59
HSPA1LP34931 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
HSPA1LP34931 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
HSPA1LP34931 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
HSPA1LP34931 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC43.65■■■■■ 4.58
HSPA1LP34931 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC43.64■■■■■ 4.58
HSPA1LP34931 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
HSPA1LP34931 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
HSPA1LP34931 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
HSPA1LP34931 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
HSPA1LP34931 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
HSPA1LP34931 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
HSPA1LP34931 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
HSPA1LP34931 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
HSPA1LP34931 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
HSPA1LP34931 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
HSPA1LP34931 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
HSPA1LP34931 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
HSPA1LP34931 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
HSPA1LP34931 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
HSPA1LP34931 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.45
HSPA1LP34931 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
HSPA1LP34931 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
HSPA1LP34931 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
HSPA1LP34931 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
HSPA1LP34931 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
HSPA1LP34931 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
HSPA1LP34931 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
HSPA1LP34931 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
HSPA1LP34931 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
HSPA1LP34931 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
HSPA1LP34931 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
HSPA1LP34931 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
HSPA1LP34931 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
HSPA1LP34931 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
HSPA1LP34931 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
HSPA1LP34931 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
HSPA1LP34931 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
HSPA1LP34931 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
HSPA1LP34931 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC42.47■■■■■ 4.39
HSPA1LP34931 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
HSPA1LP34931 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
HSPA1LP34931 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
HSPA1LP34931 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
HSPA1LP34931 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
HSPA1LP34931 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
HSPA1LP34931 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
HSPA1LP34931 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
HSPA1LP34931 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
HSPA1LP34931 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
HSPA1LP34931 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
HSPA1LP34931 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
HSPA1LP34931 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
HSPA1LP34931 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
HSPA1LP34931 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
HSPA1LP34931 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
HSPA1LP34931 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
HSPA1LP34931 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms